ED Sciences Chimiques
Approches microfluidiques pour le tri et la caractérisation morpho-mécanique d'agrégats cellulaires
par Léon REMBOTTE (Centre de Recherche Paul Pascal)
Cette soutenance a lieu à 10h00 - Amphithéâtre Centre de Recherche Paul Pascal 115 avenue du Docteur Albert Schweitzer Pessac 33600
devant le jury composé de
- Jean-Christophe BARET - Professeur - Centre de Recherche Paul Pascal - CoDirecteur de these
- Charles BAROUD - Professeur - Ecole polytechnique - Rapporteur
- Pierre NASSOY - Directeur de recherche - Laboratoire Photonique, Numérique et Nanosciences - CoDirecteur de these
- Jean-François JOANNY - Professeur - Collège de France - Examinateur
- Claire WILHELM - Directrice de recherche - Institut Curie - Rapporteur
- Pierre JOSEPH - Directeur de recherche - LAAS-CNRS - Examinateur
- Diego BARESCH - Chargé de recherche - Institut de Mécanique et d'Ingénierie - Examinateur
- Cécile ZAKRI - Professeure - Centre de Recherche Paul Pascal - Examinateur
Les agrégats cellulaires, tels que les sphéroïdes et les organoïdes, sont de plus en plus utilisés en laboratoire pour répliquer les tissus biologiques. Comprenant typiquement quelques milliers de cellules, ils présentent un niveau de complexité intermédiaire entre les cultures cellulaires classiques et les modèles animaux, et offrent des perspectives prometteuses pour la recherche fondamentale et appliquée, notamment dans le domaine de la médecine personnalisée. Toutefois, leur utilisation reste limitée par une forte variabilité expérimentale et par le manque de méthodes d'analyse standardisées. Dans ce contexte, ce travail de thèse visait à développer des approches automatisées pour la caractérisation de grandes populations d'agrégats cellulaires. Dans un premier temps, j'ai adapté les principes de la cytométrie en flux au tri d'agrégats cellulaires basé sur l'analyse d'images en temps réel et l'encapsulation dans des gouttes millimétriques manipulées par force de radiation acoustique. Le cytomètre ainsi conçu est capable de mesurer des propriétés morphologiques et phénotypiques dans des populations de plusieurs centaines d'agrégats, et d'en isoler des sous-populations aux propriétés homogènes. Cette approche ouvre la voie à des protocoles de caractérisation plus reproductibles et statistiquement robustes pour l'étude des sphéroïdes et des organoïdes. J'ai ensuite étudié les mécanismes d'auto-organisation de cystes de cellules hiPSC. Ces agrégats sont constitués d'une monocouche cellulaire épithéliale sphérique enveloppant une cavité centrale appelée lumen, et sont considérés comme des modèles d'embryons au stade d'épiblastes. Ces échantillons fragiles ne pouvant être imagés sur de longues périodes, j'ai développé une méthode de cytométrie sur puce par imagerie confocale automatisée, permettant l'analyse de centaines de cystes à différents stades de croissance, de la formation du lumen à la stratification de l'épithélium. Cette approche a révélé des lois d'échelle de l'auto-organisation de cystes de hiPSC et mis en évidence les étapes clés de leur développement, interprétées dans une perspective géométrique et mécanique. Enfin, j'ai caractérisé les propriétés mécaniques des cystes par des expériences d'aspiration en micropipette, une technique historiquement dédiée aux cellules uniques et récemment adaptée aux agrégats multicellulaires. J'ai notamment étudié la rupture des cystes lors de déformations extrêmes et exploré la possibilité de transposer ces analyses vers une cytométrie de déformabilité à haut débit, afin de généraliser la mesure de leurs propriétés mécaniques. Dans cette thèse, j'ai ainsi introduit de nouvelles méthodes pour la manipulation et la caractérisation des agrégats multicellulaires, contribuant à la standardisation de leur étude à grande échelle.
Développement de fibres multimatériaux par Stack - and - Draw pour des applications en tant que capteur de gaz
par Mathieu BONNARDEL (ICMCB - Institut de Chimie de la Matière Condensée de Bordeaux)
Cette soutenance a lieu à h00 - Amphitéatre 87 Avenue du Dr Albert Schweitzer, 33600 Pessac
devant le jury composé de
- Angéline POULON - Maîtresse de conférences - Université de Bordeaux - Directeur de these
- Bruno BUREAU - Professeur des universités - Institut des Sciences Chimiques de Rennes - Rapporteur
- Frédéric SMEKTALA - Professeur des universités - Laboratoire Interdisciplinaire Carnot de Bourgogne - Rapporteur
- Thierry CARDINAL - Directeur de recherche - Institut Chimique de la Matière Condensée de Bordeaux - CoDirecteur de these
- Marcelo NALIN - Professeur des universités - Universidade Estadual Paulista (UNESP) - Examinateur
- Cyril AYMONIER - Professeur des universités - Institut Chimique de la Matière Condensée de Bordeaux - Examinateur
L'objectif de cette thèse est de concevoir une fibre multimatériaux capable de générer un microplasma dans l'air afin d'être utilisée pour l'analyse de gaz. L'originalité de la thèse réside dans l'intégration de deux électrodes métalliques au sein d'une gaine de verre présentant une forme ruban. Le procédé d'élaboration des fibres retenu est la technique de Stack – and – Draw (S&D). Ce procédé en deux étapes permet de contrôler finement l'architecture d'une préforme puis de la fibre après fibrage. La compréhension entre la relation procédé/microstructure et microstructure/propriétés électriques est au cœur de ce travail. Ces travaux s'attachent à approfondir la compréhension des mécanismes d'étirage thermique de verres silicates sodo-calciques et d'alliages d'aluminium dans le cas de fibre mono-électrode puis bi-électrodes. L'étude de la relation entre les paramètres d'étirage (température, vitesses d'alimentation et d'étirage) et l'architecture finale des fibres de verre rubans, a permis de mettre en évidence deux mécanismes de formation des fibres directement liés à la vitesse d'étirage. Via des équations analytiques propres à chacun des mécanismes, les dimensions finales de la fibre comme de l'électrode métallique peuvent être prédites en fonction des paramètres d'étirage choisis. Le choix d'un alliage d'aluminium 2xxx comme matériau d'électrode permet de limiter l'apparition de discontinuité et d'atteindre des longueurs de fibres multimatériaux bien supérieures à celles obtenues avec de l'aluminium pur. Les propriétés électriques des électrodes métalliques sont directement impactées par la microstructure et par la remise en solution des éléments d'ajout. Finalement, le procédé S&D et les paramètres d'étirage thermique permettent de contrôler précisément le positionnement coplanaire des deux électrodes engainées dans la matrice de verre. La valeur de l'espacement entre les électrodes conditionne la durée de vie de la fibre multimatériaux durant la décharge. Ces travaux montrent une protection de l'extrémité de chaque électrode in-situ durant la décharge par la formation d'une couche diélectrique agissant comme une barrière protectrice. La formation de cette couche permet d'augmenter significativement la durée d'émission du microplasma. De premiers tests réalisés avec des espèces hydrocarbonées (CN et CH) issues de la combustion d'hydrocarbures, ont validé l'utilisation de la fibre multimatériaux. Le microplasma a pu être analysé par spectroscopie optique d'émission afin d'identifier les espèces en présence.
ED Sciences et environnements
Etude de la synchronie spatiale dans la dynamique de populations de l'anguille européenne et apport de nouveaux outils pour soutenir l'avis scientifique
par Mathilde BENEZECH (EABX - Écosystèmes aquatiques et changements globaux)
Cette soutenance a lieu à 14h00 - Amphithéâtre INRAE, 50 Avenue de Verdun, 33610 Cestas
devant le jury composé de
- Hilaire DROUINEAU - Ingénieur de recherche - Université de Bordeaux - Directeur de these
- Stéphanie MAHEVAS - Directrice de recherche - IFREMER - Rapporteur
- Estibaliz DIAZ - Chercheuse senior - AZTI - Examinateur
- Clara ULRICH - Directrice de recherche - IFREMER - Rapporteur
- Jean-Christophe POGGIALE - Professeur - Université Aix-Marseille - Examinateur
L'anguille européenne (Anguilla anguilla) est un poisson catadrome dont la reproduction a lieu dans la mer des Sargasses et la croissance se déroule dans les eaux continentales d'Europe et d'Afrique du Nord. Cette espèce est en déclin depuis les années 1980, et aucun signe de reconstitution n'est observé à ce jour, malgré la mise en place de mesures de gestion. L'évaluation et la gestion de cette espèce font face à divers défis comme (i) sa large aire de distribution impliquant une multitude d'acteurs, (ii) son cycle de vie complexe qui est perturbé par différentes composantes du changement global, (iii) la variabilité spatiale de ses traits d'histoire de vie. Ce travail a pour objectif d'améliorer la compréhension de la dynamique spatiale de la population d'anguilles européennes en Europe au cours de sa phase continentale afin de renforcer l'expertise scientifique du stock, sur laquelle reposent sa gestion et sa conservation. Plus précisément, on cherche à étudier les variations spatio-temporelles de l'abondance et des traits d'histoire de vie de l'espèce, à la recherche de potentielle synchronie spatiale susceptible d'informer sur les causes de ces variations. Les évolutions de la distribution du recrutement et des biomasses en Europe sont étudiées avec des méthodes d'analyse de séries temporelles. Des analyses de corrélation sont menées entre des données biologiques (distribution spatiale, biomasses) et environnementales ou anthropiques. Un accroissement de la proportion de recrues qui arrivent dans les îles britanniques est identifié pour les années récentes. Pour les anguilles jaunes et argentées, des différences sont observées entre les régions les plus au sud et les plus au nord. Ces résultats suggèrent que des changements dans les courants océaniques pourraient modifier la dérive des larves à court terme, tandis que des variations dans les conditions océaniques pourraient affecter leur survie à long terme. Pour les anguilles jaunes et argentées, des corrélations entre la biomasse et la température ou des indices climatiques suggèrent l'influence de conditions environnementales. Dans un contexte de changement global, où le climat risque d'être perturbé, cela souligne les défis auxquels la conservation des anguilles sera confrontée. Cette analyse exploratoire est suivie par l'introduction de liens mécanistes entre les différents stades continentaux (civelles, anguilles jaunes et argentées, échappement) à travers le développement d'un modèle spatial de dynamique de populations à l'échelle des unités de gestion de l'espèce en France, en Espagne et au Portugal. Les spécificités de ce modèle sont (i) l'intégration de l'ensemble des stades continentaux à travers une approche mécaniste homogène, et (ii) l'emprise spatiale large (internationale) tout en conservant l'échelle spatiale utilisée dans la gestion permettant de considérer la variabilité spatiale des traits d'histoire de vie et des pressions anthropiques. Ce modèle constitue un outil préliminaire permettant d'intégrer de manière homogène la dimension spatiale dans l'étude de la dynamique de population et d'améliorer l'avis scientifique sur le stock. À l'échelle de la France, le développement de modèles de prédiction à court terme du recrutement, ainsi que leur comparaison dans une approche multicritère sont proposés afin de proposer un outil spécifique pour l'estimation de possibilités de capture civelles. L'ensemble des travaux menés montre la nécessité de poursuivre les efforts déjà initiés d'amélioration et d'homogénéisation de la collecte de données. Les contributions de cette étude reposent à la fois sur l'apport de nouveaux outils statistiques pour étudier la dynamique de la population de l'espèce et sur les informations fournies par l'utilisation de ces outils. Ce travail présente un outil homogène d'intégration spatiale à large échelle et constitue un travail préliminaire dans le but d'atteindre une évaluation spatiale de l'état de la population.
ED Sociétés, Politique, Santé Publique
Faire la monnaie. Production et appropriations des monnaies locales au Pays basque et à Bristol
par Mathilde FOIS DUCLERC (Centre Emile Durkheim)
Cette soutenance a lieu à 9h00 - Salle Copernic Sciences Po Bordeaux 11, Allée Ausone 33600 Pessac
devant le jury composé de
- Andy SMITH - Directeur de Recherche - Université de Bordeaux - Directeur de these
- Sylvie OLLITRAULT - Directrice de recherche - Université de Nanterre - Rapporteur
- Ève CHIAPELLO - Directrice d'études - École des hautes études en sciences sociales (EHESS) - Rapporteur
- Matthieu MONTALBAN - Maître de conférences - Université de Bordeaux - CoDirecteur de these
- Xabier ITÇAINA - Directeur de recherche - CNRS - Sciences Po Bordeaux - Examinateur
- Jérôme BLANC - Professeur des universités - Sciences Po Lyon - Examinateur
Les « monnaies locales » sont un type de monnaies alternatives associant défense de causes et instrument marchand. Dispositifs hybrides qui relèvent à la fois de l'action collective et de l'instrument monétaire, elles soulèvent une question centrale : lorsque l'organisation qui prétend émettre une monnaie n'a ni le statut d'une autorité publique ni l'expertise d'une entreprise spécialisée dans les services de paiement, à quoi tient l' « argenticité », c'est-à-dire le caractère monétaire d'un dispositif, sa qualité de moyen d'échange et la reconnaissance de sa valeur sur un territoire ou au sein d'un groupe social ? Cette question revient à interroger les conditions de possibilité de l'institutionnalisation de ces monnaies dans des contextes particuliers et à analyser leur insertion dans un ordre monétaire plus large. La démarche empirique repose sur une ethnographie de longue durée (2019-2023) au Pays basque, auprès de celles et ceux qui s'efforcent de « faire circuler » la monnaie et qui l'utilisent. Un point de vue comparatif est apporté par un second terrain en Angleterre, qui a permis de réaliser plus d'une vingtaine d'entretiens avec des responsables et des membres du Bristol Pound. La thèse rend compte du travail de construction des monnaies locales étudiées – travail de conception d'une infrastructure, travail militant d'enrôlement, travail politique de légitimation – et des appropriations – les usages et leurs significations – dont elles font l'objet. La première partie est composée d'un chapitre méthodologique, d'un chapitre théorique et d'un chapitre historique qui, ensemble, défendent la pertinence d'une sociologie politique des monnaies locales. La deuxième partie s'intéresse à la production des monnaies locales : la définition de leur sens politique, la mobilisation des membres, la conception technique d'une infrastructure, ainsi que leur légitimation. Après l'étude de la production, la troisième partie propose alors d'analyser les appropriations dont font l'objet les monnaies locales. Parce qu'ils charrient de multiples significations sociales et politiques, les usages des monnaies locales sont un cas intéressant à la fois pour saisir la politisation des comportements économiques et la différenciation sociale de l'argent. Cette partie croise l'étude des trajectoires des acteurs et les outils de la sociologie économique de l'argent pour faire le portrait de ces monnaies, au plus près des pratiques. En liant le « faire la monnaie » au sens de l'action collective de construction d'un instrument monétaire alternatif et de mobilisation autour de son utilisation, et le « faire la monnaie », qui renvoie au niveau le plus interactionnel de la pratique consistant à échanger un billet de banque contre une valeur équivalente en petites coupures ou en pièces, on parvient à nouer une sociologie politique de l'action collective et une sociologie économique des usages de l'argent. L'étude de la production et de la réception d'une monnaie locale montre ainsi que le caractère monétaire ou l'argenticité – moneyness – est le produit de processus d'institutionnalisation qui s'expriment à plusieurs niveaux : au niveau le plus macro, en termes d'insertion dans un ordre monétaire et de reconnaissance juridique ; au niveau méso, en termes de configurations organisationnelles, de rapports de force plus ou moins fluides structurant des alliances et des frontières entre mouvements, groupes sociaux et administrations publiques ; au niveau micro, en termes d'incorporation dans les usages de l'argent.