ED Entreprise Economie Société
Une analyse socio-territoriale des inégalités au Chili, en Colombie et au Mexique
par Thibaut PLASSOT SANSANS (BSE - Bordeaux sciences économiques)
Cette soutenance a lieu à 15h00 - Salle de thèse 16 avenue Léon Duguit Bât. H2 CS 50057 33608 Pessac
devant le jury composé de
- Matthieu CLEMENT - Professeur des universités - Université de Bordeaux - Directeur de these
- Eric ROUGIER - Professeur des universités - Université de Bordeaux - CoDirecteur de these
- François COMBARNOUS - Professeur des universités - Université de Bordeaux - Examinateur
- Eduardo ORTIZ-JUAREZ - Assistant professor - King's College London - Examinateur
- François ROUBAUD - Directeur de recherche - IRD / Université Paris-Dauphine - Rapporteur
- Vera CHIODI - Maîtresse de conférences - Université Sorbonne / IHEAL - Examinateur
- Oscar MARTíNEZ-MARTíNEZ - Full professor - University Iberoamericana-Mexico - Rapporteur
Cette thèse étudie, à travers quatre chapitres, la manière dont la position sociale et le territoire façonnent conjointement les inégalités, la mobilité sociale et l'inégalité des chances au Chili, en Colombie et au Mexique. Le chapitre 1 situe les classes sociales le long d'un gradient d'urbanité et montre que le territoire différencie surtout les extrémités de la distribution des revenus. Le chapitre 2 établit que, dans les territoires intermédiaires, les aspirations éducatives des parents pour leurs enfants sont presque universelles, alors que leurs attentes dépendent de leur situation sociale et du territoire. L'écart entre aspirations et attentes varie donc fortement selon les circonstances. Le chapitre 3 mesure dans un même cadre la mobilité sociale et l'inégalité des chances, et met en évidence le poids considérable des circonstances territoriales dans cette dernière. Le chapitre 4 montre qu'au Mexique l'accès à la classe moyenne est le plus probable pour les personnes ayant grandi autour de villes de 350 000 à un million d'habitants. Enfin, la conclusion croise origine sociale et territoire et montre que le territoire pèse davantage sur les personnes issues des milieux modestes et, réciproquement, que l'influence des circonstances familiales s'atténue dans les territoires les plus urbanisés.
ED Sciences de la Vie et de la Santé
Rôle des ostéocytes dans la réparation osseuse, modèles in vivo et in vitro
par Léa GELLEE (Bioingénierie tissulaire)
Cette soutenance a lieu à 14h00 - Amphithéâtre BBS 2 rue du Dr Hoffman Martinot 33000 Bordeaux Bâtiment Bordeaux Biologie Santé (BBS)
devant le jury composé de
- Aline BOZEC - Professeure des universités - University Erlangen-Nürnberg / Department of Rheumatology and Immunology - Rapporteur
- Stéphane PALLU - Professeur des universités - Université d'Orléans / Laboratoire Biologie, Bioingénierie et Bioimagerie Ostéo-Articulaires - Rapporteur
- Maude GERBAIX - Maîtresse assistante - Université de Genève / Département de médecine - Examinateur
- Frédéric VELARD - Ingénieur de recherche - Université de Reims Champagne-Ardenne / EA 4691 Biomatériaux et inflammation en site osseux - Examinateur
La régénération de lésions osseuses de grande taille constitue encore un défi majeur en clinique. Lorsque le volume de tissu à régénérer dépasse la capacité spontanée de réparation de l'os, des stratégies de comblement ou de reconstruction sont nécessaires, notamment par greffe osseuse. Les ostéocytes, désormais reconnus comme des acteurs majeurs de l'homéostasie osseuse, pourraient également participer à la réparation osseuse. Des travaux réalisés, ont mis en évidence des modifications de l'organisation du réseau ostéocytaire et de l'expression de molécules produites par ces cellules au voisinage des lésions. Cependant, leur contribution à la réparation de lésions osseuses de grande taille reste peu caractérisée. La localisation des ostéocytes au sein de la matrice minéralisée les expose directement aux modifications de leur microenvironnement au cours de la réparation osseuse. Cette thèse visait à déterminer comment les ostéocytes s'adaptent à ces modifications et quels facteurs modulent ces réponses. Pour caractériser ces adaptations, un modèle murin de défaut critique de calvaria a été utilisé. La lésion induit une réorganisation du réseau, associée à des modifications de la morphologie, de la survie des ostéocytes et de l'expression de protéines telles que Sema3A et la podoplanine. Ces adaptations varient notamment selon la distance au défaut et évoluent au cours de la réparation, soulignant une organisation spatiale et temporelle de la réponse ostéocytaire. Nous avons ensuite étudié trois facteurs susceptibles de moduler ces adaptations : le vieillissement, la présence d'un greffon osseux et la disponibilité en oxygène. Le vieillissement constitue un enjeu majeur dans un contexte de vieillissement global des populations, puisqu'il s'accompagne de transformations du tissu osseux susceptibles d'altérer sa capacité à répondre aux lésions. Dans notre modèle, il n'altère pas l'ensemble des réponses ostéocytaires induites par la lésion, mais certaines adaptations morphologiques et moléculaires du réseau apparaissent modifiées avec l'âge. La présence d'un greffon osseux peut modifier localement l'environnement cellulaire et matriciel de l'os hôte et influencer la réponse des ostéocytes. Des greffons cellulaires et acellulaires ont ainsi été comparés afin d'évaluer l'influence des cellules vivantes du greffon. Peu de différences ont toutefois été observées entre les conditions concernant la réparation osseuse, la minéralisation ou la réponse des ostéocytes de l'os hôte. Enfin, une faible disponibilité en oxygène constitue une composante importante du microenvironnement ostéocytaire, notamment en raison de leur localisation dans la matrice minéralisée et des modifications de la vascularisation au cours de la réparation. Une approche in vitro combinant analyses morphologiques, métaboliques et transcriptomiques a montré que différents niveaux d'oxygène modulent les profils transcriptionnels et métaboliques des ostéocytes. En revanche, les facteurs solubles produits par les ostéocytes n'ont pas entraîné de modification majeure de l'expression génique des cellules endothéliales. L'ensemble de ces travaux montre que le réseau ostéocytaire s'adapte aux modifications de son microenvironnement au cours de la réparation osseuse selon une organisation spatiale et temporelle. Ces adaptations dépendent du contexte biologique, soulignant l'importance de considérer les ostéocytes dans leur environnement tissulaire. Ces résultats invitent ainsi à dépasser une vision statique et homogène de la biologie ostéocytaire et à considérer les ostéocytes comme des cellules dont les fonctions s'inscrivent dans un environnement dynamique et complexe. De nouvelles approches permettant d'explorer cette complexité contribueront à mieux comprendre le rôle des ostéocytes dans la réparation osseuse.
Biomarqueurs tissulaires et moléculaires prédictifs de la réponse au traitement néoadjuvant dans les cancers du rectum
par Benjamin FERNANDEZ (BoRdeaux Institute of onCology)
Cette soutenance a lieu à 14h30 - Salle Vasco De Gamma Hôpital de Haut Léveque Bâtiment Magellan 1 1 Avenue Magellan 33600 Pessac
devant le jury composé de
- Samuel AMINTAS - Maître de conférences - praticien hospitalier - Université de Bordeaux / CHU de Bordeaux - Directeur de these
- Anais PUJALS - Professeure des universités - praticienne hospitalière - Université Paris-Est Créteil / APHP - Rapporteur
- Gilles MANCEAU - Professeur des universités - praticien hospitalier - Sorbonne Uiversité / APHP - Rapporteur
- Etienne BUSCAIL - Professeur des universités - praticien hospitalier - Université Paul Sabatier (Toulouse III) / CHU de Toulouse - Examinateur
- Caroline GRONNIER - Professeure des universités - praticienne hospitalière - Université de Bordeaux / CHU de Bordeaux - Examinateur
Le traitement du cancer du rectum est devenu de plus en plus individualisé, avec la diversification des stratégies néoadjuvantes et l'essor de la préservation d'organe. Dans notre centre, sur 25 ans, la morbidité postopératoire a nettement diminué alors que la survie à long terme est restée stable. Cette évolution rend crucial le choix du bon traitement pour chaque patient, ce qui suppose de prédire la réponse tumorale avant de traiter. Or les outils actuels, qu'ils soient radiologiques, endoscopiques ou biologiques, restent insuffisants lorsqu'ils sont utilisés isolément. Cette thèse recherche des biomarqueurs tissulaires prédictifs de la réponse au traitement néoadjuvant, par une démarche translationnelle qui part de la protéomique pour aller jusqu'à l'évaluation clinique. L'analyse protéomique de biopsies préthérapeutiques a conduit à étudier la voie CDH17/Wnt/β-caténine. Les expériences fonctionnelles ont confirmé que CDH17 régule cette voie, avec des effets dépendants du modèle et un signal exploratoire de radiosensibilisation. Dans une cohorte de 105 patients, l'expression nucléaire de la β-caténine sur la biopsie complète la taille tumorale. Leur association atteint une AUC de 0,823 avant tout traitement, comparable à celle d'un modèle intégrant l'IRM de réévaluation, et un score simple à deux critères répartit les patients de 82,5 % à 5,6 % de bons répondeurs. Une seconde approche protéomique a identifié la cytokératine 19 (KRT19) comme marqueur d'un état épithélial associé à la réponse. Ces résultats exploratoires appellent une validation externe. Une cohorte prospective puis un essai randomisé sont envisagés pour guider le choix du traitement avant la chirurgie et la décision entre préservation d'organe et chirurgie après traitement.
Modélisation des mécanismes de génération d'oscillations pathologiques et de la dynamique du réseau des ganglions de la base
par Elena NICOLLIN (Institut des Maladies Neurodégénératives)
Cette soutenance a lieu à 10h00 - Amphithéâtre Broca Centre Broca Nouvelle-Aquitaine 146 rue Léo Saignat 33076 Bordeaux Cedex
devant le jury composé de
- Catalina VICH - Professeur - Universitat de les Illes Baleares - Rapporteur
- Arvind KUMAR - Associate Professor - KTH Royal Institute of Technology - Rapporteur
- Benoît GIRARD - Directeur de recherche - CNRS / Sorbonne Université - Examinateur
- Jyotika BAHUGUNA - Chaire de professeur junior - Université de Strasbourg - Examinateur
La maladie de Parkinson se caractérise par une synchronisation oscillatoire excessive dans la bande bêta (13-30 Hz) au sein du réseau cortico-ganglions de la base-thalamique (CBGT). Bien que ces oscillations soient un signe distinctif de la maladie et soient corrélées aux symptômes moteurs, les mécanismes de circuit qui les génèrent restent mal compris. En outre, leurs propriétés varient considérablement selon les espèces et les méthodes d'enregistrement. On peut donc se demander si elles reflètent un processus physiopathologique unique ou plusieurs rythmes distincts issus de mécanismes différents. Cette thèse étudie ces mécanismes de génération et leurs différences entre espèces. La première partie est une revue des oscillations bêta chez les patients et dans les modèles parkinsoniens de singe et de rongeur. Elle s'appuie sur une réanalyse de jeux de données publiés, qui met en évidence des différences marquées entre espèces. Celles-ci portent sur la fréquence, la puissance et la distribution anatomique des oscillations bêta, ainsi que sur leur réponse aux manipulations de circuit. Une synchronisation en bas-bêta (≤ 15 Hz) caractérise les patients et les primates parkinsoniens, tandis que les rongeurs parkinsoniens expriment principalement une synchronisation en haut-bêta, également présente chez les patients mais non spécifique de l'état pathologique. Ces résultats s'opposent à l'idée d'un mécanisme unique. Ils suggèrent que la fréquence, la puissance et les relations de phase des oscillations bêta entre les populations du réseau CBGT constituent des signatures de leurs circuits générateurs. La deuxième partie teste cette hypothèse à l'aide de deux modèles du réseau CBGT contraints par des paramètres synaptiques et neuronaux spécifiques au rongeur ou au primate. Les boucles de rétroaction négative du réseau ont été étudiées comme générateurs potentiels : il s'agit de la boucle subthalamo-pallidale, deux boucles striato-pallidales, et la boucle formée par la voie hyperdirecte et le retour thalamique vers le cortex. La boucle subthalamo-pallidale oscille au-dessus de la bande bêta dans les deux espèces, tandis que les boucles striato-pallidales et hyperdirecte génèrent des oscillations en bas-bêta. Par ailleurs, chaque boucle produit un profil distinct de relations de phase entre populations, qui peut permettre d'identifier le générateur sous-jacent. La force relative des générateurs dans le réseau complet influe sur la présence ou non d'oscillations et sur les fréquences observées. Les relations de phase rapportées expérimentalement chez le rongeur correspondent à un générateur striato-pallidal. Dans le modèle de primate, les oscillations en bas-bêta ne persistent qu'en présence du retour thalamique ; ce résultat désigne la boucle hyperdirecte et fournit des prédictions de phase testables par de futurs enregistrements. Ces résultats suggèrent que les oscillations bêta pathologiques proviennent de mécanismes distincts chez les rongeurs et les primates. Enfin, la troisième partie porte sur les forces de connexion du réseau, peu contraintes par les données expérimentales. Une méthode d'inférence basée sur la simulation, appliquée au modèle de rongeur, estime les gains de connexion compatibles avec un jeu de données expérimental. Les données comprennent des enregistrements d'activité des neurones D2, subthalamiques, prototypiques et arkypallidaux en réponse à des stimulations optogénétiques des neurones D2, des neurones subthalamiques, ou des deux. Les distributions a posteriori inférées indiquent quelles connexions sont bien contraintes par ces réponses et lesquelles peuvent se compenser mutuellement. Dans l'ensemble, ce travail soutient la coexistence de plusieurs rythmes bêta propres à différents circuits dans le réseau CBGT. Il souligne aussi l'importance de contraintes spécifiques à chaque espèce pour relier les modèles aux données expérimentales.