Soutenances du 18-12-2024

ED Mathématiques et Informatique

• Développement d'une approche hybride ensembliste de sélection de variables pour l'élaboration d'un atlas de biomarqueurs de cancers

  par Elsa CLAUDE (LaBRI - Laboratoire Bordelais de Recherche en Informatique)

  Cette soutenance a lieu à 15h00 - Amphithéâtre E Université de Bordeaux, Bâtiment A29, cours de la Libération, 33405 Talence Cedex

  devant le jury composé de

  • Patricia THEBAULT - Professeure - Université de Bordeaux - Directeur de these
  • Emmanuelle BECKER - Professeure - Université de Rennes - Rapporteur
  • Arnaud DROIT - Professeur - Centre de Recherche du CHU de Québec - Université Laval - Directeur de these
  • Farida ZEHRAOUI - Maîtresse de conférences - Université d'Evry, Paris-Saclay - Rapporteur
  • François COSTE - Chargé de recherche - Université de Rennes - Examinateur
  • Raoul SANTIAGO - Professeur adjoint - Centre de Recherche du CHU de Québec - Université Laval - Examinateur

  Résumé

  La recherche biomédicale s'appuie sur les données omiques, telles que la transcriptomique, pour déchiffrer la complexité de maladies comme le cancer. Les méthodes traditionnelles d'identification des biomarqueurs transcriptomiques associés à un phénotype font appel à des techniques de sélection de variables. Les méthodes hybrides ensemblistes de sélection de variable (Hybrid Ensemble Feature Selection, HEFS) sont de plus en plus employées dans la dernière décennie pour leur capacité à garantir la robustesse des variables sélectionnées à travers des perturbations fonctionnelles et des données. Toutefois, leur conception reste un défi. Notre première contribution vise à évaluer la stratégie de type HEFS en analysant en détail 4 scénarios appliqués à l'identification de biomarqueurs dans divers cancers à partir de données de transcriptomique RNA-Seq. Ces scénarios explorent les combinaisons de deux méthodes de réduction des variables (gènes différentiellement exprimés et variance) avec deux stratégies de rééchantillonnage (repeated holdout par distribution équilibrée stratifiée et stratifiée aléatoire) pour la sélection de variable en aval de l'agrégation de signatures de milliers de modèles d'apprentissage machine enveloppés. Nos résultats soulignent les avantages de l'utilisation des approches HEFS pour identifier des biomarqueurs de maladies complexes, étant donné leur capacité à produire des résultats généralisables et stables. En outre, nous soulignons les considérations critiques essentielles pour la conception de telles stratégies. Notre deuxième contribution est le développement d'un atlas de signatures de biomarqueurs transcriptomiques de multiples cancers à des stades d'avancement variés. L'étude intégrée de cet atlas avec des données d'annotation biologique éprouvées (ex : REACTOME) doit permettre l'identification de gènes d'intérêt pour divers phénotypes oncologiques.

• Modélisation et rendu spectraux efficaces de matériaux iridescents : de la photonique à l'Informatique graphique

  par Gary FOURNEAU (LaBRI - Laboratoire Bordelais de Recherche en Informatique)

  Cette soutenance a lieu à 14h00 - Ada Lovelace Inria Bordeaux Sud-Ouest, 200 Avenue de la Vieille Tour, 33400 Talence

  devant le jury composé de

  • Xavier GRANIER - Professeur - Institut d'Optique Graduate School - Examinateur
  • Mathieu HéBERT - Professeur des universités - Hubert Curien laboratory (UJM, CNRS, IOGS) - Rapporteur
  • Adolpho MUñOZ - Associate Professor - Universidad de Zaragoza - Rapporteur
  • Doris GOMEZ - Chargée de recherche - CNRS - Examinateur

  Résumé

  Cette thèse traite de la modélisation et du rendu spectraux efficaces des matériaux iridescents, tels que les miroirs de Bragg et les cristaux liquides cholestériques (CLC), pour des applications en informatique graphique. Ces matériaux présentent une coloration structurelle vive due à leur périodicité nanostructurée, qui provoque des interactions complexes entre la lumière et la structure du matériau. Modéliser ces interactions avec précision est essentiel pour obtenir des rendus réalistes générés par ordinateur. Cependant, les détails spectraux fins impliqués sont Pour les miroirs de Bragg, constitués de couches diélectriques alternées, nous présentons un modèle basé sur la solution analytique de Pochi Yeh pour calculer la réflectance spectrale. Ce modèle capture avec précision les effets iridescents des miroirs de Bragg en se concentrant sur les bandes interdites photoniques qui définissent leurs régions de haute réflectivité. Afin de concilier précision physique et rendu en temps réel, nous avons développé une approximation simplifiée qui permet une intégration efficace dans des pipelines de rendu en RGB. De plus, nous avons intégré un modèle BRDF qui prend en compte la rugosité de surface et la diffusion selon le modèle microfacette, assurant que l'apparence des miroirs de Bragg reflète les imperfections réelles, telles que les interfaces stratifiées rugueuses. Les cristaux liquides cholestériques (CLC), qui reflètent sélectivement la lumière polarisée circulairement, présentent une complexité supplémentaire en raison de leur structure moléculaire hélicoïdale. Nous avons utilisé l'Approximation à deux ondes (TWA) pour modéliser la réflectance spectrale des CLC, fournissant un moyen efficace de simuler leurs propriétés optiques. Cette approche simplifie la représentation des interactions lumineuses au sein de la structure hélicoïdale, capturant les principales caractéristiques de réflectance responsables de leurs effets visuels uniques. En complément, nous avons développé un modèle BRDF pour les CLC, qui simule les imperfections au niveau des domaines notament que les variations dans l'orientation de l'axe optique, rendant le rendu de ces matériaux à la fois précis et réalisable en temps interactif. En conclusion, cette thèse introduit de nouveaux modèles spectraux pour les miroirs de Bragg et les CLC, à la fois précis et efficaces. Ces modèles facilitent le rendu des effets iridescents complexes dans des moteurs de rendu standard, permettant une interaction en temps réel et une exploration visuelle de ces matériaux. Nos contributions fournissent une base pour de futurs progrès dans la simulation réaliste des matériaux iridescents en infographie.

• Apprentissage profond pour la conversion d'IRM vers TDM en imagerie thoracique

  par Arthur LONGUEFOSSE (LaBRI - Laboratoire Bordelais de Recherche en Informatique)

  Cette soutenance a lieu à 14h00 - Amphi du LaBRI LaBRI, Domaine universitaire, 351, cours de la Libération, 33405 Talence

  devant le jury composé de

  • Pascal DESBARATS - Professeur des universités - LaBRI, Université de Bordeaux - Directeur de these
  • Fabien BALDACCI - Maître de conférences - LaBRI, Université de Bordeaux - CoDirecteur de these
  • Jenny BENOIS-PINEAU - Professeure des universités - LaBRI, Université de Bordeaux - Examinateur
  • Nicolas NORMAND - Professeur des universités - LS2N, Université de Nantes - Examinateur
  • Serge MIGUET - Professeur des universités - LIRIS, Unviersité Lumière Lyon 2 - Rapporteur
  • José María MARTINEZ SANCHEZ - Professeur - Université autonome de Madrid - Rapporteur

  Résumé

  L'imagerie thoracique présente des défis importants, chaque modalité d'imagerie ayant ses propres limitations. Le scanner (CT), référence en imagerie pulmonaire, offre une haute résolution spatiale, mais utilise des rayonnements ionisants, posant des risques pour les patients nécessitant des examens fréquents. À l'inverse, l'IRM pulmonaire offre une alternative sans radiation, mais est limitée par des problèmes techniques tels qu'un faible contraste et des artefacts, limitant son adoption clinique à grande échelle. Récemment, l'IRM à temps d'écho ultracourt (UTE-MRI) a montré un potentiel pour surmonter certaines de ces limitations, mais elle ne parvient toujours pas à atteindre la haute résolution et la qualité d'image du scanner, notamment pour l'évaluation détaillée des structures. L'objectif principal de cette thèse est de développer et valider des modèles basés sur l'apprentissage profond pour synthétiser des images de scanner TDM à partir d'IRM UTE. Plus précisément, nous visons à évaluer la qualité des images, la reconstruction anatomique et l'applicabilité clinique de ces images de synthèse par rapport aux IRM UTE originales et aux scanners CT correspondants. Dans un premier temps, nous avons exploré les bases de la synthèse d'images médicales, en établissant le socle pour la conversion de l'IRM vers le scanner. Nous avons mis en œuvre un modèle de GAN 2D basé sur le cadre pix2pixHD, optimisé avec la normalisation SPADE et affiné les techniques de prétraitement telles que le rééchantillonnage et l'enregistrement. L'évaluation clinique par des radiologues experts a montré des résultats prometteurs en comparant les images synthétiques aux scans réels. La synthèse a été ensuite améliorée par l'introduction de la perte perceptuelle, qui a affiné les détails structurels et la qualité visuelle, et par l'intégration de stratégies 2.5D pour équilibrer la synthèse 2D et 3D. De plus, nous avons mis l'accent sur un processus de validation rigoureux utilisant des métriques spécifiques à la tâche, remettant en question les métriques traditionnelles basées sur l'intensité et globales, en nous concentrant sur la reconstruction précise des structures anatomiques. Dans la dernière étape, nous avons développé un cadre de synthèse 3D robuste et évolutif en adaptant nnU-Net pour la génération de scanner, accompagné d'une fonction de perte priorisant les caractéristiques anatomiques, permettant une meilleure reconstruction des structures critiques telles que les voies respiratoires et les vaisseaux. Notre travail met en évidence le potentiel des modèles basés sur l'apprentissage profond pour générer des images synthétiques de haute qualité de type scanner à partir d'IRM UTE, offrant une amélioration significative de l'imagerie pulmonaire non invasive. Ces avancées pourraient considérablement améliorer l'applicabilité clinique de l'IRM UTE, en offrant une alternative plus sûre au scanner pour le suivi des maladies pulmonaires chroniques. De plus, un brevet est actuellement en préparation pour l'adoption de notre méthode, ouvrant la voie à une utilisation potentielle en milieu clinique.

• Estimées de Carleman L^p globales

  par Lotfi THABOUTI (IMB - Institut de Mathématiques de Bordeaux)

  Cette soutenance a lieu à 10h00 - Chaire UNESCO Lamsin Ecole Nationale d'Ingénieurs de Tunis, Rue Béchir Salem Belkhiria Campus universitaire, BP 37, 1002, Le Bélvédère, 1002, Tunis (Tunisie)

  devant le jury composé de

  • Sylvain ERVEDOZA - Directeur de recherche - Université de Bordeaux - Directeur de these
  • David DOS SANTOS FERREIRA - Professeur des universités - Institut Élie Cartan · Université de Lorraine - Rapporteur
  • Belhassen DEHMAN - Professeur des universités - Faculté des Sciences de Tunis - Directeur de these
  • Camille LAURENT - Directeur de recherche - Université de Reims Champagne Ardenne & CNRS - Rapporteur
  • Nabil GMATI - Professeur des universités - ENIT Tunis - Examinateur
  • Imen BHOURI - Professeure des universités - Faculté des Sciences de Monastir, Université de Monastir - Examinateur

  Résumé

  Dans cette thèse, on étudie des inégalités de Carleman $L^p$ pour des problèmes elliptiques et leurs applications à la quantification du prolongement unique par rapport aux perturbations du laplacien. On s'intéresse d'abord aux inégalités de Carleman $L^p$ sur une bande de $R^d$ $(dgeq 3)$, notée $mathcal{S}:= (0,1) imes R^{d-1}$, pour le Laplacien. Grâce à la transformée de Fourier et une factorisation de l'opérateur conjugué, nous réduisons la démonstration de ces inégalités à la construction d'une paramétrice pour le problème du Laplacien avec des conditions au bord. En utilisant cette paramétrice, on redémontre d'abord des inégalités classiques de Carleman $L^2$ pour le Laplacien. Ensuite, en appliquant des techniques d'analyse harmonique, notamment le théorème de restriction de Fourier pour établir des résultats de continuité de type $L^p-L^q$, on obtient des estimations $L^p - L^q$ sur cette paramétrice. On applique ensuite ces méthodes au cas qui nous intéresse, à savoir les inégalités de Carleman $L^p$ pour le Laplacien défini sur $Omega$, un ouvert borné et régulier de $R^d$ $(dgeq 3)$, avec un second membre $ f_2 + f_{2 *'} + div F$, $f_2 in L^2(Omega), , f_{2 *'} in L^{ frac{2d}{d+2}}(Omega), , F in L^2(Omega; C^{d}), $ et une condition de Dirichlet $g in H^{frac{1}{2}}(partial Omega)$. On montre deux estimations de Carleman globales : une sur la norme $H^1$ de la solution et une sur sa norme $L^{frac{2d}{d-2}}$, en termes de normes $L^2$ à poids de $f_2$ et $F$, de la norme $L^{frac{2d}{d+2}}$ de $f_{2 *'}$ et de la norme $H^{frac{1}{2}}$ de $g$. Cela nous permet, par exemple, d'obtenir une quantification du prolongement unique pour les solutions de $Delta u = V u + W_1 cdot abla u + div(W_2 u)$ en fonction des normes de $V$ dans $L^{q_0}(Omega)$, de $W_1$ dans $L^{q_1}(Omega)$ et de $W_2$ dans $L^{q_2}(Omega)$ pour $q_0 in (d/2, infty]$ et $q_1$ et $q_2$ satisfaisant soit $q_1, , q_2 > (3d-2)/2$ et $frac{1}{q_1} + frac{1}{q_2}< 4 (1-frac{1}{d})/(3d-2)$, soit $q_1, , q_2 > 3d/2$. Dans une troisième partie, on étudie une quantification du prolongement unique des solutions de l'équation $Delta u = V u + W_1 cdot abla u + div(W_2 u)$ mais avec des potentiels d'ordre un plus singuliers dans la classe limite d'intégrabilité. En particulier, on considère le cas $W_1 in L^{q_1}$ et $W_2 in L^{q_2}$, avec $q_1>d$ et $q_2 >d$. En utilisant le lemme de T. Wolff sur les mesures euclidiennes et une version raffinée des estimations de Carleman, on obtient des résultats de quantification du prolongement unique pour les solutions $u$ de $Delta u = V u + W_1 cdot abla u + div (W_2 u)$ en fonction des normes des potentiels.

ED Sciences Chimiques

• Agrégation in vitro de la protéine amyloïde Tau et étude de son impact sur des modèles membranaires par différentes méthodes biophysiques

  par Vicky URY (Institut de Chimie & de Biologie des Membranes & des Nano-objets)

  Cette soutenance a lieu à 13h00 - amphithéâtre IECB IECB, 2 rue Robert Escarpit, 33600 Pessac

  devant le jury composé de

  • Sophie LECOMTE - Directrice de recherche - Université de Bordeaux - Directeur de these
  • Sylvie NOINVILLE - Chargée de recherche - CNRS Paris - Rapporteur
  • Lorena REDONDO-MORATA - Chargée de recherche - INSERM Marseille - Rapporteur
  • Christine GRAUBY-HEYWANG - Professeure des universités - Université de Bordeaux - Examinateur
  • Jehan WAEYTENS - Assistant professor - Université Libre de Bruxelles - Examinateur
  • Michael MOLINARI - Professeur des universités - Université de Bordeaux - CoDirecteur de these

  Résumé

  Les maladies neurodégénératives, telles que la maladie d'Alzheimer et de Parkinson, affectent les fonctions cognitives et motrices. Elles se caractérisent par une perte progressive de neurones, sans possibilité de régénération. Avec le vieillissement de la population, ces pathologies, principalement liées à l'âge, représentent un enjeu sociétal majeur. L'absence de diagnostic précoce, de traitements efficaces et la méconnaissance des mécanismes en jeu soulignent la nécessité d'en approfondir la compréhension. Les patients atteints de ces maladies présentent des accumulations de protéines anormales sous forme d'agrégats insolubles, dans ou à proximité des cellules cérébrales. Bien que chaque protéinopathie présente des agrégats spécifiques, elles partagent des caractéristiques communes, notamment leur structure appelée amyloïde. Ces amyloïdes, formés par l'auto-assemblage de monomères protéiques mal conformés par empilement, adoptent une structure caractéristique dite en cross-β. Plusieurs protéines amyloïdes pathogènes ont été identifiées et sont associées à diverses maladies neurodégénératives. La protéine Tau, impliquée dans la maladie d'Alzheimer et plus largement dans un groupe de démences appelées tauopathies, est principalement localisée dans les neurones, où elle stabilise les microtubules, éléments structurants du cytosquelette cellulaire. Toutefois, dans des conditions pathologiques, Tau se dissocie des microtubules, devient hyperphosphorylée et forme des agrégats amyloïdes fibrillaires. Les mécanismes exacts de cette agrégation restent mal compris. L'étude de l'agrégation de Tau repose sur la production in vitro de fibres amyloïdes. En raison de sa solubilité élevée liée à sa charge positive, la formation de ces fibres nécessite l'ajout de molécules polyanioniques, appelées cofacteurs, telles que l'héparine (un polysaccharide), des ARN ou des lipides. Cependant, des incertitudes demeurent quant au rôle précis de ces cofacteurs : catalysent-ils simplement l'agrégation ou sont-ils intégrés dans la structure des fibres ? Si tel est le cas, quel impact cela a-t-il sur la morphologie des agrégats ? La capacité de Tau à s'agréger en présence de lipides suscite des interrogations sur son comportement vis à vis des différentes membranes des neurones. L'interaction de Tau avec les membranes plasmiques a été démontrée, et pourrait jouer un rôle tant dans des processus physiologiques que pathologiques. Tau, en présence de lipides anioniques, altère-t-elle l'intégrité membranaire ? Qu'en est-il des lipides non anioniques ? Pour répondre à ces questions, ce projet de thèse combine plusieurs approches biophysiques : spectroscopie infrarouge à réflexion totale atténuée (ATR-FTIR), microscopie à force atomique (AFM), microscopie électronique à transmission (MET) et résonance plasmonique de surface par ondes guidées (PWR). L'étude est structurée autour de deux axes principaux : (i) caractériser l'agrégation de Tau en présence de différents cofacteurs anioniques (héparine, ARN, phospholipides) et étudier l'impact sur la morphologie des fibres ; (ii) évaluer l'effet de l'interaction de Tau avec des membranes lipidiques de différentes compositions sur leur intégrité. Les résultats de cette thèse apportent de nouvelles perspectives sur les mécanismes pathogéniques de Tau et pourraient contribuer à une meilleure compréhension des tauopathies, ainsi qu'au développement de stratégies thérapeutiques.

• Développement d'une méthodologie de criblage à haut débit pour les conducteurs ioniques solides du lithium

  par William BERTHOU (ICMCB - Institut de Chimie de la Matière Condensée de Bordeaux)

  Cette soutenance a lieu à 14h00 - Amphithéâtre de l'ICMCB 87 Avenue du Dr Albert Schweitzer, 33600 Pessac

  devant le jury composé de

  • Frédéric LE CRAS - Cadre scientifique des EPIC - Université Grenoble Alpes - Directeur de these
  • Vincent MOTTO-ROS - Professeur associé - Université Claude Bernard Lyon 1 - Examinateur
  • Christian JORDY - Cadre scientifique - SAFT, TOTAL Group - Examinateur
  • Dany CARLIER-LARREGARAY - Professeure - Institut de Chimie de la Matière Condensée de Bordeaux, CNRS, Université de Bordeaux, Bordeaux INP - CoDirecteur de these
  • Thierry BROUSSE - Professeur - Institut des Matériaux Jean Rouxel de Nantes - Rapporteur
  • Mickael DOLLE - Professeur - Université de Montréal - Rapporteur
  • Cyril AYMONIER - Directeur de recherche - Institut de Chimie de la Matière Condensée - Examinateur

  Résumé

  Le développement de nouveaux matériaux pour accumulateurs électrochimiques et l'amélioration de leurs propriétés sont motivés par une quête incessante visant la réalisation de batteries plus sûres, plus compactes, plus respectueuses de l'environnement et si possibles moins coûteuses. La recherche dans ce domaine procède très majoritairement d'une démarche essai-erreur itérative, qui dès lors qu'il s'agit d'explorer des systèmes de compositions multi-élémentaires de plus en plus complexes, s'avère lente et limitée. Une démarche alternative, appelée ‘criblage à haut débit', permet d'accélérer l'identification de nouveaux composés. Elle est basée sur la préparation rapide d'une grande quantité d'échantillons par chimie combinatoire et leur caractérisation physico-chimique et fonctionnelle suivant des protocoles rapides et automatisés. L'objectif de cette thèse a été de développer une telle démarche pour l'étude des matériaux conducteurs ioniques du lithium. La co-pulvérisation cathodique magnétron a été choisie pour réaliser la synthèse combinatoire des bibliothèques de ces matériaux en couches mince sur wafer. Différentes techniques ont été développées pour caractériser ces ensembles de matériaux du point de vue dimensionnel, chimique, structural et des propriétés de transport ionique. Un développement particulier a été mené autour d'une technique d'analyse chimique innovante dans le domaine des couches minces : la spectroscopie de plasma induit par laser ou LIBS. La démarche a été développée en prenant comme premier cas d'étude les composés amorphes LixPOyNz, classiquement synthétisés par pulvérisation cathodique. Une fois établie, elle a permis de réaliser l'étude des systèmes LiPO(N), puis LiSiPO(N) sur des domaines de composition étendus. Ce travail a permis d'établir des corrélations entre composition - structure - les propriétés électriques ou mécaniques, sur des systèmes étudiés jusque-là de manière parcellaire. Enfin, une brève étude du système Li-Al-Ti-Si-P-O a permis de réaliser une première incursion dans le domaine des matériaux cristallins et vitro-céramiques et de mettre en œuvre la diffraction des rayons X comme méthode de caractérisation structurale à haut débit sur ces bibliothèques de matériaux en couche mince.

• Structuration des propriétés électriques d'une surface vitreuse appliquée au contrôle de l'orientation d'une mésophase nématique

  par Alexis MAILLARD (Institut des Sciences Moléculaires)

  Cette soutenance a lieu à 15h00 - Salle de réunion 3ème EST Institut des Sciences Moléculaires Bâtiment A12, 351 Cours de la Libération 33405 Talence Cedex

  devant le jury composé de

  • Marc DUSSAUZE - Directeur de recherche - Université de Bordeaux - Directeur de these
  • Andréa PIARRISTEGUY - Professeure des universités - Université de Montpellier - Rapporteur
  • Jean-René DUCLERE - Professeur des universités - Université de Limoges - Rapporteur
  • Alice BERTHELOT - Maîtresse de conférences - Université Claude Bernard Lyon 1 - Examinateur
  • Younès MESSADEQ - Professeur des universités - Université Laval - Examinateur
  • Tigran GALSTIAN - Professeur des universités - Université Laval - Directeur de these

  Résumé

  Les travaux de cette thèse se sont axés sur le développement d'un système photonique hybride regroupant un nouveau matériau vitreux possédant une fonction électrique de surface et une mésophase nématique de cristaux liquides. Principal élément du système hybride, le matériau fonctionnalisé est un verre commercial sodo-calcique dont le potentiel électrique de surface est structuré via un traitement de poling thermoélectrique assisté par plasma. Dans un second temps, le substrat vitreux à la fonction électrique structurée spatialement est utilisé dans la conception d'un système photonique simple, une cellule à cristal liquide. Ces cellules sont conçues de manière à pouvoir observer l'alignement induit par le verre polé sur les molécules. À ce stade, l'objectif est de mieux comprendre l'origine de l'alignement des cristaux liquides sur les verres polés, ceci passe par une caractérisation multimodale du système hybride qui se décompose en deux axes principaux : • L'étude de la structure et des propriétés électriques de surface du verre fonctionnalisé • L'étude de l'organisation et de la dynamique des molécules au contact du substrat polarisé Le premier axe est réalisé en menant une analyse spectroscopique poussée sur le substratfonctionalisé. Des techniques de microscopie en génération de second harmonique polarisée, microscopie Raman polarisée et une analyse de composition par microsonde électronique permettent d'établir un lien clair entre la fonction électrique du matériau et sa structure atomique. Le deuxième axe sur l'organisation des molécules est réalisé en utilisant des techniques de microscopie en lumière polarisée et de spectroscopie Raman polarisée permettant de mesurer l'orientation des molécules. De plus, l'application d'un modèle de distribution d'orientation permet de comparer l'alignement moléculaire entre les échantillons mais aussi avec une cellule de référence à alignement planaire. Les premiers travaux effectués dans la thèse ont visé à reproduire des résultats obtenus précédemment sur des systèmes similaires, puis à augmenter la taille des structures obtenues lors de la mise en contact des cristaux liquides avec le substrat. Dans ce cadre le verre a été traité avec une électrode sous forme de grille microstructurée. Les résultats montrent que la fonction électrique obtenue est contrôlable en position et en orientation. Les cristaux liquides s'alignent suivant la fonction électrique en formant des motifs triangulaires avec un degré d'alignement similaire pour des tailles de motifs variant d'un ordre de grandeur. Dans un deuxième temps, l'étude de la structure du verre polé montre un lien fort entre l'apparition d'une charge d'espace planaire et la production de plasma pendant le traitement. L'origine de la charge d'espace est d'ailleurs discutée sur la base des mesures Raman. Finalement, la conception de cellule dynamiques In-plane-Switching (IPS) permet de caractériser la dynamique de réalignement des cristaux liquides et par comparaison avec une cellule de référence fabriquée à partir de substrats commerciaux de quantifier l'énergie d'ancrage des cristaux liquides sur la surface de verre polarisée.

• Comportement et modélisation du système CMC/EBC sous sollicitations thermochimiques et mécaniques des moteurs aéronautiques

  par Lallie QUEMERAS (Laboratoire des Composites ThermoStructuraux)

  Cette soutenance a lieu à 14h00 - Amphithéâtre LCTS – 3, Allée La Boétie – Domaine Universitaire – 33600 PESSAC – France

  devant le jury composé de

  • Francis REBILLAT - Professeur des universités - Université de Bordeaux - Directeur de these
  • Vincent MAUREL - Directeur de recherche - Centre des matériaux - Rapporteur
  • Guillaume COUéGNAT - Ingénieur de recherche - LCTS - CoDirecteur de these
  • Thomas VANDELLOS - Docteur - Safran Ceramics - CoDirecteur de these
  • Benoit PANICAUD - Professeur des universités - Université de Technologie de Troyes - Rapporteur
  • Clara DESGRANGES - Ingénieure de recherche - CEA Paris Saclay - Examinateur
  • Daniel MONCEAU - Directeur de recherche - CIRIMAT - Examinateur

  Résumé

  L'aéronautique est actuellement confrontée à différentes problématiques environnementales et sociétales. Afin de répondre à ces problématiques et permettre notamment de réduire la production des gaz à effet de serre, de nouveaux matériaux sont envisagés pour remplacer les superalliages métalliques actuellement présents dans les moteurs. Dans cette optique, les Composites à Matrice Céramique (CMC) ont montré leur potentiel en tant que remplaçant de ces alliages : leurs propriétés mécaniques à haute température permettent d'augmenter la température atteinte dans les moteurs et ainsi réduire la consommation de carburant. Cependant, à haute température, ces pièces composites subissent une récession de surface importante par réaction avec la vapeur d'eau présente dans l'enceinte du moteur. Cette récession réduit leur durée de vie. Pour les protéger, une barrière environnementale (EBC) est déposée à leur surface. Pendant les cycles thermiques des moteurs, de nombreux mécanismes physicochimiques et thermomécaniques peuvent endommager le revêtement. Ces travaux de thèse se concentrent sur deux principaux types d'endommagement : l'endommagement par oxydation/corrosion de la sous-couche d'accroche et les contraintes thermomécaniques à travers ce système multicouche : sous-couche/TGO/EBC. Le système étudié est un CMC SiCf/SiCm revêtu successivement par une sous-couche d'accroche en silicium et un revêtement en disilicate d'yttrium. A haute température et sous atmosphère oxydante, le silicium s'oxyde en formant une couche de silice sous l'EBC. Des tests d'oxydation/corrosion (sous air humide) ont été menés à différentes conditions environnementales sur des échantillons de silicium polis et sur des échantillons revêtus pour caractériser l'effet de la rugosité d'interface et l'efficacité du revêtement sur les cinétiques d'oxydation et l'endommagement du système. Les observations morphologiques et les données de diffusion sont ensuite utilisées dans une modélisation par éléments finis (EF) pour prévoir le comportement et du système CMC/EBC en fonction du temps, de la température et de l'environnement moteur. Cette modélisation s'appuie sur un champ de phase pour décrire l'évolution physicochimique du système avec l'avancement de l'interface Si/TGO au cours du temps en fonction des conditions environnementales.

• Comprendre les mélanges de polymères pour leur utilisation comme conducteurs mixtes d'ions et d'électrons

  par Yasmina AL YAMAN (Laboratoire de Chimie des Polymères Organiques)

  Cette soutenance a lieu à 13h30 - Amphi. B5 B5, All. Geiffroy Saint-Hilaire, 33600 Pessac

  devant le jury composé de

  • Cyril BROCHON - Professeur - Université de Bordeaux - Directeur de these
  • David MECERREYES - Professeur - University of the Basque Country - Rapporteur
  • Natalie STINGELIN - Professeure - Georgia Institute of Technology - CoDirecteur de these
  • Laure BINIEK - Chargée de recherche - Université de Strasbourg - Rapporteur
  • Laurence VIGNAU - Professeur - Bordeaux INP - Examinateur
  • Laurent RUBATAT - Maître de conférences - Université de Pau et des Pays de l'Adour - Examinateur

  Résumé

  L'intégration de la biologie et de l'électronique pour des applications telles que les dispositifs médicaux implantables et les électroniques portables repose sur les transistors organiques électrochimiques (OECT). Cependant, les performances des OECT sont souvent limitées par un transport inefficace des ions. Cette étude visait à améliorer les performances des OECT en augmentant l'hydrophilicité par le biais de mélanges de polymères. Les défis initiaux rencontrés avec les polymères hydrophiles nouvellement synthétisés, tels que des problèmes de solubilité et un comportement de dopage médiocre, ont conduit à explorer les mélanges du polymère hydrophobe poly(3-hexylthiophene) (P3HT) avec des composants hydrophiles tels que P3HT-b-PEO et l'oxyde de polyéthylène (PEO). Bien que le P3HT seul ait montré des performances limitées, le mélange avec P3HT-b-PEO ou PEO a permis un comportement de transistor clair. Il est à noter que le P3HT dans le copolymère agit comme un compatibilisant, améliorant la stabilité du mélange et les performances des dispositifs par rapport au PEO seul. Les mélanges de P3HT de poids moléculaire plus élevé ont montré une meilleure stabilité et une réponse plus rapide, probablement en raison de l'augmentation de l'entrelacement des polymères. Lors de l'application de cette approche au polymère rigide PDPP2T-TT-OD, les deux types de mélanges (avec P3HT-b-PEO ou PEO) ont démontré des résultats de stabilité similaires. Cela suggère que l'épine dorsale rigide du PDPP2T-TT-OD limite la compatibilité et affecte la stabilité des deux types de mélanges. Globalement, cette recherche met en évidence l'efficacité du mélange de polymères pour optimiser les performances des OECT, offrant une voie viable pour le développement de dispositifs électroniques bio-interfacés avancés.

• Polymersomes Janus : conception rationnelle, préparation et fonctionnalisation asymétrique pour le développement de systèmes auto-propulsés de délivrance ciblée de médicaments

  par Eloïse EQUY (Laboratoire de Chimie des Polymères Organiques)

  Cette soutenance a lieu à 13h30 - Amphi 1 Ecole Nationale Supérieure de Matériaux, d'Agroalimentaire et de Chimie, ENSMAC (ex ENSCBP) 16 Avenue Pey-Berland 33607 Pessac Cedex France

  devant le jury composé de

  • Sébastien LECOMMANDOUX - Professeur des universités - LCPO, Université de Bordeaux - Directeur de these
  • Min-Hui LI - Directeur de recherche - Institut de Recherche de Chimie Paris (IRCP) - Rapporteur
  • Christophe TRIBET - Directeur de recherche - ENS – Département de chimie - Rapporteur
  • Katharina LANDFESTER - Professeur des universités - Max Planck Institute for Polymer Research - Examinateur
  • Chrystel FAURE - Professeur des universités - CBMN, Université de Bordeaux - Examinateur

  Résumé

  Mimer les propriétés des cellules vivantes dans des protocellules artificielles suscite un intérêt considérable, notamment pour reproduire la motilité et le mouvement directionnel dans des applications de thérapies « intelligentes ». En raison de leur morphologie vésiculaire et stabilité, les polymersomes présentent un grand potentiel pour la délivrance de médicaments, et l'introduction d'une asymétrie est essentielle pour permettre leur auto-propulsion. Bien que plusieurs approches, telles que la séparation de phase au sein de la membrane, aient été utilisées pour créer des polymersomes asymétriques, le choix des polymères appropriés reste un défi. Cette thèse de doctorat vise à concevoir des polymersomes asymétriques, de type Janus, capables de s'auto-propulser grâce à la décomposition enzymatique du glucose. Nous décrivons le développement de vésicules géantes unilamellaires de type Janus (JGUVs) par séparation de phase au sein de la membrane de deux copolymères à blocs distincts composés de blocs hydrophobes chimiquement incompatibles. En utilisant la théorie de Flory-Huggins, nous démontrons que les copolymères peuvent être rationnellement sélectionnés et conçus pour s'auto-assembler en polymersomes asymétriques, avec une séparation de phase modulable selon des paramètres tels que la composition, la masse molaire et la température. Notre méthode prédictive s'est avérée efficace pour les techniques d'auto-assemblage avec et sans solvant, permettant l'élaboration de diagrammes de phase génériques corrélant l'énergie libre de mélange à la morphologie des polymersomes, fournissant ainsi des indications clés pour la conception de JGUVs. Nous montrons également que la présence de solvant lors de la formation des vésicules permet d'étendre la gamme des polymères incompatibles pouvant être utilisés. De plus, nous avons réussi à contrôler, grâce à l'extrusion, la taille des vésicules tout en préservant leur morphologie Janus et avons montré que les JGUVs ainsi obtenus pouvaient être stables pendant plusieurs mois. Enfin, nous avons fonctionnalisé asymétriquement les JGUVs avec l'enzyme glucose oxydase par chimie click, et une étude préliminaire sur leur dynamique en présence de glucose est présentée, fournissant des indications pour leur utilisation comme micromoteurs.

ED Droit

• Les mutations du droit de la filiation

  par Marion DAMY (CENTRE EUROPÉEN DE RECHERCHES EN DROIT DES FAMILLES, DES ASSURANCES, DES PERSONNES ET DE LA SANTÉ)

  Cette soutenance a lieu à 14h30 - des thèses Bâtiment C, 16 avenue Léon Duguit, CS 50057, 33608 Pessac cedex

  devant le jury composé de

  • Adeline GOUTTENOIRE - Professeure des universités - Université de Bordeaux - Directeur de these
  • Pascale DEUMIER - Professeure des universités - Université Jean Moulin Lyon III - Rapporteur
  • Jérémy HOUSSIER - Professeur des universités - Université de Reims Champagne-Ardenne - Rapporteur
  • Hugues FULCHIRON - Professeur des universités - Université Jean Moulin Lyon III - Examinateur
  • Marie LAMARCHE - Professeure des universités - Université de Bordeaux - Examinateur

  Résumé

  Avant même la loi de ratification de 2009, réformant l'ordonnance relative à la filiation en 2005, la matière semblait déjà devoir affronter de nouveaux défis. L'évolution des progrès techniques et scientifiques ainsi que la diffusion des droits fondamentaux perturbent, en effet, les équilibres entre les enjeux collectifs et individuels inhérents à l'encadrement des relations familiales. Davantage tournées vers l'individu, ces influences conjuguées densifient la subjectivisation décrite par le doyen Carbonnier. Partant du constat que ce phénomène a franchi une nouvelle étape depuis la libéralisation du mariage en 2013, cette étude a vocation à étudier les mutations à l'œuvre en droit de la filiation qui en découlent. Il en ressort que le modèle hétéronormé s'estompe progressivement, la libéralisation de la matière induisant, plus discrètement, la personnalisation de son application. En droit de la filiation, le phénomène de subjectivisation se manifeste, dès lors, en amont, mais également en aval de la loi. Au stade de l'élaboration, le contenu de la loi peine à poser des limites quand, au stade de l'application, la limite opposée à la volonté individuelle doit désormais être plus concrète et justifiée. En conséquence, le contrôle du domaine se déplace en faveur du juge, au plus près des situations d'espèce.

• Collecte de preuve et enquête étatique à l'ère de l'écosystème « Police, services de renseignement, corporations privées ». À la recherche d'une protection des droits fondamentaux de la personne

  par Claudiu POPA (INSTITUT DE SCIENCES CRIMINELLES ET DE LA JUSTICE)

  Cette soutenance a lieu à 9h00 - Salle A9-162 Faculté de droit de l'Université de Sherbrooke, bâtiment A9, 2500 Bd de l'Université, Sherbrooke, Québec, J1K 2R1, Canada.

  devant le jury composé de

  • Olivier DECIMA - Professeur des universités - Université de Bordeaux - Directeur de these
  • Arthur OULAÏ - Professeur des universités - Université de Sherbrooke - Directeur de these
  • Charlotte CLAVERIE-ROUSSET - Professeure des universités - Université de Bordeaux - Examinateur
  • Alexandre STYLIOS - Professeur des universités - Université Laval - Examinateur
  • Édouard VERNY - Professeur des universités - Université Paris-Panthéon-Assas - Rapporteur
  • Vincent GAUTRAIS - Professeur des universités - Université de Montréal - Rapporteur

  Résumé

  Le dopage numérique des enquêtes policières dans les 20 dernières années semble être suralimentée par la collecte de preuve effectuée dans le cadre de l'émergence d'une symbiose technojuridique. Cette symbiose est épaulée par le droit civil contractuel, par les lois de protection des renseignements personnels qui semblent offrir plutôt des cadres de communication de la preuve et non pas de sa limitation, par les corporations privées qui sont de plus en plus participantes aux enquêtes criminelles et pénales de l'État, par l'utilisation en preuve de données à caractère personnel dont le consentement à l'origine de leur obtention soulève de sérieux questionnements quant à son caractère libre et éclairé, obtenue par voie contractuelle parfois dans des contextes de contrainte ou nécessité, ainsi que par la participation de plus en plus fréquente des services de renseignement à l'enquête policière et par l'usage d'ententes internationales de partage de renseignements. Face à cette montrée dans les pouvoirs étatiques et leurs outils d'enquête, les droits fondamentaux de l'individu sont mis à l'épreuve. C'est dans ce contexte, à l'ère du numérique et de la technologie omniprésente, que la présente thèse est à la recherche d'une protection corrélative des droits fondamentaux pour l'individu.

ED Sciences de la Vie et de la Santé

• Développement de baies entières de Pinot Noir sur différents Climats de Bourgogne sous le prisme de leur métabolisme.

  par Antoine LAPORTE (BFP - Biologie du Fruit et Pathologie)

  Cette soutenance a lieu à 9h00 - Amphithéâtre Colette & Josy Bové INRAE Bordeaux-Aquitaine Campus de la Grande-Ferrade 71 Avenue Edouard Bourlaux 33140 Villenave-d'Ornon

  devant le jury composé de

  • Marielle ADRIAN - Professeure - Université de Bourgogne - Rapporteur
  • Charles ROMIEU - Chargé de recherche - Université de Montpellier - Rapporteur
  • Anne GOELZER - Ingénieure de recherche - Université de Toulouse - Examinateur
  • Éric GOMèS - Professeur - Université de Bordeaux - Examinateur

  Résumé

  Le raisin de cuve a une importance économique majeure en France et l'étude de son développement est d'un intérêt grandissant face aux aléas climatiques de plus en plus forts et fréquents. La Bourgogne n'échappe pas à cette réalité et l'étude du Pinot Noir, cépage rouge endé- mique, dans son environnement face aux spécificités régionales que sont notamment les Climats, apparaît donc comme un sujet d'étude incontournable. Nous avons donc étudié le développement du Pinot Noir durant deux années consécutives marquées par des températures supérieures aux normes de saison et une excellente qualité sanitaire de la vendange en Bourgogne. Des prélè- vements ont eu lieu à intervalles réguliers sur cinq parcelles de production, depuis la nouaison jusqu'aux vendanges. De nombreux facteurs influençant le développement du raisin ont été rele- vés, tels que les porte-greffes, les parcelles, les conditions météorologiques ainsi que l'exposition au soleil, la position des baies sur la grappe, leur masse et leur taille. Nous avons mesuré les principaux composants de la biomasse qui ont expliqués jusqu'à 80% de la masse sèche de la baie et les avons analysés sous le prisme de ces différents facteurs. Nous avons pu déterminer un ordre et une intensité de l'impact de ces derniers sur le développement des baies et leurs composés : l'effet du millésime est omniprésent durant tout le développement et sur la quasi totalité des composés et son impact est particulièrement fort quant à la concentration en tartrate, plus de 2,5 fois plus élevée en 2022 qu'en 2023 pour atteindre environ 270 mg.gMS-1. Nous en avons conclu que cette accumulation plus forte était due au stress hydrique subit par la vigne avant et pendant la croissance verte des baies, témoignant de l'importance de la pré-saison sur les caractéristiques technologiques de la vendange. L'effet millésime s'atténue cependant en fin de croissance lorsque les baies sont à maturité. Nous avançons également que la parcelle possède un rôle lié notamment au cycle azoté, particulièrement en début et en fin de développement. Enfin, les porte-greffes, conjointement aux parcelles, vont jouer un rôle majeur dans l'accumulation de sucres dans les baies et c'est la vigueur conférée à la vigne par le matériel végétal qui déterminera l'ordre de véraison des parcelles. Pour plus de précision concernant certains facteurs d'intérêt pour la vinification nous avons déterminé la concentration de 33 polyphénols. Cela nous a permis d'identifier une plus grande quantité d'acides accompagnée d'une accumulation plus précoce d'anthocyanes en 2022 et une plus grande quantité de monomères de catéchines en 2023. L'acquisition de données de trans- criptomiques et leur intégration sont allées de pair avec les observations précédentes. Finalement, selon toutes les métriques utilisées, c'est la séquence développementale qui ex- plique systématiquement la variabilité la plus forte avec une synchronisation perceptible des observations des deux ou trois derniers stades de prélèvement selon la nature des données utili- sées. Enfin, grâce à un modèle linéaire généralisé nous avons pu prédire les facteurs parcellaires avec une plus grande précision en 2022 qu'en 2023, indiquant que le stress hydrique forçait proba- blement l'expression du terroir. Les stades de développement ont en revanche été prédit avec plus de précision sur le jeu de données 2023, témoignant d'un développement presque schématique des baies en conditions peu ou non stressantes et un impact très peu prédictible des parcelles ou du matériel végétal en l'absence de stress perçu. Il serait désormais intéressant d'intégrer ces données dans un modèle du métabolisme à l'échelle du génome reconstruit à cet effet, afin d'étudier plus précisément les variations de flux de carbone pouvant expliquer ces différentes observations.

• Rôle des Hématopoïèses clonales de potentiel indéterminé (CHIP) dans la physiopathologie des maladies cardiovasculaires

  par Mélody DUFOSSEE (Biologie des maladies cardiovasculaires)

  Cette soutenance a lieu à 14h00 - salle de conférence INSERM UMR1034 "Biologie des Maladies Cardiovasculaires" 1 avenue Magellan 33600 Pessac

  devant le jury composé de

  • Marie-Antoinette SEVESTRE-PIETRI - Professeure des universités - praticienne hospitalière - Université de Picardie Jules Verne - Rapporteur
  • Hafid AIT-OUFELLA - Professeur des universités - praticien hospitalier - Université Paris Cité - Rapporteur
  • Pierre HIRSCH - Maître de conférences - praticien hospitalier - Sorbonne université - Examinateur
  • Catherine SAWAI - Chargée de recherche - université de Bordeaux - Examinateur

  Résumé

  Le vieillissement est associé à l'acquisition par les cellules souches hématopoïétiques (CSH) de mutations somatiques et d'altérations chromosomiques. Dans certains cas, l'acquisition d'une de ces anomalies confère à la CSH un avantage d'auto-renouvellement et de prolifération conduisant au développement d'une hématopoïèse clonale. Le terme d'hématopoïèse clonale de potentiel indéterminé (Clonal Hematopoiesis of indeterminate potential - CHIP) caractérise la détection dans le sang d'un clone portant une mutation somatique sur un gène associé aux leucémies avec une fréquence allélique ≥2 % mais en absence de tout critère diagnostique d'une hémopathie maligne. Les CHIP ont été associées à une augmentation de la mortalité globale qui serait principalement liée à la survenue d'évènements cardiovasculaires (ECV). Les CHIP participeraient notamment à la physiopathologie de l'athérothrombose et des insuffisances cardiaques (IC) en exacerbant le profil inflammatoire des monocytes et des macrophages mutés avec une surexpression des interleukines 1β, 6 et 18, consécutivement à une hyperactivation de l'inflammasome NLRP3. Plus récemment, la perte mosaïque du chromosome Y (mosaic Loss Of Y - mLOY) dans les leucocytes a également été associée aux ECV en favorisant un phénotype pro-fibrotique des macrophages. Dans un premier axe de travail, nous avons étudié l'association de la CHIP et de la mLOY avec le risque d'infarctus du myocarde (IDM+) dans une cohorte de 446 participants. Notre étude n'a pas retrouvé d'association statistiquement significative entre la CHIP ou la mLOY et l'inflammation, l'athérome ou encore l'incidence d'évènements athérothrombotiques, suggérant que l'effet de la CHIP ou de la mLOY est moins important que celui des facteurs de risque cardiovasculaire traditionnels. Cependant, nous avons observé que les hommes pourraient développer un IDM de façon plus précoce lorsqu'ils sont porteurs de CHIP s'ils ne présentent pas par ailleurs de mLOY. Dans un second axe de travail, nous avons étudié dans des modèles murins le rôle des CHIP dans la physiopathologie de l'IC à fraction d'éjection préservée (ICFEp). Nous avons utilisé un protocole d'induction de l'ICFEp combinant un régime de croquettes riches en graisse et l'infusion d'angiotensine II appliqué à des souris avec ou sans CHIP. Nos expériences n'ont pas montré d'effet significatif de la CHIP pour induire une ICFEp. Enfin, afin de déterminer si d'autres cellules que les monocytes et les macrophages pouvaient participer à la physiopathologie des ECV associées aux CHIP, nous avons cherché à savoir si les polynucléaires neutrophiles porteurs des mutations de CHIP pourraient avoir un rôle dans la survenue des ECV, notamment via l'émission de Neutrophil Extracellular Traps (NETs). Dans un échantillon de 81 patients IDM+, la présence de CHIP était significativement associée à l'augmentation de marqueurs plasmatiques des NETs (histone H3 citrullinée et complexe myélopéroxydase + ADN). Dans des modèles murins, la CHIP était associée à une augmentation non significative du pourcentage de NETs formés après stimulation des neutrophiles ex vivo à la ionomycine.

• Rôles du récepteur CB1 et du système endocannabinoïde dans la rétine.

  par Sandra BERIAIN VIGURIA (Neurocentre Magendie)

  Cette soutenance a lieu à 12h00 - Room Adela Moyua Science and Technology Faculty. Barrio sarriena s/n 48940, Leioa, Bizkaia

  devant le jury composé de

  • Frank KIRCHHOFF - Full professor - Saarland University - Rapporteur
  • Stefanie HAUCK - Directrice de recherche - Helmholtz Zentrum München - Rapporteur
  • Nagore PUENTE BUSTINZA - Directrice de recherche - Universidad del País Vasco/Euskal Herriko Unibertsitatea - Examinateur
  • Guillaume FERREIRA - Directeur de recherche - Université de Bordeaux - Examinateur
  • Pedro DE LA VILLA POLO - Full professor - Universidad de Alcalá - Examinateur

  Résumé

  La rétine est un tissu spécialisé qui agit comme une extension sensorielle du système nerveux central, ayant pour rôle principal de convertir la lumière en signaux électriques pour le traitement visuel. Composée de cinq types de neurones et de cellules gliales, elle inclut les photorécepteurs (bâtonnets et cônes), qui capturent la lumière et transmettent les signaux à d'autres cellules rétiniennes (cellules bipolaires, horizontales et amacrines) avant d'atteindre les cellules ganglionnaires. Ces cellules ganglionnaires envoient ensuite les informations visuelles au cerveau via le nerf optique. Les cellules de soutien, telles que les cellules gliales de Müller, apportent un soutien structurel, métabolique et fonctionnel à la rétine. Les troubles de la rétine, comme le glaucome et la rétinopathie diabétique, sont des causes courantes de cécité irréversible en raison de la dégénérescence neuronale. Récemment, le système endocannabinoïde, un système neuromodulateur, a été identifié dans la rétine. Ce système, qui comprend des récepteurs cannabinoïdes (CB1 et CB2), des ligands endogènes et des enzymes de synthèse et de dégradation, est essentiel pour moduler la transmission synaptique. Bien qu'il ait été largement étudié dans le système nerveux central, son rôle dans la rétine suscite un intérêt croissant. Notamment, des récepteurs cannabinoïdes (CB1) ont été découverts dans tous les neurones rétiniens, bien que leur présence dans les cellules gliales de Müller reste controversée. Le système endocannabinoïde semble réguler la libération de neurotransmetteurs, notamment le glutamate, indispensable au traitement visuel et à la sensibilité à la lumière. Ce système pourrait également avoir un potentiel thérapeutique pour les maladies rétiniennes, car les cannabinoïdes semblent avoir des effets neuroprotecteurs, modulant l'inflammation et les réponses au stress. La présence de ce système dans les cellules gliales de Müller suggère qu'il pourrait influencer la modulation synaptique et la communication entre les neurones et les cellules gliales de la rétine. Les recherches sur le rôle du système endocannabinoïde dans la fonction et la pathologie rétiniennes ont utilisé des modèles murins pour des expériences in vitro et in vivo. Ces études ont confirmé la distribution des récepteurs CB1 dans les cellules rétiniennes et ont examiné leur rôle dans la respiration mitochondriale et les comportements défensifs déclenchés par des stimuli visuels. Par exemple, l'activation des récepteurs CB1 a influencé la fonction mitochondriale dans les cellules gliales, suggérant un impact potentiel sur le métabolisme énergétique de la rétine, bien que la suppression des récepteurs n'ait pas altéré la fonction mitochondriale globale. De plus, les récepteurs CB1 ont été montrés comme influençant les réponses à certains stimuli visuels liés aux comportements défensifs, comme dans le test d'évitement de prédateur, qui imite l'approche d'un prédateur. Cependant, ces récepteurs n'ont pas affecté d'autres comportements, tels que la navigation spatiale ou les réponses de peur déclenchées par des stimuli auditifs. Dans le contexte des lésions d'ischémie/reperfusion rétiniennes, la suppression des récepteurs CB1 n'a pas eu d'effet significatif sur la survie des cellules ganglionnaires rétiniennes. Cependant, des différences de réponses entre les sexes face au stress ischémique ont été observées, indiquant que les souris mâles et femelles pourraient réagir différemment à de telles lésions. En résumé, cette recherche souligne le rôle complexe du système endocannabinoïde dans la santé rétinienne, notamment à travers ses effets sur la modulation synaptique, le traitement visuel et la réponse aux conditions pathologiques. Elle suggère que l'exploration plus approfondie de la signalisation cannabinoïde pourrait ouvrir de nouvelles perspectives pour le traitement des maladies rétiniennes.

• Mécanismes corticaux des interactions entre sensibilisation douloureuse et trouble de l'attention avec ou sans hyperactivité (TDAH) dans un modèle murin

  par Sarah BOU SADER NEHME (Institut des Maladies Neurodégénératives)

  Cette soutenance a lieu à 14h00 - Amphitéâtre BROCA Université de Bordeaux Centre Broca Nouvelle-Aquitaine 146 rue Léo Saignat – CS 61292 33076 Bordeaux cedex

  devant le jury composé de

  • Marc LANDRY - Professeur - Université de Bordeaux - Directeur de these
  • Ana Maria SANCHEZ PEREZ - Professeure - Universitat Jaume I - Rapporteur
  • Jeffrey GLENNON - Professor - University College Dublin - Rapporteur
  • Walid HLEIHEL - Professeur - Université Saint-Esprit de Kaslik - Directeur de these
  • Agnès NADJAR - Professeure - Université de Bordeaux - Examinateur
  • Tania BITAR - Assistant professor - Université Saint-Esprit de Kaslik - Examinateur
  • Annabelle REAUX-LE-GOAZIGO - Professeure - Institut de la Vision - Examinateur
  • Laurent GALINEAU - Associate Professor - Université de Tours - Examinateur

  Résumé

  Le trouble du déficit de l'attention avec ou sans hyperactivité (TDAH) et la douleur chronique sont deux syndromes complexes d'origine multifactorielle. Des études confirment une comorbidité entre ces deux pathologies. Cependant, les mécanismes ne sont toujours pas élucidés. Une hyperactivité des neurones de l'ACC et une dérégulation de la voie ACC-insula postérieure (PI) ont été démontrées dans un modèle de souris TDAH. La neuroinflammation serait impliquée dans cette concomitance. Notre hypothèse suggère que la neuroinflammation déclencherait une amplification de l'activité neuronale dans l'ACC, sensibilisant ainsi les voies impliquées dans les symptômes du TDAH et la perception douloureuse. Ce travail de thèse vise donc à identifier les mécanismes inflammatoires à l'origine du TDAH et de la sensibilisation douloureuse qui lui est associée, avec un intérêt porté sur le rôle du récepteur purinergique P2X4 dans cette comorbidité. Afin de répondre à cette question, nous avons généré un modèle de souris TDAH par injection unilatérale et intracérébroventriculaire de 6-hydroxydopamine (6-OHDA), à P5. D'une part, des souris sauvages mâles et femelles âgées de deux mois ont été sacrifiées, leurs cerveaux ont été extraits et leurs ACC et PI ont été disséqués. Des tissus fixés ont été utilisés pour des études morphologiques tandis que des tissus frais ont été utilisés pour des études transcriptomique, protéomique et phosphoprotéomique. D'autre part, des souris avec un knock-out total du récepteur P2X4 ont été soumises à des tests de sensibilisation à la douleur (thermique et mécanique) et d'hyperactivité. Les tissus provenant d'ACC fixés ont été utilisés afin d'étudier les changements morphologiques microgliaux tandis que des tissus provenant d'ACC et de PI fraîchement extraits ont été utilisés pour des analyses transcriptomiques. En ce qui concerne les marqueurs identifiés chez les souris modèles de TDAH, nos résultats démontrent (i) des changements dans la morphologie des cellules microgliale et astrocytaire, associés à une réactivité cellulaire, dans l'ACC des souris 6-OHDA, (ii) la présence d'un environnement pro-inflammatoire dans l'ACC et la PI des souris 6-OHDA, (iii) des modifications dans l'expression de multiples protéines et l'activité de plusieurs kinases (sérine-thréonine et tyrosine) dans l'ACC et la PI des souris 6-OHDA, associées à des altérations du guidage axonal, de l'apoptose, de la dynamique du cytosquelette, de cascades de signalisation, de neurotrophines et de neurotransmetteurs, et (iv) des variations des interactions neurones-glie, et en particulier de la communication entre les neurones et les astrocytes dans l'ACC des souris 6-OHDA. L'intégration des données a permis d'identifier quatre processus altérés dans l'ACC et la PI des souris mâles et femelles 6-OHDA : l'apoptose, le guidage axonal, la plasticité synaptique (potentialisation à long terme) et la croissance des prolongements neuronaux ; des processus précédemment associés au TDAH et aux douleurs chroniques. De plus, nos résultats suggèrent un effet délétère du récepteur P2X4 sur l'activité locomotrice des souris et la réactivité microgliale. Il exercerait néanmoins un effet protecteur en limitant l'expression de molécules pro-inflammatoires, probablement sécrétées par des cellules non-microgliales. En conclusion, nos travaux fournissent des pistes sur les mécanismes inflammatoires qui sous-tendent la comorbidité entre le TDAH et la sensibilisation à la douleur. Ces pistes devront ultérieurement être validées individuellement. Le maintien d'un environnement pro-inflammatoire dans l'ACC et la PI entraîne des changements dans certains processus synaptiques (potentialisation à long-terme, guidage axonal, croissance des composants neuronaux) et apoptotiques. Ces altérations modifieraient la connectivité cellulaire et l'activité neuronale, participant ainsi à la pathogenèse du TDAH et de la douleur chronique.

• Effort cognitif, codage efficace et mesure en IRMf de leur relation lors du traitement sensori-moteur.

  par Simon BOYLAN (Institut de neurosciences cognitives et intégratives d'Aquitaine)

  Cette soutenance a lieu à 14h00 - Amphitéatre Bâtiment Bordeaux Biologie Santé, 2 rue Dr Hoffmann Martinot, 33000 BORDEAUX

  devant le jury composé de

  • Alexandre ZENON - Directeur de recherche - Université de Bordeaux - Directeur de these
  • María Asunción FERNáNDEZ SEARA - Professeure - Department of Radiology Clinica Universidad de Navarra Pamplona (Spain), Adjunct Associate Professor of Radiology University of Pennsylvania - Rapporteur
  • Julie DUQUé - Professeure des universités - Université catholique Louvain - Rapporteur
  • Matthew CHALK - Enseignant-Chercheur (ENAC, ISAE) - Institut de la vision - Examinateur
  • Emmanuel BARBIER - Directeur de recherche - Grenoble Institut des Neurosciences - Examinateur
  • Gaël JOBARD - Maître de conférences - Institut des Maladies Neurodégénératives CNRS UMR 5293 - Examinateur

  Résumé

  L'effort cognitif est une sensation subjective qui pousse les individus à éviter les tâches coûteuses. D'un point de vue biologique et évolutif, il est considéré comme un mécanisme destiné à préserver les ressources cognitives. Cependant, aucun consensus n'a été établi sur la nature de ces ressources. Puisque le cerveau est un organe de traitement de l'information, la théorie du codage efficient suggère que les ressources cognitives—quelle que soit leur nature—sont optimisées et dépendent du gain d'information lors du traitement d'une tâche. Cette hypothèse repose sur certains principes concernant le codage neuronal et le traitement de l'information. Premièrement, nous partons du principe que le cerveau traite l'information de manière bayésienne, mettant à jour ses modèles internes par des inférences entre les entrées sensorielles et les estimations antérieures. Deuxièmement, si les stimuli sont familiers, le codage neuronal efficient optimise alors le traitement de l'information. Si ces conditions sont remplies, nous pouvons estimer l'information traitée par le cerveau comme étant l'entropie relative entre estimations antérieures et postérieures, ou gain d'information ; de plus, l'énergie nécessaire pour traiter cette information étant optimisée, l'énergie dépensée pour accomplir la tâche devrait être proportionnelle à cette même quantité. Des mesures indirectes de cette relation ont été validées par pupillométrie, puisque la taille de la pupille est corrélée au taux d'information traité lors des tâches cognitives. Dans cette thèse, nous avons conçu des expériences pour valider davantage ce cadre théorique, en utilisant des mesures comportementales et de neuro-imagerie complémentaires. Nous avons mené trois expériences principales : deux tâches de poursuite visuomotrice par joystick et oculométrie, en parallèle de la pupillométrie, ainsi qu'une tâche de réponse à un stimulus (Hick-Hyman) en IRMf. La première étude examine la relation entre l'effort cognitif, la taille de la pupille et la prédiction visuomotrice dans ce cadre. En contrôlant les composantes informationnelles, telles que la prédictibilité, le retard, la vitesse et l'accélération de la cible, nous validons l'origine informationnelle de l'effort cognitif (NASA-TLX) et sa corrélation avec la taille de la pupille. La deuxième expérience a testé l'apprentissage implicite de trajectoires de cibles par oculométrie et contrôle manuel. et leur consolidation. Avec le même design que dans la première expérience, nous avons réalisé quatre sessions expérimentales sur deux jours consécutifs. Les participants apprenaient implicitement à mieux prédire les parties répétitives de la trajectoire, entraînant de meilleures performances et une dilatation pupillaire réduite. La dernière étude explorait la relation entre traitement de l'information et dissipation énergétique, en quantifiant le taux de consommation cérébrale en oxygène (CMRO2) lors d'une tâche de réponse à stimuli en IRMf (BOLD-ASL). La tâche de Hick-Hyman attribue un nombre différent de stimuli, en fonction de la complexité (entropie) de l'essai ou du bloc, à leurs boutons respectifs. Comme il existe une relation linéaire entre la quantité d'information traitée (entropie) et la performance (temps de réponse), nous avons émis l'hypothèse qu'il devrait exister une relation similaire entre la quantité d'information nécessaire pour accomplir une tâche et l'énergie qui lui est allouée. Nous avons abordé plusieurs défis techniques liés au calcul du CMRO2 dans ce contexte. Bien que nous ayons amélioré et automatisé le traitement des données, nous avons rencontré des obstacles importants qui nous ont empêchés de tirer une conclusion définitive sur notre hypothèse initiale.

• Neuroprotection du lactate dans le cadre de l'hypoxie-ischémie néonatale

  par Ifrah OMAR IBRAHIM (Centre de Résonnance Magnétique des Systèmes Biologiques)

  Cette soutenance a lieu à 9h00 - Salle de conférence Bâtiment BBS Carreire Bâtiment BBS 145 Rue Léo Saignat 33076 Bordeaux

  devant le jury composé de

  • Anne-Karine BOUZIER-SORE - Directeur de recherche - Université de Bordeaux - Directeur de these
  • Rosa Chiara PAOLICELLI - Professeur associé - Université de Lausanne - Rapporteur
  • Laurent SUISSA - Professeur des universités - praticien hospitalier - Université d'Aix Marseille - Rapporteur
  • Emilie PACARY - Chargée de recherche - Université de Bordeaux - Examinateur
  • Remy GUILLEVIN - Professeur des universités - praticien hospitalier - Université de Poitiers - Examinateur

  Résumé

  Depuis l'introduction du concept de la navette lactate entre astrocyte et neurone (ANLS, pour astrocyte-neuron lactate shuttle) par Pellerin et Magistretti en 1994, il a été proposé que le lactate produit par les astrocytes (via la glycolyse) soit transféré aux neurones en tant que substrat énergétique privilégié. Très récemment, le rôle crucial de cette ANLS dans l'activation cérébrale et les fonctions associées a été démontré in vivo. Si le lactate est essentiel à l'activité neuronale, pourrait-il être neuroprotecteur dans des pathologies caractérisées par un déficit énergétique cérébral ? Pour répondre à cette question, nous avons utilisé un modèle d'hypoxie-ischémie néonatale (HIN), une pathologie qui touche 1 à 6 ‰ des nourrissons. Elle résulte d'une diminution du flux sanguin au niveau du cerveau du nouveau-né, entraînant une réduction des apports en oxygène (O2) et en glucose. À ce jour, la seule prise en charge clinique est l'hypothermie thérapeutique (HT) modérée, qui permet de limiter les séquelles neurologiques induites par cette pathologie, mais près d'un nouveau-né sur deux n'y répond pas favorablement. Les travaux de l'équipe ont montré, sur un modèle d'HIN chez le rat, que l'administration de lactate avait un effet neuroprotecteur. L'objectif de ma thèse était de déterminer si cette administration de lactate était compatible avec l'HT après un accident d'HIN, et de comparer les effets de la combinaison de ces deux thérapies à ceux de l'HT seule. Pour atteindre cet objectif, ma thèse s'est articulée autour de trois volets : 1. La mise en place d'un protocole d'hypothermie dans un modèle d'HIN chez le rat afin de déterminer les conditions optimales de traitement. Trois durées d'hypothermie (2 h, 3 h et 5 h) post-HIN ont été comparées grâce à un suivi longitudinal des dommages cérébraux mesurés par IRM (Bruker 4,7T) et divers tests comportementaux. Des analyses histologiques et immunohistochimiques ont été réalisées pour compléter ces observations. 2. Le potentiel thérapeutique des injections de lactate couplées à l'hypothermie a été comparé aux effets neuroprotecteurs de l'HT seule. La fenêtre optimale pour l'administration du lactate a également été déterminée. Les mécanismes moléculaires impliqués dans ces neuroprotections ont été étudiés par Western blot. Afin de caractériser l'impact de l'administration du lactate dans la neuro-inflammation, son rôle dans la modulation phénotypique des microglies a été évalué in vitro. 3. Enfin, dans l'objectif final d'un transfert vers la clinique, l'innocuité de l'administration de lactate sur les paramètres sanguins des nouveau-nés a été vérifiée à travers une étude rétrospective chez des prématurés ayant reçu une perfusion de L-lactate de sodium. Nos résultats ont suggéré que 2 h d'HT suffisaient pour réduire les volumes de lésions cérébrales et obtenir des performances optimales lors des tests comportementaux. De plus, l'administration de lactate couplée à l'HT s'est avérée plus neuroprotectrice par rapport à l'HT seule. Enfin, dans de l'étude rétrospective, la perfusion du L-lactate de sodium chez les bébés prématurés n'a entrainé ni d'augmentation de la lactatémie ni perturbation des autres paramètres sanguins. En conclusion, l'administration du lactate est non seulement neuroprotectrice dans le cadre de l'HIN, même lorsqu'elle est associée à l'HT, mais aussi bénéfique chez les nouveau-nés prématurés, même en présence d'une lactatémie déjà élevée. Ces résultats ouvrent la voie à une application en pédiatrie clinique.

ED Sciences Physiques et de l'Ingénieur

• Étude des écoulements diphasiques liquide-gaz dans un contact rugueux pour des applications d'étanchéité métallique hautes performances

  par Christian KANKOLONGO (I2M - Institut de Mécanique et d'Ingénierie de Bordeaux)

  Cette soutenance a lieu à 10h00 - ENSAM ENSAM Esplanade des Arts et Métiers 33405 TALENCE

  devant le jury composé de

  • Didier LASSEUX - Directeur de recherche - CNRS Talence - Directeur de these
  • Marc PRAT - Directeur de recherche émérite - CNRS Toulouse - CoDirecteur de these
  • Anne-Laure BIANCE - Directrice de recherche - Institut Lumière Matière - Examinateur
  • Cyprien SOULAINE - Chargé de recherche - CNRS Orléans - Rapporteur
  • Hugues BODIGUEL - Professeur - Grenoble INP - Rapporteur

  Résumé

  Des assemblages mécaniques, utilisés par exemple dans le circuit primaire d'une centrale nucléaire, sont constitués généralement de deux brides en matériau métallique dur et d'un joint en matériau métallique mou. Les brides possèdent des défauts de surface dus au procédé de fabrication (par exemple le procédé par tournage) qui offrent des interfaces multi-échelles, constituant ainsi un chemin de fuite, après la mise en contact par un effort de serrage. La caractérisation de l'étanchéité d'un assemblage, s'effectue à ce jour par un test en gaz (généralement de l'hélium) même si cet assemblage doit étancher du liquide. Il est ainsi difficile de justifier une étanchéité liquide par la seule connaissance de l'étanchéité en gaz. L'optimisation de l'étanchéité des joints passe par la maîtrise de la mécanique du contact et la compréhension des écoulements fluides ayant des effets particuliers à travers des interfaces multi-échelles (capillarité, écoulement en film liquide, etc.). L'enjeu de ces travaux de thèse est d'élaborer des modèles permettant d'étudier une fuite liquide en condition d'écoulement diphasique, principalement de l'imbibition, c'est-à-dire lorsque le contact mécanique initialement saturé d'air sec est envahi par un liquide mouillant. Dans cette modélisation, l'écoulement dans un chemin de fuite à l'interface d'un joint est modélisé comme dans un canal de section transversale triangulaire, en prenant en compte les effets de capillarité et des écoulements en film liquide se développant dans les angles vifs. Les résultats issus de ces modèles numériques sont ensuite comparés avec des mesures expérimentales. L'analyse montre que plus les écoulements sont importants dans les angles vifs, plus l'envahissement du liquide dans tout le canal est perturbé.

ED Sciences et environnements

• La fertilisation soufrée est-elle un levier efficace pour limiter le transfert sol-grain du cadmium chez le blé dur ?

  par Agathe VIDAL (ISPA - Interaction Sol-Plante-Atmosphère)

  Cette soutenance a lieu à 14h00 - Salle de réunion centre - ISPA UMR ISPA - Bâtiment C1 71 avenue Edouard Boulaux 33882 Villenave d'Ornon

  devant le jury composé de

  • Matthias WIGGENHAUSER - Senior scientist - ETH Zurich - Examinateur
  • Catherine SIRGUEY - Maître de conférences - Université de Lorraine - LSE - Examinateur
  • Camille DUMAT - Professeur des universités - Toulouse INP-ENSAT - Rapporteur
  • Christophe SALON - Directeur de recherche - INRAE - Rapporteur

  Résumé

  Le cadmium (Cd) est un élément métallique non essentiel et très toxique, présent généralement à l'état de trace dans les sols. Son origine est naturelle en lien avec la pédogenèse mais aussi anthropique (contamination des intrants agricoles rejets industriels etc.). En prélevant le Cd du sol par leurs racines, les plantes accumulent ce contaminant dans leurs parties aériennes, menaçant ainsi la qualité sanitaire des denrées alimentaires. C'est le cas du blé dur, qui est la céréale accumulant le plus fortement le Cd dans ses grains et qui contribue fortement à l'exposition chronique de la population française au Cd par voie alimentaire. Compte-tenu de la forte toxicité pour l'Homme de ce métal classé cancérogène et reconnu pour ses effets délétères sur les reins notamment, l'Union Européenne a établi des seuils réglementaires fixant les teneurs maximales du Cd dans un grand nombre de denrées alimentaires. Suite à de récentes études toxicologiques, les seuils réglementaires se multiplient et se durcissent. Pour les grains de blé dur, le seuil a récemment été abaissé de 0.20 mg Cd kg-1 à 0.18 mg Cd kg-1 (CE 915/2023). D'autres baisses seront probablement mises en application à l'avenir, ce qui nécessite de trouver des leviers pour limiter le transfert sol-grain du Cd. Le Cd a une forte affinité chimique pour le soufre (S) avec lequel il forme des complexes très stables dans le cas des groupements thiols (-SH) des molécules organiques, plus labiles dans le cas des sulfates. La littérature montre que l'apport de S au sol peut modifier la phytodisponibilité du Cd du sol et affecter la répartition entre organes, les complexes Cd-ligand soufrés contribuant à détoxifier ce métal en le séquestrant dans les vacuoles, notamment dans les racines. Cependant, la littérature concerne majoritairement les sols pollués et la phytoextraction. Peu de travaux portent sur les sols agricoles faiblement contaminés. Ce travail de thèse avait pour objectif de tester si l'apport de S à des doses et formes chimiques utilisées en céréaliculture pouvait limiter l'accumulation de Cd dans les grains de blé dur dans le contexte des sols agricoles. Nous avons montré, en conditions contrôlées, que la solubilité du Cd pouvait être augmentée par l'apport de sulfate d'ammonium, non pas par l'effet direct des sulfates mais par l'effet d'acidification résultant de la nitrification de l'ammonium. En conditions contrôlées et au champ, les apports de S ont légèrement diminué la concentration en Cd dans les grains de blé dur parfois en lien avec une plus forte rétention racinaire du Cd comme attendu. Nous avons observé que le Cd était majoritairement stocké dans les racines et, aux stades reproducteurs, qu'il était remobilisé vers les parties aériennes en même temps que le S. En réduisant la remobilisation du S à partir des racines, la fertilisation soufrée pourrait contribuer à également limiter la remobilisation du Cd des racines vers les grains. Par ailleurs, nos résultats ont montré que la fertilisation S pouvait également affecter la distribution de la biomasse entre les organes, affectant ainsi leur teneur en Cd. Nos travaux suggèrent donc que chez le blé dur, veiller à satisfaire les besoins en S des plantes permettrait de réduire légèrement la teneur en Cd des grains indirectement par des effets sur la biomasse et aussi, peut-être, par des mécanismes directs d'interactions S-Cd. Même s'il n'est pas majeur, le levier de la fertilisation soufrée mérite d'être considéré pour réduire la contamination cadmiée du blé dur.

ED Sociétés, Politique, Santé Publique

• Enfance vert émeraude: Approche anthropologique de la santé infantile et de la médiation en contexte de pluralisme des rapports au soin dans la communauté Uitoto (Amazonie)

  par Adriana Marcela BENAVIDES OCAMPO (Passages)

  Cette soutenance a lieu à 13h30 - Salle Denucé 3ter Pl. de la Victoire, 33000 Bordeaux

  devant le jury composé de

  • Rita NEVES - Professeure des universités - Département d'anthropologie, Université Fédérale du Rio Grande Do Norte - Rapporteur
  • Catherine ALES - Directrice de recherche émérite - CNRS – EHESS, CéSor - Examinateur
  • Fiona GEDEON ACHI - Maîtresse de conférences - ISPED/ Bordeaux Population Health, Université de Bordeaux - Examinateur
  • Guillaume ODONNE - Directeur de recherche - Directeur de recherche CNRS – LEEISA - Rapporteur

  Résumé

  Les Uitoto, communauté indigène de l'Amazonie colombienne au cœur de l'ethnographie proposée dans cette thèse, présentent un état de santé qui, comme dans d'autres communautés indigènes d'Amérique du Sud, est marqué par la persistance de maladies infectieuses et parasitaires, et de taux de mortalité maternelle et infantile plus élevés que dans le reste de la population des pays dans lesquels vivent ces communautés. Partant de ce constat, j'ai conduit des missions depuis 2014 auprès de communautés Uitoto vivant dans l'Amazonas, d'abord en tant qu'épidémiologiste puis dans le cadre de ma formation en anthropologie, pour mettre en lumière et analyser les manières dont les Uitoto pensent les rapports au corps, à la santé, aux maladies et aux soins en les inscrivant dans leur cosmovision. La thèse documente en corollaire les éléments saillants qui ont marqué l'histoire collective des Uitoto, leur identité culturelle, leur relation à leur environnement, à la forêt, à l'eau ; ce sont autant d'éléments qui renvoient à la notion centrale d'équilibre qui marque la vie matérielle et spirituelle des Uitoto, ainsi que leurs pratiques de prévention et de soin. La thèse décrit le rôle déterminant du chaman et discute les possibles rencontres entre ethnomédecines et biomédecine pour une co-construction des soins dans un pays où le pluralisme identitaire est reconnu depuis 1991 dans la constitution nationale. La thèse discute également, dans une dimension appliquée, les conditions d'une médiation entre ethno et biomédecines et la manière dont elle pourrait prendre corps dans ce contexte, pour imaginer des relations de soin plus « hospitalières » envers différents types de savoir.

• Intégration et utilisation secondaire des données de santé hospitalière hétérogènes : des usages locaux à l'analyse fédérée

  par Romain GRIFFIER (Bordeaux Population Health Research Center)

  Cette soutenance a lieu à 14h00 - ISPED - Amphithéatre Louis Université de Bordeaux - Campus Carreire 146 Rue Léo Saignat, 33000 Bordeaux

  devant le jury composé de

  • Fleur MOUGIN - Professeure des universités - Université de Bordeaux - Directeur de these
  • Bastien RANCE - Maître de conférences - praticien hospitalier - Hôpital Européen Georges Pompidou AP-HP - Rapporteur
  • Leslie GRAMMATICO-GUILLON - Professeur des universités - praticien hospitalier - CHRU de Tours - Rapporteur
  • Vianney JOUHET - Praticien hospitalier - CHU de Bordeaux - CoDirecteur de these
  • Rodolphe THIEBAUT - Professeur des universités - praticien hospitalier - Université de Bordeaux - Examinateur
  • Pascal STACCINI - Professeur des universités - praticien hospitalier - Université Côte d'Azur - Examinateur

  Résumé

  Les données issues du soin peuvent être utilisées pour des finalités autres que celles pour lesquelles elles ont été collectées initialement : c'est l'utilisation secondaire des données de santé. Dans le contexte hospitaliser, afin de lever les verrous de l'utilisation secondaire des données de santé (verrous liés aux données et verrous organisationnels), une stratégie classique consiste à mettre en place un Entrepôt de Données de Santé (EDS). Dans le cadre de cette thèse, trois contributions à l'EDS du CHU de Bordeaux sont décrites. Premièrement, une méthode d'alignement des data elements de biologie numérique basée sur les instances et conforme aux règles de protection des données à caractère personnel est présentée, avec une F-mesure à umprint{0.850}, permettant de réduire l'hétérogénéité sémantique des données. Ensuite, une adaptation du modèle d'intégration des données cliniques d'i2b2 est proposée pour assurer la persistance des données d'un EDS dans une base de données NoSQL, Elasticsearch. Cette implémentation a été évaluée sur la base de données de l'EDS du CHU de Bordeaux et retrouve des performances améliorées en termes de stockage et de temps de requêtage, par rapport à une base de données relationnelle. Enfin, une présentation de l'environnement EDS du CHU de Bordeaux est réalisée, avec la description d'un premier EDS dédié aux usages locaux et qui peut être exploité en autonomie par les utilisateurs finaux (i2b2), et d'un second EDS, dédié aux réseaux fédérés (OMOP) permettant notamment la participation au réseau fédéré DARWIN-EU.

• Éclairage des modes de parler - penser l'agir professionnel d'enseignant·e·s néotitulaires au travers d'une recherche accompagnante longitudinale

  par Virginie BILLON (Laboratoire d'épistémologie et didactiques disciplinaires, professionnelle et comparée de Bordeaux)

  Cette soutenance a lieu à 14h00 - Amphithéâtre Averroès INSPE de Bordeaux Caudéran Bâtiment 5- 2ème étage 49, rue de l'Ecole Normale 33200 BORDEAUX

  devant le jury composé de

  • Martine JAUBERT - Professeure émérite - Université de Bordeaux, INSPE de l'académie de Bordeaux - Directeur de these
  • Dominique BROUSSAL - Professeur des universités - Université Toulouse Jean Jaurès - Rapporteur
  • Sandrine AEBY-DAGHE - Professeure des universités - Université de Genève Faculté de psychologie et des sciences de l'éducation - Rapporteur
  • Claudine GARCIA-DEBANC - Professeure émérite - Université Toulouse 2 Jean Jaurès - Examinateur
  • Stéphanie VOLTEAU - Maîtresse de conférences - Université de Poitiers, INSPE de l'académie de Poitiers, FoReLLIS Unité de Recherche 15076 - Examinateur

  Résumé

  Notre recherche, à visée essentiellement compréhensive, s'attache à décrire certaines caractéristiques du développement professionnel d'enseignant·e·s débutant·e·s au cours d'un dispositif accompagnant. Elle s'intéresse à ce que révèlent les mouvements discursifs lors d'interactions langagières entre pairs et entre pairs et chercheur·e·s, interactions centrées sur des éléments de leur pratique ainsi que sur les articulations théorie/pratique. Dans notre étude, l'analyse de pratique est adossée à un scénario didactique portant sur un atelier d'écriture autonome. Les dimensions théoriques mobilisées par les participant·e·s ont trait au modèle du multiagenda (Bucheton, Soulé, 2009) et à la notion de geste (professionnel, didactique, d'ajustement, d'étude et d'apprentissage). À terme, nos résultats doivent nourrir les dispositifs de formation d'enseignant·e·s, en articulant l'analyse de pratiques aux apports des didactiques disciplinaire et professionnelle.

• La mobilisation politique des périphéries en Europe: Les transformations du clivage centre-périphérie au Pays Basque et en Écosse (2007-2017)

  par Luis EMALDI AZKUE (Centre Emile Durkheim)

  Cette soutenance a lieu à 14h00 - Salle Copernic Sciences Po Bordeaux 11 allée Ausone | Domaine universitaire 33607 Pessac Cedex

  devant le jury composé de

  • Xabier ITCAINA - Directeur de recherche - CNRS - Sciences Po Bordeaux - Université de Bordeaux - Directeur de these
  • Vincent TIBERJ - Professeur des universités - Sciences Po Bordeaux - Examinateur
  • Michael KEATING - Professeur émérite - University of Aberdeen - Rapporteur
  • Igor AHEDO - Associate Professor - Université du Pays Basque - Examinateur
  • Emilie VAN HAUTE - Professeure - Université Libre de Bruxelles - Examinateur
  • Sonia ALONSO - Associate Professor - Universidad de Deusto - Rapporteur

  Résumé

  Depuis le crash financier de 2008, la crise économique est devenue une crise politique qui traverse de nombreux pays européens et a transformé les systèmes partisans qui ont configuré la politique depuis des décennies. De nouveaux partis politiques sont apparus, certains inspirés par les mouvements sociaux au sud de l'Europe de 2011, et d'autres plus vieux connaissent un succès renouvelé, transformant le politique. Certains travaux évoquent l'émergence d'un ou plusieurs nouveaux clivages en lien avec la mondialisation. Par ailleurs, des conflits centre-périphérie qui existaient depuis longtemps n'ont perdu aucune actualité et connaissent au contraire un élan renouvelé, notamment illustré par le referendum pour l'indépendance de l'Écosse en 2014 ou la Catalogne en 2017. Comment comprendre dès lors la montée de ces phénomènes ethnorégionalistes dans ce contexte changeant où se redéfinissent les contours des clivages qui structurent les systèmes partisans ? Dans quel mesure ces clivages s'entrecroisent ou s'imbriquent-ils et comment ? Ce projet de recherche a donc pour objectif d'analyser les transformations du clivage Centre-Périphérie en lien avec ces nouveaux enjeux émergents à partir d'une approche multidimensionnelle. La méthode combine les approches quantitative et qualitative, en étudiant les partis politiques et leurs organisations, leurs positionnements idéologiques sur la base des programmes électoraux, et enfin, leurs bases socio-structurelles. Ce sont ici les cas du Pays Basque et de l'Écosse qui seront plus précisément étudiés. La thèse centrale qui est défendue est que le clivage centre-périphérie a connu des transformations sur le fond et sur la forme, qui se sont cristallisées au cours de la Neoliberal Critical Juncture. Les bases socio-structurelles des électorats se modifient avec les phénomènes de réalignements; les enjeux autour de ces revendications ethnorégionalistes dépassent la question nationale entendue au sens du XIX/XXème siècle et s'articulent avec les enjeux politiques contemporains (intégration européenne, austérité, welfare, écologie…); et de nouvelles formes d'organisation des partis politiques sont mises en place pour répondre aux défis que posent les nouvelles formes d'engagement et de participation.