ED Sciences de la Vie et de la Santé
Modélisation par CRISPR-Cas9 de pertes d'hétérozygotie au locus 11p15 et étude de leur rôle dans l'oncogenèse des tumeurs pédiatriques
par Léana PERIGNON (BoRdeaux Institute of onCology)
Cette soutenance a lieu à 14h00 - Amphithéâtre BBS 2 rue de Dr Hoffmann Martinot, 33000 Bordeaux, Bâtiment Bordeaux Biologie Santé (BBS)
devant le jury composé de
- Sophie POSTEL-VINAY - Professeure des universités - praticienne hospitalière - Université Paris-Saclay - Examinateur
- Isabelle JANOUEIX-LEROSEY - Directrice de recherche - Institut Curie - Rapporteur
- Jessica ZUCMAN-ROSSI - Professeure des universités - praticienne hospitalière - Université Paris Cité - Rapporteur
- Martin TEICHMANN - Professeur des universités - Université de Bordeaux - Examinateur
- Didier LACOMBE - Professeur des universités - praticien hospitalier - Université de Bordeaux - Examinateur
- David CAPPELLEN - Maître de conférences - praticien hospitalier - Université de Bordeaux - Directeur de these
Les pertes d'hétérozygotie (LOH) constituent des altérations génomiques fréquentes dans les cancers et peuvent résulter de différents mécanismes, notamment des délétions chromosomiques, des recombinaisons mitotiques, des monosomies ou des disomies uniparentales. Des LOH de la région chromosomique 11p15, associées préférentiellement à une perte de l'allèle maternel, ont été observées dans plusieurs cancers pédiatriques, notamment les rhabdomyosarcomes, les hépatoblastomes et les tumeurs de Wilms. Des gènes soumis à l'empreinte génomique parentale ont été identifiés dans cette région, caractérisés par une expression monoallélique à partir de l'allèle maternel (notamment H19 et CDKN1C) ou paternel (notamment IGF2). Des altérations génétiques et épigénétiques de cette région sont notamment associées au syndrome de Beckwith–Wiedemann, prédisposant au développement de tumeurs pédiatriques. En raison de la complexité du locus 11p15 et des nombreuses altérations génétiques observées dans les tumeurs, le rôle pathogénique des LOH de la région 11p15 demeure mal compris. La modélisation de ces LOH dans des cellules normales pourrait permettre de mieux comprendre leur contribution dans le processus oncogénique. Des études récentes de notre équipe sur l'utilisation du système CRISPR-Cas9 comme outil de thérapie génique ont montré que ce système pouvait induire des LOH à l'échelle mégabasique, depuis le site de coupure de CRISPR-Cas9 jusqu'au télomère, par délétion ou recombinaison mitotique. Par différentes approches CRISPR-Cas9, nous avons pu ainsi modéliser plusieurs types de LOH de la région 11p15 dans des fibroblastes et des myoblastes humains non transformés. Nous avons montré que ces altérations induisent un blocage de la différenciation cellulaire, une instabilité chromosomique ainsi que des modifications du méthylome et du transcriptome impliquées dans ces processus. Nos travaux apportent ainsi de nouveaux éléments sur le rôle des LOH de la région 11p15 et leur contribution à l'initiation du processus tumoral.