ED Sciences de la Vie et de la Santé
Comment le cerveau intègre les souvenirs sensoriels et émotionnels ? Une étude du rôle de l'hippocampe dans préconditionnement sensoriel chez le rat
par Mélie TALARON (Institut de neurosciences cognitives et intégratives d'Aquitaine)
Cette soutenance a lieu à 14h00 - Amphithéâtre BBS Batiment Bordeaux Biologie Santé Université de Bordeaux 2 Rue Dr Hoffmann Martinot, 33000 Bordeaux
devant le jury composé de
- Etienne COUTUREAU - Directeur de recherche - Université de Bordeaux - Directeur de these
- Joshua JOHANSEN - Professor - University of California - Rapporteur
- Valérie DOYERE - Directrice de recherche - Institut des Neurosciences Paris-Saclay - Rapporteur
- Charlotte BONARDI - Maîtresse de conférences - University of Nottingham - Examinateur
- Lisa ROUX - Directrice de recherche - Université de Bordeaux - Examinateur
- Nathan HOLMES - Associate Professor - The University of New South Wales - CoDirecteur de these
Les animaux et les humains s'adaptent à leur environnement en apprenant à prédire des événements à valeur motivationnelle, tels que la présence de nourriture ou d'un danger. Ces prédictions reposent souvent sur l'expérience directe des contingences entre différents stimuli et événements (par exemple, un son suivi de l'attaque d'un prédateur), mais peuvent également être générées en l'absence d'une telle expérience. Ainsi, en associant les éléments sensoriels et émotionnels de souvenirs distincts, il est possible de produire de nouvelles inférences à propos de stimuli jusqu'alors perçus comme neutres. Ce type d'inférence a des implications sur la façon dont les souvenirs sont encodés et stockés dans le cerveau, et soulève la question de leur intégration pour générer des comportements adaptatifs. L'encodage et l'intégration des mémoires associatives sont connus pour dépendre de l'hippocampe. Cependant, les contributions différentielles de l'hippocampe dorsal et ventral, ainsi que leur connectivité dans ces processus, restent mal comprises. Cette thèse combine des paradigmes comportementaux, des inactivations pharmacologiques, des enregistrements par photométrie de fibre et des manipulations chémogénétiques afin d'étudier le rôle de l'hippocampe dorsal et ventral dans l'encodage et l'intégration de mémoires sensorielles et émotionnelles chez le rat. Dans un premier ensemble d'expériences, nous établissons un protocole de préconditionnement sensoriel auditivo-visuel et montrons que l'intégration opère via un apprentissage médiatisé : les rats récupèrent des informations passées au moment du conditionnement pour former de nouvelles associations entre stimuli. Dans un second volet, nous utilisons l'inactivation pharmacologique pour examiner le rôle causal de l'hippocampe dorsal et ventral dans les différentes phases du préconditionnement sensoriel. Nous montrons que l'hippocampe ventral, mais pas dorsal, est nécessaire à la formation d'associations entre stimuli neutres, et que les deux sous-régions sont indispensables à l'apprentissage médiatisé. De plus, nous identifions la signature d'un apprentissage médiatisé réussi en mettant en évidence une connectivité dorso-ventrale hippocampique accrue lors des présentations de stimuli. Nous montrons que cette connexion s'inscrit dans un réseau plus large soutenant l'apprentissage médiatisé, incluant le cortex périrhinal. Enfin, grâce à des manipulations chémogénétiques dans un protocole de préconditionnement sensoriel gustatif, nous démontrons que l'hippocampe est également essentiel pour encoder et intégrer des souvenirs même lorsque les stimuli sont unimodaux. Ces travaux mettent en lumière les contributions différentielles de l'hippocampe dorsal et ventral dans la capacité des animaux à inférer des résultats en l'absence d'expérience directe, lorsqu'ils sont confrontés à des situations nouvelles.
Approches croisées de l'œnologie et de l'économie expérimentale concernant l'évaluation des produits (raisins, vins) issus de systèmes viticoles à bas intrants phytosanitaires
par Marie-Amélie ALAYRAC (Oenologie)
Cette soutenance a lieu à 9h30 - Amphithéâtre Institut des Sciences de la Vigne et du Vin 210 chemin de Leysotte 33140 Villenave d'orion
devant le jury composé de
- Philippe DARRIET - Professeur des universités - Université de Bordeaux - Directeur de these
- Cécile COULON-LEROY - Maîtresse de conférences - ESA Angers - Rapporteur
- Foued CHERIET - Professeur - Institut Agro Montpellier - Rapporteur
- Marie BLACKFORD - Chargée de recherche - Agroscope Changins - Examinateur
- Eric GIRAUD-HERAUD - Directeur de recherche - INRAE - Examinateur
- Yann RAINEAU - Ingénieur de recherche - INRAE - CoDirecteur de these
Cette thèse s'inscrit dans le contexte de la transition agroécologique de la viticulture et de la nécessité de réduire l'usage des produits phytosanitaires tout en maintenant la qualité et la typicité des vins. Elle mobilise principalement l'œnologie et l'économie expérimentale afin d'évaluer différentes stratégies permettant d'adapter le vignoble aux contraintes sanitaires et environnementales actuelles. Un premier volet de la thèse porte sur l'analyse d'impacts œnologiques liés au développement de maladies cryptogamiques de la vigne, le mildiou et le black rot. Des vinifications expérimentales avec incorporation de proportions croissantes de raisins atteints par les maladies pathogènes ont conduit à l'élaboration de vins soumis à évaluation sensorielle ainsi qu'à la recherche de marqueurs chimiques illustrant la présence de l'intensité de ces altérations fongiques. Les analyses ont été réalisées à l'aide de la chromatographie en phase gazeuse couplée à la spectrométrie de masse et de la chromatographie ionique, techniques susceptibles d'être mises en œuvre dans les laboratoires d'œnologie. Le deuxième volet concerne la caractérisation de raisins et de vins de descendants issus de programmes de création variétale associant des cépages bordelais, le Cabernet Franc et le Petit Verdot, à des géniteurs porteurs de résistances au mildiou et à l'oïdium. Ces génotypes ont été analysés au cours de plusieurs millésimes à travers l'étude de leurs performances agronomiques, de leur comportement phénologique et de leurs aptitudes œnologiques. Les raisins et les vins obtenus ont fait l'objet d'analyses physico-chimiques et d'évaluations sensorielles réalisées par des panels d'experts afin d'identifier les génotypes les plus prometteurs pour la production de vins présentant des caractéristiques compatibles avec la typicité des vins rouges et blancs de Bordeaux. Enfin, le troisième volet s'intéresse à la perception des consommateurs vis-à-vis des stratégies d'innovation variétale pour la réduction de l'usage des pesticides en viticulture. Deux protocoles d'économie expérimentale associant dégustation de vins et mécanismes incitatifs de révélation des préférences ont été conduites auprès de 267 consommateurs réguliers de vins de Bordeaux. La première expérimentation montre que l'innovation variétale ne constitue pas en elle-même un frein à l'acceptation des vins par les consommateurs. Elle met également en évidence que les informations relatives à la réduction de l'utilisation des produits phytosanitaires augmentent la valorisation économique des vins, contrairement au seul argument de tradition variétale. La seconde expérimentation explore les conséquences d'une réduction de l'offre de vins conventionnels et révèle un attachement des consommateurs à la diversité des produits disponibles. Les résultats montrent également que la réduction de l'offre peut constituer un outil original pour révéler les préférences des consommateurs et apporter un nouvel éclairage sur les écarts observés entre consentement à payer et consentement à accepter. L'ensemble de ces travaux vise à mieux comprendre les conséquences œnologiques, sensorielles et économiques des stratégies de réduction des intrants phytosanitaires et à accompagner le développement de solutions innovantes conciliant durabilité environnementale, préservation de la typicité des vins et acceptabilité par les consommateurs.
ED Sciences et environnements
Effets de substances perturbatrices endocriniennes sur le système hormonal thyroïdien, le développement et le microbiote de la truite arc-en-ciel
par Marine SUCHET (Environnements et Paléoenvironnements Océaniques et Continentaux)
Cette soutenance a lieu à 8h30 - Amphithéâtre PABA Bâtiment B5, Allée Geoffroy Saint-Hilaire, CS 50023, 33615 Pessac
devant le jury composé de
- Jérôme CACHOT - Professeur - Université de Bordeaux - Directeur de these
- Laure BELLEC - Maîtresse de conférences - Université de Bordeaux - CoDirecteur de these
- Xavier COUSIN - Chargé de recherche - INRAe - Rapporteur
- Emilie FARCY - Professeure - Université de Montpellier - Rapporteur
- Jean-Baptiste FINI - Professeur - Muséum National d'Histoire Naturelle - Examinateur
- Patrice GONZALEZ - Directeur de recherche - CNRS - Examinateur
- Carmen PALACIOS - Maîtresse de conférences - Université Perpignan Via Domitia - Examinateur
- Maeva GIRAUDO - Ingénieure de recherche - Sorbonne Université - Examinateur
L'intérêt porté aux perturbateurs endocriniens (PE) est grandissant en raison de leur utilisation croissante et de leur classification comme substances extrêmement préoccupantes à l'échelle européenne. Parmi eux, le fluorure, utilisé dans une variété de procédés industriels et pour la fluorisation artificielle de l'eau potable, a été classé sur la liste II des PE suspectés par l'Union Européenne. Le tébuconazole est l'un des fongicides les plus utilisés à l'échelle mondiale, dont les effets PE, notamment sur le système hormonal thyroïdien, sont bien décrits. Les milieux aquatiques représentent un réceptacle pour ces polluants, auxquels les poissons sont exposés et particulièrement vulnérables lors des premiers stades de vie. Au-delà des effets directs sur l'hôte, l'exposition à des polluants peut exercer des effets néfastes sur le microbiome des poissons, dont les perturbations peuvent affecter leur santé et leur résistance aux maladies. Dans ce contexte, les objectifs de cette thèse ont été d'évaluer les effets (1) d'une exposition chronique au fluorure lors des premiers stades de vie de la truite arc-en-ciel (TAC, Oncorhynchus mykiss) sur le développement et le système hormonal thyroïdien ; (2) d'une exposition chronique au fluorure ou au tébuconazole sur les microbiomes bactériens des branchies, du mucus épidermique et de l'intestin ; et (3) d'une exposition chronique au fluorure sur les réponses des microbiomes de la TAC à une infection virale. Des embryons de TAC ont été exposés à une gamme de concentrations de fluorure (1,5 à 51,5 mg/L) de 6 à 40 jours post-fécondation. Les résultats obtenus montrent des effets développementaux significatifs, notamment une inhibition de la croissance et une augmentation des malformations du squelette axial, ainsi qu'une perturbation thyroïdienne, incluant une surexpression de gènes clés système hormonal thyroïdien, et des altérations histopathologiques des follicules thyroïdiens. Des TAC ont également été exposées à 6,8 ou 24,7 mg/L de fluorure ou 51,7, µg/L de tébuconazole pendant sept mois. Les résultats indiquent des altérations tissu-spécifiques des communautés bactériennes des trois tissus considérés, notamment une altération de la diversité et des interactions bactériennes, ainsi qu'une augmentation de taxa potentiellement pathogènes. Enfin, les TAC préalablement exposées au fluorure ont été soumises à une infection par le virus de la nécrose hématopoïétique infectieuse. Les résultats indiquent une altération des communautés bactériennes des trois tissus par le virus, et la préexposition au fluorure module la réponse microbienne à l'infection, altérant la dynamique de taxa potentiellement pathogènes ou bénéfiques, tout en augmentant la sensibilité de la TAC à l'infection. Pour conclure, ces résultats montrent un effet PE du fluorure dès les premiers stades de vie de la TAC, ainsi qu'une capacité à altérer le microbiome et les interactions hôte-microbiome, suggérant des interconnexions entre les différents systèmes biologiques affectés.