ED Mathématiques et Informatique
Méthodes bio-informatiques pour l'étude du métabolisme du glioblastome
par Deisy Johanna GALVIS RODRIGUEZ (Institut de Biochimie et Génétique Cellulaires)
Cette soutenance a lieu à 9h30 - Salle de conférence de l'IBGC 146 rue Léo Saignat, 33000 Bordeaux
devant le jury composé de
- Macha NIKOLSKI - Directrice de recherche - Université de Bordeaux - Directeur de these
- Thomas DAUBON - Directeur de recherche - CNRS - CoDirecteur de these
- Fabien JOURDAN - Directeur de recherche - INRAE - Rapporteur
- Mohamed ELATI - Professeur des universités - Université de Lille - Rapporteur
- Florence CAVALLI - Chargée de recherche - Institut Curie - Examinateur
- Nicolas PAPADAKIS - Directeur de recherche - CNRS - Examinateur
Le glioblastome, forme la plus agressive du cancer du cerveau, reste à ce jour incurable. Les cellules malignes prolifèrent dans un microenvironnement tumoral hypoxique et très acide, s'adaptant par une plasticité métabolique — exploitant des substrats alternatifs et engageant des échanges métaboliques entre sous-populations spécialisées. La métabolomique résolue par isotopes stables (SIRM), appliquée à des sphéroïdes de glioblastome, a été complétée par un profilage transcriptomique. Cependant, les outils bioinformatiques adaptés aux jeux de données SIRM — en particulier ceux issus de conceptions multifactorielles complexes — restent peu développés. Pour combler cette lacune, la première partie de cette thèse a introduit DIMet, un cadre computationnel pour l'analyse différentielle des données d'enrichissement en isotopologues. DIMet intègre la variabilité au niveau des réplicats, permettant des comparaisons rigoureuses du marquage des métabolites entre conditions expérimentales. Son extension multi-omiques intègre en outre des données transcriptomiques et métabolomiques pour élucider les adaptations métaboliques des cellules de glioblastome. Les profils spatiaux du lipidome, obtenus à partir de tissus cérébraux de glioblastome xénogreffés, ont révélé des défis analytiques majeurs : bruit de signal élevé et isomérisme. Un besoin crucial en métabolomique spatiale était d'étendre la couverture des voies métaboliques. En exploitant des ressources de chémoinformatique et en intégrant des métriques de qualité spatiale, nous avons développé SpacePath, une méthode innovante pour l'interprétation des données de métabolomique spatiale au niveau des familles et voies métaboliques. Capable de gérer les annotations ambiguës, SpacePath révèle in situ des programmes métaboliques connus et non caractérisés. En conclusion, les méthodes bioinformatiques développées dans cette thèse visent à découvrir de nouveaux mécanismes sous-jacents à cette maladie dévastatrice.
Modélisation et résolution de problèmes d'optimisation combinatoire pour l'écologie inversée
par Chabname GHASSEMI NEDJAD (LaBRI - Laboratoire Bordelais de Recherche en Informatique)
Cette soutenance a lieu à 14h30 - Amphi LaBRI, Bâtiment A30 351 cours de la Libération 33400 Talence
devant le jury composé de
- Cédric LHOUSSAINE - Professeur des universités - Université de Lille - Rapporteur
- Clémence FRIOUX - Chargée de recherche - Inria Bordeaux - CoDirecteur de these
- Jérémie BOURDON - Professeur des universités - Nantes Université - Rapporteur
- Meghyn BIENVENU - Directrice de recherche - CNRS - Examinateur
- Sophie COLOMBIE - Directrice de recherche - INRAE - Examinateur
- Clément FRAINAY - Chargé de recherche - INRAE - Examinateur
Déterminer les conditions de culture des micro-organismes est un problème difficile et récurrent en microbiologie, qui nécessite d'identifier des besoins nutritionnels et caractériser le métabolisme. Les réseaux métaboliques à l'échelle du génome (GSMN) obtenus à partir de données génomiques permettent d'effectuer des simulations de la capacité métabolique d'un organisme à partir d'un environnement prédéfini. Nous avons développé des méthodes qui résolvent le problème inverse : la prédiction des nutriments sources, ou graines, à partir d'un GSMN et d'un objectif métaboliques. Les méthodes proposent des modèles hybrides, combinant une approximation Booléenne discrète et itérative de l'activité métabolique avec des contraintes numériques d'équilibre de flux (FBA). Appliquée à l'échelle d'une population individuelle sur des réseaux métabolique à l'échelle génomique, la méthode de modélisation logique est une bonne approximation des contraintes d'équilibre de flux. Le problème a dans un second temps été étendu aux communautés de micro-organismes. À cette échelle, il est nécessaire de considérer les transferts possibles entre réseaux, ce qui augmente la combinatoire du problème. Nous faisons l'hypothèse qu'il est pertinent d'identifier en priorité des ensembles minimaux de nutriments assurant la fonctionnalité du réseau métabolique, ce qui nous amène à hiérarchiser les optimisations sur les ensembles, en cherchant d'abord à minimiser les graines, puis les transferts. Trois algorithmes ont été mis en place, dont deux assurant la minimalité par inclusion. L'application des méthodes sur des petites communautés de réseaux révèle la complexité combinatoire, mais aussi la complémentarité des algorithmes.
ED Sciences Chimiques
Modélisation de la Photoluminescence dans les Systèmes Organiques: Exploration de l'Impact de l'Agrégation et des Effets Mécaniques sur les Propriétés Moléculaires, Électroniques et Optiques
par Josianne OWONA (Institut des Sciences Moléculaires)
Cette soutenance a lieu à 11h30 - Salon de Actos Universidad del Pais Vasco/Euskal Herriko Unibertsitatea (UPV/EHU), Facultad de Química, Paseo Manuel Lardizabal Pasealekua 3, 20018 Donostia - San Sebastián, Espagne
devant le jury composé de
- Maria del Carmen RUIZ DELGADO - Professeure des universités - Université de Málaga - Rapporteur
- Luca GRISANTI - Chargé de recherche - CNR-IOM Trieste-SISSA - Rapporteur
- Martial BOGGIO-PASQUA - Directeur de recherche - Université de Toulouse III - Examinateur
- Elixabete REZABAL ASTIGARRAGA - Professeure des universités - Université du Pays Basque - Examinateur
- Lionel TRUFLANDIER - Maître de conférences - Université de Bordeaux - Examinateur
L'objectif de cette thèse est d'analyser l'influence de l'agrégation moléculaire et des contraintes mécaniques sur la photoluminescence des matériaux organiques. Ce phénomène résulte d'une photoexcitation promouvant un électron vers un état excité, suivie d'une relaxation radiative. Dans un agrégat, l'efficacité de cette émission dépend étroitement des interactions électroniques et du recouvrement orbitalaire entre chromophores, lesquels sont eux-mêmes gouvernés par l'arrangement spatial des molécules. L'application de contraintes mécaniques externes, telles qu'une pression, peut modifier cet arrangement et, par conséquent, altérer les propriétés de luminescence. Dans le cadre de ces travaux de recherche, des méthodes de modélisation quantique, fondées sur la théorie de la fonctionnelle de la densité (DFT) et sa version dépendante du temps (TD-DFT), ont été mises en œuvre afin d'étudier l'impact de l'agrégation et de contraintes mécaniques sur différents types de matériaux. Dans une première partie, nous avons étudié l'influence de l'agrégation sur la phosphorescence à l'aide d'un dimère modèle de carbazole. En déplaçant systématiquement une molécule par rapport à l'autre, nous avons identifié les arrangements moléculaires favorisant la population de l'état triplet et l'émission de phosphorescence. Les relations structure–propriété ainsi établies constituent des lignes directrices pour l'optimisation des matériaux organiques phosphorescents. Nous avons ensuite étudié les propriétés de mécanoluminescence de cristaux de pyridylvinylanthracène. En combinant des calculs de DFT périodique avec des calculs TD-DFT sur des agrégats de taille finie, nous avons caractérisé les modifications structurales et optiques induites par la pression dans différents polymorphes. Les résultats montrent que la pression affecte profondément les propriétés de luminescence en renforçant le caractère à transfert de charge de l'état excité responsable de l'émission, ce qui permet de rationaliser le décalage bathochrome observé dans le spectre de fluorescence sous contrainte externe. Dans une troisième partie, nous avons exploré l'effet de la pression externe sur les propriétés optiques linéaires et non linéaires d'un cristal moléculaire. Nos calculs révèlent qu'une pression croissante induit une évolution non monotone de la structure cristalline, entraînant des modifications significatives des énergies d'excitation, de la localisation des excitons et de la nature des états excités. L'étude de la génération de seconde harmonique sur des dimères représentatifs montre enfin que les propriétés optiques non linéaires peuvent être modulées par l'application d'une pression, ouvrant des perspectives pour la conception de matériaux photoniques à réponse ajustable. Enfin, deux études combinant approches expérimentales et théoriques ont porté sur des systèmes photochromiques présentant des propriétés d'émission modulables. Dans le cas des dérivés de diaryléthène (DAE), nous avons confirmé la présence d'une émission induite par agrégation et anti-Kasha, et montré que la substitution permet d'ajuster la longueur d'onde d'émission, ouvrant ainsi des perspectives pour l'imagerie à super-résolution. Pour les dérivés du BODIPY, nous avons analysé l'effet de l'alkylation et de la substitution du bore dans différents solvants. Les résultats révèlent que ces modifications structurales renforcent la fluorescence, favorisent le croisement intersystème et améliorent la génération d'oxygène singulet, soulignant leur potentiel en tant que photosensibilisateurs fluorescents. Dans l'ensemble, cette thèse établit des relations structure-propriété reliant l'agrégation et les contraintes mécaniques aux mécanismes de photoluminescence dans les systèmes organiques. Grâce aux méthodes de modélisation quantique, elle fournit un aperçu des processus photophysiques complexes, tout en guidant la conception rationnelle de matériaux optoélectroniques organiques.
Matériaux composites inorganiques-polymères à l'électrode positive de batteries Li-ion et tout-solide
par Ivone NUGRAHA (ICMCB - Institut de Chimie de la Matière Condensée de Bordeaux)
Cette soutenance a lieu à 13h30 - Amphithéâtre ICMCB – UMR5026 87, Avenue du Docteur Schweitzer 33608 PESSAC cedex (France)
devant le jury composé de
- Laurence CROGUENNEC - Directrice de recherche - ICMCB Institut de Chimie de la Matière Condensée de Bordeaux – UMR5026 - Directeur de these
- Fannie ALLOIN - Directrice de recherche - LEPMI Laboratoire d'électrochimie et de physicochimie des matériaux et des interfaces - UMR 5279 - Rapporteur
- Didier GIGMES - Directeur de recherche - ICR Institut de Chimie Radicalaire – UMR 7273 - Rapporteur
- Eric CLOUTET - Directeur de recherche - LCPO Laboratoire de Chimie des Polymères Organiques - UMR 5629 - CoDirecteur de these
- Cyril AYMONIER - Directeur de recherche - ICMCB Institut de Chimie de la Matière Condensée de Bordeaux – UMR5026 - Examinateur
- Delphine FLAHAUT - Maîtresse de conférences - IPREM Institute of Analytical Sciences and Physico-Chemistry for Environment and Materials - UMR 5254 - Examinateur
- Marc DESCHAMPS - Docteur - Directeir pôle électrochimie - Blue Solutions - Examinateur
- Anthony BONNET - Docteur - Directeur scientifique matériaux pour l'énergie - Arkema - Examinateur
Face à la demande de batteries à haute puissance et à haute densité d'énergie, les batteries tout solide (ASSBs) apparaissent prometteuses. En remplaçant les électrolytes liquides inflammables par des électrolytes solides et en intégrant une électrode négative en lithium métal, elles offrent une énergie élevée (≈ 400 Wh·kg-1). Toutefois, l'électrode positive reste limitante en raison de problèmes d'interfaces, de stabilité mécanique et d'un besoin de conductivité électronique et ionique élevées. Cette thèse propose le développement d'un polymère multifonctionnel jouant simultanément le rôle d'additif conducteur, de conducteur du Li+ et de liant, afin d'améliorer les performances et la durabilité des ASSBs. Des études préliminaires en batteries Li-ion (LIBs) à électrolyte liquide ont été réalisées pour valider le concept. Dans ce contexte, un complexe polymère à conduction mixte, Poly(3,4-ethylenedioxythiophene):poly [(4-styrenesulfonyl) (trifluoromethylsulfonyl) imide] (PEDOT:PSSTFSI), a été développé pour remplacer le liant isolant poly(fluorure de vinylidène) (PVDF) et le noir de carbone (CB) dans les formulations des électrodes positives. PEDOT:PSSTFSI présente une conductivité électronique relativement élevée (30,8 ± 3,93 S/cm), supérieure à celle du mélange PVDF:CB (1:1 % en masse, 7,3 ± 0,73 S/cm), et une conductivité ionique de l'ordre de 3,4×10-5 S/cm à température ambiante, favorisant la diffusion du Li⁺. Dans des batteries Li-ion conventionnelles à électrolyte liquide avec des matériaux actifs de type olivine (LiFePO4 et LiFe0.4Mn0.6PO4), les électrodes contenant PEDOT:PSSTFSI conservent des capacités spécifiques comparables à celles des électrodes PVDF:CB (1:1 % en masse) tout en améliorant considérablement les performances à haut régime, en particulier pour les formulations à forte teneur en matériau actif (jusqu'à 94% en masse). Les mesures de voltammétrie cyclique révèlent par ailleurs un coefficient de diffusion des ions Li⁺ supérieur d'un ordre de grandeur, témoignant d'une cinétique électrochimique améliorée. L'analyse XPS met en évidence la formation de couches d'interphase cathode-électrolyte plus fines et plus stables, suggérant une meilleure stabilité sur le long terme. En configuration ASSBs, PEDOT:PSSTFSI a été intégré avec succès dans des électrolytes solides à base de Li3InCl6 par une synthèse aqueuse en une étape. Sa flexibilité améliore la compacité des électrode positives, réduit la porosité et accroît à la fois les conductivités ionique et électronique, permettant des teneurs en matière active élevées (≈ 80 %) avec une cyclabilité stable. Ainsi, au-delà de remplacer PVDF et CB dans les LIBs, PEDOT:PSSTFSI confère des avantages déterminants aux électrodes positives des ASSBs, en augmentant la densité de matière active, la vitesse de charge/décharge et la stabilité en cyclage, et en en faisant un candidat clé pour les batteries tout-solide de nouvelle génération.
Polymersomes biodégradables à double ciblage pour l'administration ciblée de médicaments contre la maladie de Parkinson
par Sarah NIETO (Laboratoire de Chimie des Polymères Organiques)
Cette soutenance a lieu à 9h30 - Amphithéâtre du CRPP 115 Avenue du Dr Albert Schweitzer, 33600 Pessac
devant le jury composé de
- Sébastien LECOMMANDOUX - Full professor - Bordeaux INP - Directeur de these
- Hélène VAN DEN BERGUE - Associate Professor - Université de Montpellier, Institut des Biomolécules Max Mousseron - Rapporteur
- Nicolas TAPIS - Directeur de recherche - Université Paris-Saclay, Institut Galien - Rapporteur
- Jan VAN HEST - Full professor - Eindhoven University of Technology - Examinateur
- Sylvestre GRIZOT - Ingénieur de recherche - Medincell - Examinateur
- Guillaume FLEURY - Full professor - Université de Bordeaux, LCPO - Examinateur
- Angela MUTSCHLER - Assistant professor - Université de Bordeaux, LCPO - Examinateur
Les troubles cérébraux représentent l'un des plus grands défis en matière d'administration de médicaments, principalement en raison de la barrière hémato-encéphalique (BHE), qui limite considérablement le passage d'agents thérapeutiques vers le système nerveux central. Les avancées majeures en nanomédecine reposent sur la conception de nanovecteurs capables d'encapsuler des principes actifs, de franchir des barrières biologiques complexes et de délivrer les médicaments de manière ciblée. Les polymersomes biodégradables apparaissent comme des systèmes innovants prometteurs pour l'administration de médicaments, grâce à leur capacité d'encapsulation, leur fonctionnalisation potentielle de surface et leur délivrance contrôlée via l'ingénierie membranaire. Toutefois, leur formulation est souvent limitée par la complexité intrinsèque de l'auto-assemblage, où la compétition entre structures thermodynamiquement favorables et états cinétiquement piégés rend difficile l'obtention de populations homogènes de vésicules. Cette thèse propose une approche rationnelle pour la conception expérimentale et la fabrication de polymersomes de taille nanométrique à partir de copolymères à blocs poly(éthylène glycol)-block-poly(D,L-lactide) (PEG-b-PDLLA) et poly(éthylène glycol)-block-poly(D,L-lactide-co-glycolide) (PEG-b-PLGA) par une méthode d'échange de solvant. La dégradation du PDLLA et du PLGA, ainsi que l'acidification qu'ils génèrent, ont été étudiées en lien avec l'encapsulation de différentes molécules hydrophiles pendant l'auto-assemblage des polymersomes et leur libération ultérieure induite par leur dégradation. Cette nanoplatforme offre une double action thérapeutique visant à restaurer la fonction lysosomale altérée dans les neurones dopaminergiques dans le cas de la maladie de Parkinson, en combinant la libération contrôlée d'un neuroprotecteur encapsulé dans les polymersomes avec l'acidification générée par la dégradation des copolymères. Le design des polymersomes a été amélioré par la mise en œuvre d'une stratégie de double ciblage, en fonctionnalisant leur surface avec des ligands actifs pour favoriser la pénétration de la BHE et l'internalisation dans les neurones dopaminergiques lors des évaluations in vivo. Les études in vitro ont démontré le potentiel thérapeutique de cette approche, mettant en évidence une stratégie innovante et prometteuse pour le traitement de la maladie de Parkinson.
ED Droit
La femme sous l'angle des droits fondamentaux
par Jeanne BARSALI (INSTITUT DE SCIENCES CRIMINELLES ET DE LA JUSTICE)
Cette soutenance a lieu à 14h00 - 1K Université de Bordeaux, Pôle Juridique et Judiciaire, 35 place Pey Berland - CS 61751 - 33076 Bordeaux Cedex
devant le jury composé de
- Charlotte CLAVERIE-ROUSSET - Professeur des universités - Université de Bordeaux - Directeur de these
- Ingrid MARIA - Professeur des universités - Université Grenoble Alpes - Rapporteur
- Paul CAZALBOU - Professeur des universités - Université Toulouse 1 Capitole - Rapporteur
- Jérôme PORTA - Professeur des universités - Université de Bordeaux - Examinateur
Les droits fondamentaux, par leur universalité, visent à protéger les valeurs les plus essentielles de tout individu. Leur effectivité suppose cependant le respect du principe d'égalité, lequel ne se limite pas à un traitement uniforme : il implique que des situations différentes appellent un traitement différencié, afin d'assurer une égalité réelle. Or, les femmes, en raison de spécificités biologiques et sociales qui leur sont propres, se trouvent souvent dans des situations particulières qui justifient une protection accrue. Cette spécificité conduit à distinguer deux formes de protection. La première, explicite, consiste à prévoir des dispositifs visant directement les femmes dans les situations qui ne les concernent qu'elles, comme la grossesse ou la maternité. La seconde, implicite, agit par l'intermédiaire de normes générales applicables à tous, mais dont les femmes demeurent les principales bénéficiaires en raison de leur exposition particulière à certains phénomènes sociaux. Tel est notamment le cas des violences conjugales, où les femmes représentent la grande majorité des victimes. L'articulation de ces deux formes de protection révèle néanmoins des insuffisances structurelles. Les textes, bien que nombreux, se heurtent à une application imparfaite, qui laisse subsister un écart significatif entre la proclamation des droits et leur effectivité concrète. De plus, certaines problématiques spécifiques aux femmes demeurent insuffisamment encadrées ou ignorées par le législateur, ce qui entretient des discriminations persistantes dans des domaines essentiels tels que l'économie ou la santé. L'analyse met ainsi en lumière la nécessité d'un double mouvement : d'une part, renforcer l'application et l'efficacité des dispositifs existants afin d'assurer leur pleine effectivité ; d'autre part, envisager de nouvelles pistes d'amélioration pour combler les lacunes actuelles et garantir une protection plus complète et plus équitable des droits fondamentaux des femmes.
Les mutations du travail au prisme de la plateformisation
par Kieran VAN DEN BERGH (COMPTRASEC - Centre de Droit Comparé de Travail et de la Sécurité Sociale)
Cette soutenance a lieu à 14h00 - Salle des thèses Bâtiment C, 16 avenue Léon Duguit, 33600 Pessac
devant le jury composé de
- Isabelle DAUGAREILH - Directeur de recherche émérite - Université de Bordeaux - Directeur de these
- Alexandre FABRE - Professeur agrégé - Paris 1 Panthéon Sorbonne - Rapporteur
- Stéphane VERNAC - Professeur agrégé - Université de Picardie - Jules Verne - Rapporteur
- Simon DEAKIN - Professeur - Université de Cambridge - Examinateur
- Gilles AUZERO - Professeur agrégé - Université de Bordeaux - Examinateur
- Emmanuelle MAZUYER - Directrice de recherche - Université Lyon 2 - Examinateur
La plateformisation du travail constitue l'une des transformations majeures du monde du travail contemporain. Les opérateurs, s'appuyant sur des outils numériques connectés, ont développé des modes d'organisation qui renouvellent profondément l'expression du pouvoir. Cette thèse étudie les mutations que la plateformisation fait subir au travail et aux travailleurs, ainsi que les réponses du droit français. Face à ce phénomène, le législateur a créé des régimes proclamant l'indépendance des travailleurs de plateformes tout en leur octroyant certaines garanties sociales. Or, la thèse démontre que la plupart sont dépourvus des moyens matériels et juridiques de leur indépendance. Une distinction séparant les entrepreneurs véritables, qui détiennent ces moyens, et les entrepreneurs fictifs, formellement indépendants mais matériellement subordonnés, devient nécessaire. En insérant un statut tiers dans le Code du travail pour accueillir des « faux indépendants », le législateur permet l'émergence d'un sous-salariat, exclu des protections du droit commun, qui menace l'intégrité du droit du travail. La thèse propose deux concepts centraux. La « subordination numérique » identifie d'abord les modes d'expression du pouvoir et révèle les outils de son intensification. Les opérateurs exercent leur autorité non plus par des ordres directs, mais via la normativité technique de leurs outils qui canalisent, surveillent et sanctionnent les comportements. Cette subordination s'exerce sur une masse de travailleurs anonymes et substituables, créant une contrainte collective qui dissout l'individu dans un système de gestion algorithmique. La « neutralité professionnelle des opérateurs » constitue ensuite un critère central de classification. Il distingue deux catégories d'opérateurs. Ceux qui fournissent un service de mise en relation et qui laissent les travailleurs développer une activité indépendante ainsi qu'une clientèle qui leur est propre, d'une part, et, d'autre part, ceux qui utilisent leurs plateformes pour intégrer une force de travail au sein de leur entreprise en imposant des tarifs et des standards, en évaluant les travailleurs et en sanctionnant les comportements déviants. Les deux utilisent des « plateformes de mise en relation par voie électronique » mais le premier reste professionnellement neutre, en se mettant au service du travailleur alors que le second intègre le travailleur au sein de son service. La thèse défend une lecture orthodoxe : seuls les travailleurs véritablement indépendants peuvent être exclus des garanties du droit du travail. Les régimes créés pour les travailleurs indépendants de plateformes ne doivent s'appliquer qu'à cette seule catégorie. Les travailleurs soumis à la subordination numérique relèvent quant à eux du salariat. C'est pourquoi la thèse défend un contrat de travail spécial, adapté aux spécificités du travail de plateforme. Interroger en droit le phénomène de plateformisation du travail révèle enfin un défi encore plus fondamental : la numérisation du travail permet de dégager une double plus-value. À l'exploitation classique de la force de travail s'ajoute une exploitation numérique tout à fait inédite. En capturant la représentation numérique de chaque prestation, les opérateurs accumulent des données pouvant nourrir des systèmes d'intelligence artificielle qui apprennent du travail humain pour s'y substituer. Le travailleur forme ainsi, à son insu, les systèmes qui le rendront obsolète. Cette absorption numérique place le droit du travail face à ses limites et justifie que la thèse ouvre des perspectives. La thèse conclut que le travail n'est pas une marchandise et que le marché ne peut obtenir le bénéfice d'une force de travail subordonnée sans offrir les garanties qu'impose cette condition. Face à la plateformisation qui réduit le travail à un bien liquide et consommable, le droit du travail doit adapter ses outils sans renoncer à ses principes pour préserver la condition humaine au travail.
ED Sciences de la Vie et de la Santé
Etude des effets potentiels de l'exposition aux signaux 5G sur le stress oxidative et la reparation de l'AND des cellules de la peau.
par Jana HAIDAR (Laboratoire de l'Intégration du Matériau au Système)
Cette soutenance a lieu à 9h00 - Amphi J.P.DOM A0.85 IMS laboratory / UMR 5218 Bordeaux University - Batiment A31 351 av de la libération 33400 Talence
devant le jury composé de
- Yann PERCHERANCIER - Directeur de recherche - Université de Bordeaux - Directeur de these
- Yvan CANITROT - Directeur de recherche - Université de Toulouse , UMR 5077 - MCD - Molecular, Cellular and Developmental Biology Unit Equipe : Chromatin and Cell Proliferation - Examinateur
- Oceane MARTIN - Associate Professor - Université de Bordeaux - Institut de Biochimie et Génétique Cellulaires - Examinateur
- Nicolas FORAY - Directeur de recherche - Unité INSERM UMR 1296 - Rapporteur
- Marie-Pierre ROLS - Directrice de recherche - Université de Toulouse - Rapporteur
La bioélectromagnétique étudie la manière dont les champs électromagnétiques (CEM) interagissent avec les systèmes biologiques et affectent leur fonctionnement. Si les effets thermiques des champs de radiofréquences (RF) — tels que l'échauffement tissulaire — sont bien établis et constituent la base des normes de sécurité actuelles, les effets non thermiques à faibles niveaux d'exposition demeurent mal compris et font l'objet de résultats contradictoires dans la littérature. Avec le déploiement massif des technologies sans fil, l'exposition humaine aux CEM-RF a considérablement augmenté, soulevant des inquiétudes quant à leurs impacts possibles sur les réponses cellulaires au stress, en particulier le stress oxydatif et les dommages à l'ADN. Ce travail doctoral a examiné si des CEM-RF modulés en 5G à 3,5 GHz, appliqués à des débits d'absorption spécifique (DAS) représentatifs de l'environnement (0,08 et 4 W/kg), pouvaient induire un stress oxydatif ou interférer avec la réparation de l'ADN dans des cellules cutanées humaines in vitro. Des sondes BRET (Bioluminescence Resonance Energy Transfer) ont été spécifiquement développées pour caractériser la voie antioxydante KEAP1–NRF2 (Kelch-like ECH-associated protein 1 – Nuclear factor (erythroid-derived 2)-like 2) et le complexe de reconnaissance des dommages à l'ADN DDB1 (Damage-specific DNA-binding protein 1) / DDB2 (Damage-specific DNA-binding protein 2), afin de fournir des mesures de référence respectivement pour le stress oxydatif et la réparation de l'ADN. Toutefois, malgré une conception réussie et une validation initiale, ces sondes développées ne se sont pas révélées suffisamment reproductibles et n'ont donc pas été utilisées dans les expériences ultérieures impliquant une exposition aux CEM-RF. En alternative, nous avons employé les biocapteurs redox ROBINy basés sur le BRET, ciblant soit le cytosol soit la mitochondrie, afin de permettre un suivi en temps réel de la dynamique des espèces réactives de l'oxygène (ROS) sur une période de 24 heures. Ces essais ont été réalisés à la fois sous exposition RF seule et en combinaison avec des inducteurs bien caractérisés de ROS (H₂O₂, KP372-1 et antimycine A). Nous avons également quantifié les dimères de pyrimidine cyclobutane (CPD) — un marqueur caractéristique des dommages à l'ADN induits par les UVB — jusqu'à 48 heures après une co-exposition aux CEM-RF 5G et à une irradiation UVB (20 mJ/cm²), afin d'évaluer un impact potentiel sur la réparation par excision de nucléotides (NER). Dans des conditions rigoureusement contrôlées, incluant une dosimétrie validée et une température constante, les CEM-RF modulés en 5G à 3,5 GHz n'ont pas induit de stress oxydatif dans des fibroblastes immortalisés XP6BE. Ils n'ont pas non plus augmenté la production de ROS en présence d'inducteurs établis, que ce soit par des effets directs ou adaptatifs. De même, aucune interaction n'a été observée entre l'exposition 5G et l'irradiation UVB sur la réparation des dommages à l'ADN via la voie NER dans les kératinocytes HaCaT. Dans l'ensemble, ces résultats apportent des preuves solides que, dans le cadre expérimental testé, l'exposition aux CEM-RF 5G n'altère ni l'équilibre oxydatif ni la réparation de l'ADN, et ils fournissent des données précieuses pour l'évaluation, fondée sur les preuves, des risques sanitaires potentiels associés aux technologies 5G.
PREPARATIONS BIODYNAMIQUES EN VITICULTURE: Perceptions professionnelles et analyse de leurs effets sur le développement de la vigne et de la baie de raisin.
par Manuela BRANDO PRADILLA (Oenologie)
Cette soutenance a lieu à 14h00 - Amphithéâtre Institut des sciences de la vigne et du vin 210 Chemin de Leysotte, 33140 Villenave-d'Ornon
devant le jury composé de
- Laurence GENY - Professeure des universités - Université de Bordeaux - Directeur de these
- Markus RIENTH - Professeur des universités - Université de Changins - Rapporteur
- Chantal MAURY - Professeure des universités - Ecole Supérieure des Agricultures (ESA) Angers - Rapporteur
- Jordi BALLESTER - Maître de conférences - Université de Bourgogne - Examinateur
- Gilles DE REVEL - Professeur des universités - Université de Bordeaux - Examinateur
L'agriculture biodynamique, fondée par Rudolf Steiner en 1924, découle d'une série de conférences abordant les enjeux de rendement et de santé des cultures face à l'usage croissant d'intrants chimiques. Steiner concevait la ferme comme un organisme vivant, où chaque élément — sols, plantes et environnement — interagit de manière synergique. Il préconisait l'utilisation de préparations organiques et minérales, comme la préparation P500 (bouse de corne) et la préparation P501 (silice de corne), pour soutenir la santé du sol et des plantes. Cette approche a eu un impact notable sur l'agriculture biologique et s'aligne avec les principes de l'agroécologie, visant à promouvoir des systèmes agricoles durables. Bien que la biodynamie soit considérée comme ésotérique ou pseudo-scientifique, elle gagne en reconnaissance dans le paysage agricole : un nombre croissant de fermes adoptent ces pratiques, et les viticulteurs s'interrogent sur l'intégration de ces méthodes dans leur production. Ce travail vise à (i) mieux comprendre la vision de la filière sur la biodynamie à travers une analyse textuelle des représentations, (ii) identifier les métabolismes impactés par les préparations biodynamiques par diverses approches, incluant des mesures de terrain et des analyses fines biochimiques et microscopiques, et (iii) rassembler des éléments factuels pour améliorer les pratiques, notamment dans le vignoble bordelais. L'analyse textuelle révèle quatre perceptions au sein de la filière, oscillant entre curiosité et scepticisme, et souligne l'importance du respect des perspectives individuelles et des échanges entre vignerons pour instaurer un dialogue constructif. L'application des préparations biodynamiques montre des effets variables selon les paramètres étudiés. Il n'y a pas d'influence sur la phénologie, la vigueur et l'expression végétative de la vigne, mais un ralentissement de la croissance, probablement en raison d'une régulation hydrique différente. Les vignes présentent une résistance accrue aux pathogènes grâce à une stimulation de certains métabolismes de défense. La fertilité potentielle est améliorée avec une augmentation du nombre de primordia inflorescentiels dans le bourgeon et de fleurs. En revanche, après débourrement, l'induction et l'initiation florale sont fortement régulées. Les baies et les grappes sont plus petites et plus légères, ce qui peut entraîner une réduction du rendement inférieure à 10 %. Pour la première fois, cette étude examine l'impact des préparations biodynamiques sur la maturation de la pellicule des raisins. Une régulation hormonale modifiée et une inhibition des enzymes de dégradation des pellicules conduisent à des parois cellulaires moins facilement dégradables et à des pellicules plus épaisses, ralentissant la croissance des baies par expansion cellulaire du mésocarpe et réduisant la sensibilité des baies vis-à-vis des pathogènes. Ces effets se traduisent dans le vin par une extractibilité des composés phénoliques réduite pour la modalité biodynamique.
ED Sciences Physiques et de l'Ingénieur
Origine et propriétés des planètes errantes
par Tommy RODRIGUES (Laboratoire d'Astrophysique de Bordeaux)
Cette soutenance a lieu à 14h00 - Salle Univers Laboratoire d'Astrophysique de Bordeaux Université de Bordeaux - Bât B18N, allée Geoffroy Saint-Hilaire CS 50023, 33615 Pessac Cedex, France
devant le jury composé de
- Hervé BOUY - Professeur des universités - Université de Bordeaux - Directeur de these
- Estelle MORAUX - Professeure - Université Grenoble Alpes - Rapporteur
- Jean-Louis MONIN - Professeur émérite - Université Grenoble Alpes - Rapporteur
- Sylvain BONTEMPS - Directeur de recherche - Université de Bordeaux - Examinateur
- Timea CSENGERI - Chargée de recherche - Université de Bordeaux - Examinateur
- Gaspard DUCHENE - Astronome adjoint - Université Grenoble Alpes - Examinateur
Les planètes errantes (FFPs) sont des objets de masse planétaire qui n'orbite autour d'aucune étoile, mais errent isolément dans la Galaxie. Avec une masse inférieure à la limite de fusion du deutérium (<13 masses joviennes, MJup), les FFPs ne peuvent soutenir aucune réaction de fusion nucléaire et se refroidissent donc continuellement, devenant faibles et difficiles à détecter. Cependant, durant leurs premiers millions d'années, elles restent suffisamment chaudes et brillantes dans l'infrarouge pour être directement détectables dans les régions de formation stellaire jeunes et proches. Les FFPs peuvent se former soit comme des planètes massives éjectées de disques protoplanétaires à la suite d'interactions dynamiques, soit comme les produits les moins massifs de la formation stellaire, à partir de l'effondrement de minuscules nuages moléculaires ou de l'accrétion interrompue sur un cœur protostellaire. La contribution relative de chaque mécanisme reste inconnue. Un diagnostic observationnel clé pour tester les théories de formation des FFPs réside dans la présence et les propriétés de leurs disques circumstellaires, car les différents scénarios prédisent des fractions et des propriétés de disques distinctes. Cette thèse présente une étude statistique de la présence de disques autour des membres de faible masse de l'association du Haut Scorpion (USC), proche (145 pc) et jeune (5–10 Myr), qui abrite une population riche récemment identifiée de dizaines de FFPs. Pour identifier les disques via leur excès d'émission dans l'infrarouge (IR), une première approche basée sur l'ajustement de distributions spectrales d'énergie par des modèles atmosphériques a été employée. Celle-ci a révélé les limites des modèles actuels pour la détection d'excès IR chez les objets de masse planétaire, probablement dues à un traitement incomplet des nuages à basses températures. Cela a motivé le développement d'une méthode empirique fondée sur les couleurs photométriques et combinée à une détection bayésienne des valeurs aberrantes utilisant la photométrie unWISE pour modéliser de manière robuste la séquence photosphérique des objets sans disque et identifier ceux présentant un excès IR dans la couleur (W1–W2). Cette approche a permis de dériver des fractions de disque jusqu'à 6–8 MJup, selon l'âge supposé, étendant considérablement les études précédentes dans le domaine des masses planétaires et incluant 17 à 40 FFPs, soit l'échantillon le plus complet à ce jour. Les résultats révèlent une augmentation continue de la fraction de disque vers les plus faibles masses, dépassant 30%, ainsi qu'un possible aplatissement en dessous de 25–45 MJup, pouvant indiquer une transition dans les processus de formation dominants. Ce changement de tendance doit toutefois être considéré avec prudence et nécessite une confirmation. En parallèle, des observations à 1.3 mm ont été menées avec l'interféromètre NOEMA, ciblant six FFPs présentant des excès IR dans la jeune association du Taureau. Une source a été détectée, avec un flux traduit en une masse de poussière de 0,17–0,66 masses terrestres, plaçant ce disque parmi les moins massifs jamais observés et doublant le nombre de détections millimétriques de disques autour de FFPs. La masse du disque déduite s'aligne avec l'extrapolation de la relation Mdust-Mstar jusqu'aux masses planétaires, suggérant une continuité avec les populations plus massives et favorisant une formation par effondrement du cœur plutôt que par éjection, qui aurait dépouillé le disque de sa matière. En conclusion, ce travail apporte de nouvelles contraintes sur la fraction de disques jusqu'au régime des masses planétaires grâce à une détection d'excès IR reproductible, ouvrant la voie à son application à d'autres populations. Il rapporte également la seconde détection millimétrique d'un disque autour d'une FFP, soulignant la nécessité cruciale d'accroître les détections à l'extrémité inférieure de la distribution de masse des disques.
Instabilités hydrodynamiques dans les fluides binaires présentant un écart de miscibilité.
par Anubhav DUBEY (I2M - Institut de Mécanique et d'Ingénierie de Bordeaux)
Cette soutenance a lieu à 10h00 - Amphi 1 Amphi 1 Batiment A9
devant le jury composé de
- Sakir AMIROUDINE - Professeur - I2M, Université de Bordeaux - Directeur de these
- Omar MATAR - Professor - Department of Chemical Engineering, Imperial College London - Rapporteur
- Christian RUYER-QUIL - Professeur - LOCIE, Université Savoie Mont Blanc - Rapporteur
- Rama GOVINDARAJAN - Professeure - ICTS-TIFR - Examinateur
- Marie-Charlotte RENOULT - Associate Professor - CORIA, INSA Rouen Normandie - Examinateur
- Patrice LE GAL - Directeur de recherche - IRPHE, Aix Marseille Université - Examinateur
- Jean-Pierre DELVILLE - Directeur de recherche - LOMA, University of Bordeaux - Examinateur
Deux fluides peuvent passer de l'état immiscible à celui de miscible avec un stimulus extérieur. Une valeur critique de ce stimulus régit le processus de mélange ou de ségrégation de phase. Les stimuli externes peuvent être la température (cas présent), la concentration ou le pH du système. Une étude approfondie de la réponse de la paire de fluides binaires à un tel stimulus est nécessaire pour comprendre le comportement fondamental de l'écoulement et est essentiel dans diverses applications telles que l'administration ciblée de médicaments, le transfert de masse liquide-liquide, ou le contrôle des écoulements, etc. Dans une perspective plus large visant à élucider les caractéristiques fondamentales de l'écoulement, trois instabilités hydrodynamiques différentes—à savoir l'instabilité de Rayleigh-Taylor (RT), l'instabilité de Kelvin-Helmholtz (KH) et l'instabilité de Rayleigh-Bénard-Marangoni (RBM) ont été étudiées. Une nouvelle approche de modèle de champ de phase incorporant un cadre de miscibilité variable est proposée. La variation du degré de cette miscibilité dans ces fluides binaires affecte les propriétés thermo-physiques qui entraîne par conséquent une variation de la dynamique des instabilités hydrodynamiques. L'instabilité de RT correspond à l'évolution d'une interface perturbée entre deux fluides superposés soumise à une accélération externe dirigée du fluide le plus dense vers le moins dense. L'évolution spatio-temporelle de la perturbation est gouvernée par la compétition entre les forces de flottabilité et la tension de surface. Une analyse de stabilité linéaire et paramétrique de la relation de dispersion révèle trois schémas de croissance qualitativement distincts pour l'évolution temporelle de la perturbation. Par la suite, des simulations numériques non linéaires sont effectuées pour corroborer ces résultats. L'analyse aux temps longs révèle en outre l'apparition d'instabilités secondaires sous forme de structures de KH dépendant du degré de miscibilité partielle. L'instabilité de KH résulte d'un cisaillement à l'interface entre deux fluides. Les simulations numériques comportent deux configurations différentes basées sur l'état thermodynamique du système. Dans la première configuration, la paire de fluides est supposée être à l'équilibre thermodynamique à une température inférieure à la température critique, afin d'étudier l'effet de la tension de surface effective, du degré de stratification et du profil d'écoulement cisaillé. Dans la deuxième configuration, la paire de fluides est initialisée dans un état immiscible/partiellement miscible, et est ensuite conduite vers un état complètement miscible. Les résultats révèlent la compétition entre la forme vive de l'interface induite par l'advection et son élargissement induit par la diffusion, en fonction de la tension de surface initiale de la paire de fluides. Enfin, l'instabilité de RBM correspond à l'apparition de la convection libre dans une paire de fluides placés dans un champ de gravité en présence, dans le cas présent, d'une différence de température. Dans ce travail, on considère une paire de fluides binaires spécifique—FC72 et huile de silicone 1cSt dont on connaît certaines propriétés physiques en fonction de la proximité de son point critique. Une analyse de stabilité linéaire est réalisée en utilisant la méthode pseudo-spectrale de Chebyshev pour déterminer le nombre de Rayleigh critique en fonction des rapports de hauteur des couches de fluides et du degré de miscibilité partielle. L'effet Marangoni est analysé de manière paramétrique. Les résultats révèlent une diminution monotone de la propension du système à présenter une convection oscillatoire à mesure que la paire de fluides approche de la température critique. Par la suite, les valeurs propres sont calculées afin de déterminer la fréquence maximale d'oscillation, et donc la période minimale d'oscillation.
ED Sciences et environnements
Modélisation des évolutions passées et futures des littoraux sableux
par Mohammad TRABOULSI (Environnements et Paléoenvironnements Océaniques et Continentaux)
Cette soutenance a lieu à 14h00 - Amphithéâtre PABA, Bâtiment B5 Allée Geoffroy Saint-Hilaire, CS 50023, 33615 Pessac
devant le jury composé de
- Bruno CASTELLE - Directeur de recherche - Université de Bordeaux - Directeur de these
- Déborah IDIER - Directrice de recherche - BRGM - CoDirecteur de these
- Angélique MELET - Chargée de recherche - LEGOS – CNES/CNRS/IRD/Université de Toulouse - Examinateur
- Alexandra TOIMIL - Ingénieure de recherche - Universidad de Cantabria - Examinateur
- Nadia SÉNÉCHAL - Professeure des universités - EPOC – UMR5805, CNRS–Université de Bordeaux - Examinateur
- Albert FALQUÉS - Professeur des universités - Universitat Politècnica de Catalunya (UPC) - Rapporteur
- Julien CHAUCHAT - Directeur de recherche - Laboratoire des Écoulements Géophysiques et Industriels (LEGI – UMR5519), Univ.GrenobleAlpes / CNRS / GrenobleINP. - Rapporteur
Cette thèse développe LX-ST, un cadre de modélisation à complexité réduite pour simuler l'évolution du trait de côte à moyen et long terme sous l'effet de l'élévation du niveau de la mer (SLR). LX-ST couple ShoreTrans, qui calcule la translation du profil en réponse à la SLR, avec LX-Shore, qui résout le transport sédimentaire longitudinal et l'évolution en plan du trait de côte. En reliant l'ajustement transversal aux gradients longitudinaux, le cadre permet des simulations morphodynamiques 3D efficaces tout en préservant les rétroactions clés qui contrôlent l'évolution des côtes sableuses aux échelles décennales à séculaires. Les tempêtes de court terme sont considérées comme une variabilité haute fréquence superposée aux tendances de fond. L'approche est d'abord testée sur des cas synthétiques représentant à la fois des côtes libres et des côtes contraintes par des ouvrages, montrant des comportements cohérents de basculement, de translation et de changements de trajectoire selon les stratégies de couplage. Elle est ensuite appliquée à un système plage–dune de 5 km à Lacanau (sud-ouest de la France), bordé par une digue frontale. En utilisant la topobathymétrie locale et la houle régionale, LX-ST reproduit les patrons de recul décennal et les contrastes spatiaux amont–aval de l'ouvrage, démontrant sa pertinence à l'échelle visée. À partir de ce cas, la thèse conduit une analyse de sensibilité globale sous trois scénarios d'élévation du niveau de la mer (SSP2-4.5, SSP5-8.5, High-End). Les indices de Sobol de premier ordre quantifient la contribution des incertitudes d'entrée aux projections du trait de côte. Les résultats montrent que la trajectoire de SLR et le taux d'érosion de fond sont les principaux contributeurs à la variance, tandis que des interactions liées à l'orientation du trait de côte, à l'évolution de la profondeur de fermeture et aux gradients induits par les ouvrages produisent des réponses non linéaires et des enveloppes de changement spatialement hétérogènes. Selon les scénarios, les reculs attendus sont de l'ordre de O(10² m) à l'horizon 2100, avec des amplifications locales lorsque l'espace d'accommodation est limité et l'apport sédimentaire restreint. LX-ST n'a pas vocation à fournir une prévision opérationnelle déterministe mais à offrir un outil transparent et efficace pour explorer l'espace des scénarios, identifier les facteurs les plus influents et révéler où et quand les rétroactions morphodynamiques peuvent modifier les trajectoires côtières. Ce cadre soutient l'adaptation côtière en éclairant la structure des incertitudes et les motifs spatiaux d'évolution, tout en restant compatible avec les données de site et les contraintes de gestion.
Évolution de la plasticité de traits d'histoire de vie d'Hymenoscyphus fraxineus, un pathogène forestier en expansion
par Clémence BECANS (BIOGECO - BIOdiversité, Gènes & Communautés)
Cette soutenance a lieu à h00 - Airial 69 route d'Arcachon, bâtiment Airial, 33610 Cestas
devant le jury composé de
- Jean-Paul SOULARUE - Ingénieur - INRAE - Directeur de these
- Anne-Sophie WALKER - Ingénieure de recherche - INRAE - Rapporteur
- Pascal FREY - Directeur de recherche - INRAE - Rapporteur
- Cécile ROBIN - Directrice de recherche - INRAE - CoDirecteur de these
- Chloé DELMAS - Directrice de recherche - INRAE - Examinateur
- Mathieu LAPARIE - Chargé de recherche - INRAE - Examinateur
Trente ans après son émergence en Europe du nord, la chalarose du frêne continue de se propager à travers le continent, déstabilisant les écosystèmes où le frêne commun (Fraxinus excelsior) prédomine. Cette maladie est causée par Hymenoscyphus fraxineus, un champignon pathogène ascomycète à reproduction sexuée. Malgré un fort goulot d'étranglement génétique lors de son introduction depuis la Mandchourie, le champignon s'est établi dans des environnements très diversifiés. La plasticité d'un caractère phénotypique correspond à la variation de l'expression de ce caractère dans des environnements changeants. Nous avons testé l'hypothèse selon laquelle la propagation de la chalarose est associée à l'évolution de la plasticité de caractères adaptatifs d'H. fraxineus. Dans le cadre d'une approche synchronique, nous avons échantillonné des pétioles de frênes communs infectés par H. fraxineus dans cinq sites situés le long d'un gradient latitudinal nord-sud (Lituanie, Danemark, Suisse, France et Italie), puis constitué cinq populations d'H. fraxineus. Ces populations présentent des histoires épidémiologiques contrastées et sont exposées à différentes conditions climatiques et espèces de frênes. Une première série d'expériences nous a permis d'évaluer la plasticité de la croissance et de la survie mycéliennes in vitro en fonction du degré d'humidité et de la température. Aucune différence de plasticité de la croissance mycélienne en réponse à l'humidité n'a été observée entre les populations étudiées, ni de différence de croissance ou de survie dans des conditions de température basse (3 °C, 6 °C) ou modérée (22 °C). En revanche, les isolats de la population italienne, la plus méridionale de notre dispositif, ont présenté une croissance à température élevée (26 °C) nettement supérieure à celle des isolats des autres populations. À l'inverse, la viabilité du mycélium des isolats lituaniens a diminué plus rapidement à haute température (> 30 °C) que celle des isolats issus des autres populations. Les isolats des populations de Lituanie et d'Italie ont été inoculés sur les pétioles de feuilles de jeunes plants de frêne. Aucune différence d'agressivité n'a été observée sur F. excelsior à 22 °C entre les deux populations. Cependant, l'agressivité, mesurée à l'aide de trois critères, s'est avérée, pour les isolats italiens, globalement moins plastique à la température (22° versus 26°C) et à l'espèce hôte (F. excelsior versus F. ornus, présent uniquement dans le sud de l'Europe et plus résistant à la chalarose) que chez les isolats lituaniens. Aucune différence d'agressivité sur tige n'a été mise en évidence entre deux les populations à 22°C sur F. excelsior. Le troisième volet de cette thèse est consacré à la relation entre phénologie de la fructification d'H. fraxineus et conditions de température. Dans ce cadre, nous avons échantillonné des rachis de frênes présentant des signes d'infections au nord de la France, au sud de la France et en Italie. Après 12 semaines d'incubation à 22°C et 26°C, nous avons constaté une phénologie de la fructification plus précoce chez la population italienne d'H. fraxineus que chez les populations françaises à ces deux températures. Dans l'ensemble, nos résultats suggèrent une adaptation d'H. fraxineus aux conditions biotiques et abiotiques du sud de l'Europe et mettent en lumière la menace que peut représenter le pathogène dans cette région, alors même que sa propagation et la sévérité de la chalarose y étaient estimées limitéés. Plus globalement, nos résultats rappellent la nécessité d'intégrer l'évolution de la plasticité phénotypique des pathogènes, dans les modèles prédictifs du risque épidémique dans les écosystèmes forestiers.
ED Sociétés, Politique, Santé Publique
Politiques éducatives et enseignement islamique au Sénégal : Analyse de la modernisation des daara et de l'institutionnalisation des écoles franco-arabes.
par Mouhamed GUEYE (Laboratoire Cultures, Education, Sociétés)
Cette soutenance a lieu à 14h00 - Salle des thèses 3ter Place de la Victoire, 33000 Bordeaux
devant le jury composé de
- Jean-François BRUNEAUD - Professeur - Université de Bordeaux - Directeur de these
- Sarah CROCHE - Professeure - Université de Picardie - Rapporteur
- Mahamet TIMERA - Professeur - Université Paris Diderot Paris 7 (UFR Sciences sociales) - Rapporteur
- Mamadou bouna TIMERA - Professeur - Université Cheikh Anta Diop Dakar (UCAD) - Examinateur
Cette recherche, intitulée Politiques éducatives et enseignement islamique au Sénégal : analyse de la modernisation des daara et de l'institutionnalisation des écoles franco-arabes, examine les dynamiques qui traversent l'enseignement islamique dans un contexte de réformes éducatives. Depuis les années 2000, l'État sénégalais, appuyé par ses partenaires techniques et financiers, met en œuvre des politiques visant à moderniser les daara (écoles coraniques), notamment à travers le Programme d'Amélioration de la Qualité et de l'Équité de l'Éducation de Base (PAQEEB), et à intégrer les écoles franco-arabes dans le système public. Ces réformes produisent des résultats contrastés et révèlent de profondes tensions structurelles et politiques. La problématique centrale interroge la manière dont les enjeux politiques, économiques, éducatifs, religieux et internationaux liés à ces réformes affectent l'autonomie de l'État et redéfinissent l'enseignement islamique. Deux décennies après leur lancement, ces politiques apparaissent inachevées, tout en transformant le paysage éducatif islamique. L'étude poursuit deux objectifs : analyser l'autonomie politique et économique de l'État face aux pressions locales et internationales ; et examiner les recompositions internes de l'enseignement islamique, à travers les daara et les écoles franco-arabes. Le cadre théorique mobilise trois concepts clés: modernisation, institutionnalisation et enjeu pour saisir ces réformes comme des processus multidimensionnels où se confrontent logiques étatiques, influences internationales et résistances locales. La méthodologie repose sur une triangulation : entretiens avec des acteurs institutionnels, éducatifs et religieux ; observations de terrain ; et analyse documentaire des textes officiels et projets éducatifs. Les résultats montrent d'abord les limites de l'État dans la mise en œuvre des réformes. Si le PAQEEB a introduit une certaine flexibilité, son efficacité reste compromise par la dépendance financière, l'insuffisance d'infrastructures et la méfiance des maîtres coraniques. Par ailleurs, l'État privilégie les écoles franco-arabes, plus facilement intégrables au système national, au détriment des daara traditionnels. Ce choix renforce paradoxalement l'autonomie des acteurs religieux, dans un contexte marqué par l'influence déterminante des confréries, notamment la communauté mouride. La recherche met également en évidence une modernisation « par le bas », portée par des maîtres coraniques et des initiatives privées répondant à la demande sociale d'une éducation hybride. Ces daara modernisés, fréquentés par les classes moyennes et la diaspora, offrent des conditions plus attractives mais accentuent une fracture socio-économique et renforcent la privatisation partielle de l'offre éducative islamique, échappant au contrôle de l'État. En définitive, les réformes apparaissent comme des processus politiques traversés par des logiques concurrentes de pouvoir et de légitimité. L'État, pris entre pressions internationales et résistances locales, peine à concilier modernisation et enracinement culturel. L'étude, en mettant l'accent sur le PAQEEB encore peu étudié, apporte une contribution originale à la compréhension des mutations en cours et éclaire les tensions entre souveraineté éducative, influences internationales et reconfiguration des acteurs religieux et scolaires en Afrique de l'Ouest.
Etude des gestes professionnels d'enseignants auprès d'élèves en difficulté en mathématiques en cycle 2 en REP
par Anaïs HATU (Laboratoire d'épistémologie et didactiques disciplinaires, professionnelle et comparée de Bordeaux)
Cette soutenance a lieu à 14h30 - E302 INSPE de l'Académie de Bordeaux 160 avenue de Verdun Bâtiment E 33700 MERIGNAC
devant le jury composé de
- Caroline BULF - Maîtresse de conférences - Université de Bordeaux - Directeur de these
- Fabien EMPRIN - Professeur des universités - Université de Reims Champagne-Ardennes - Examinateur
- Lalina COULANGE - Professeure des universités - Université de Bordeaux - Examinateur
- Eric MOUNIER - Maître de conférences - Université Paris-Est Créteil - Examinateur
- Eric RODITI - Professeur des universités - Université Paris Cité - Rapporteur
- Julie HOROKS - Professeure des universités - Université Paris-Est Créteil - Rapporteur
Cette recherche porte sur l'étude des gestes professionnels d'enseignantes exerçant en éducation prioritaire au CP, dans le cadre de l'enseignement de la numération décimale et positionnelle, en particulier des nombres de 60 à 99. Elle vise à comprendre comment les pratiques d'étayage contribuent (ou non) à soutenir les apprentissages d'élèves en difficulté, à partir de l'analyse de séances filmées, de l'exploitation de manuels scolaires et de la comparaison entre plusieurs contextes d'enseignement. La recherche s'appuie sur un cadre théorique articulant les registres de représentation (Duval, 1993), la théorie des situations (Brousseau), et les gestes professionnels (Bucheton & Soulé, 2009), avec en arrière-plan les recherches sur les élèves en difficulté (Perrin-Glorian, Butlen). Trois classes de CP situées en éducation prioritaire ont été observées, chacune utilisant un manuel différent : Maths au CP, Haut les Maths et la Méthode Heuristique de Mathématiques (MHM). L'analyse combine une approche qualitative (analyse a priori et a posteriori des séances, codage des gestes d'étayage et du langage) et une approche quantitative (statistiques des occurrences d'interventions), complétée par un outil d'analyse : « l'arbre des possibles » (Blanchouin et al. 2022), permettant de visualiser les choix d'étayage et leurs effets potentiels sur les apprentissages. Au plan méthodologique, cette recherche propose une articulation entre analyse des manuels, observation des interactions et visualisation des étayages. Les résultats montrent que trois leviers sont déterminants dans la construction de la numération : - la coordination explicite des registres de représentation (iconique, symbolique, verbal), - la qualité et la visée des gestes langagiers, - le traitement didactique des obstacles et des erreurs, conçus comme leviers d'apprentissage. Les pratiques observées révèlent des contrastes significatifs : certaines enseignantes parviennent à transformer les erreurs en occasions de conceptualisation partagée, d'autres privilégient un guidage fort qui limite la secondarisation des savoirs. L'étude met en évidence le rôle du langage dans la régulation des apprentissages, ainsi que les difficultés spécifiques rencontrées par les élèves dans la compréhension du système décimal et positionnel.
Le patrimoine culturel comme ressource stratégique. Le cas de l'Etat islamique en Irak et en Syrie (2014-2019)
par Eva PORTEL (Centre Emile Durkheim)
Cette soutenance a lieu à 14h00 - IEP Sciences Po Bordeaux, 11 allée Ausone, 33600 Pessac
devant le jury composé de
- Mathilde LELOUP - Maîtresse de conférences - Université Paris 8 - Examinateur
- Anthony AMICELLE - Maître de conférences - Sciences Po Bordeaux - Examinateur
- Jean-Vincent HOLEINDRE - Professeur des universités - Paris 2 Panthéon-Assas - Examinateur
- Chiara RUFFA - Professeure des universités - Sciences Po - Rapporteur
- Koen VLASSENROOT - Full professor - Université de Gand - Rapporteur
Cette thèse est intitulée « Les enjeux stratégiques du patrimoine culturel en temps de conflit armé. Le cas de l'État islamique (2014-2019) ». Elle étudie le rôle joué par le patrimoine culturel dans la conflictualité armée à partir du cas de l'État islamique en Irak et en Syrie. L'argument central est que les attaques peuvent être analysés comme une triple ressource – financière, militaire et propagandiste – qui est exploitée par l'EI pour renforcer sa position dans le conflit. En cela, la thèse vise à répondre à la question de recherche suivante : quels sont les avantages stratégiques offerts par les attaques contre les biens culturels dans un conflit armé ? La recherche part de l'absence d'études théoriques sur la place du patrimoine cultuel dans la conflictualité armée, davantage pensé comme un instrument de paix et un dommage collatéral de la violence et s'attache à théoriser le patrimoine comme une ressource pour les belligérants, c'est-à-dire pendant la guerre. Après avoir détaillé les enjeux méthodologiques liés à un tel sujet, je mets en évidence trois dimensions illustrant le lien entre patrimoine en guerre : 1) Le patrimoine culturel est une ressource d'ordre financière. La création d'un monopole sur le pillage et du trafic de biens culturels constitue un apport financier pour l'EI. Ce contrôle contribue à la mise en place d'une structure quasi-administrative fonctionnant comme une assise politique sur laquelle l'EI fonde sa légitimité. Les rivalités autour du contrôle sur le trafic alimentent la conflictualité au niveau local. Au niveau international, le trafic de biens culturels participe de la définition de la sécurité internationale et devient un outil de lutte contre le terrorisme. 2) Le patrimoine culturel est une ressource d'ordre militaire. Je mets ici en évidence une typologie des usages du patrimoine pendant les affrontements armés : à des fins logistiques ou défensives ; pour initier ou mener la guerre contre l'ennemi (entrer en guerre, attaquer ou affronter l'ennemi) ; dans le cadre d'une riposte ; et comme instrument de coercition. 3) Le patrimoine est une ressource d'ordre propagandiste. Les images de destruction diffusées à grande échelle par les canaux propagandistes de l'EI contribuent à la guerre sur le plan psychologique et mettent en jeu une diversité d'acteurs impliqués dans le conflit armé.