ED Sciences de la Vie et de la Santé
Ingénierie ciblée de la niche tumorale par vecteurs lentiviraux pour améliorer l'efficacité des cellules CAR T dans le cancer du pancréas.
par Julia ROSSI (BoRdeaux Institute of onCology)
Cette soutenance a lieu à 14h00 - Amphithéâtre BBS Bâtiment BBS, Site Carreire 2 rue du Dr Hoffmann Martinot 33076 Bordeaux
devant le jury composé de
- Sandrine DABERNAT - Professeure - Université de Bordeaux - Directeur de these
- Melita IRVING - PhD, Team Leader, Senior Lecturer, Maître d'Enseignement et de Recherche de type 1 - University of Lausanne, Suisse - Rapporteur
- Jacob GIEHM MIKKELSEN - Professor - University of Aarhus C, Denmark - Rapporteur
- Alice CARRIER - Directrice de recherche - Université de Marseille - Examinateur
- Nicolas LARMONIER - Professeur - Université de Bordeaux - Examinateur
L'adénocarcinome canalaire pancréatique (PDAC) demeure l'une des tumeurs solides les plus létales, avec des options thérapeutiques limitées et un pronostic défavorable. Bien que les immunothérapies aient transformé la prise en charge de plusieurs cancers, leur efficacité dans le PDAC reste limitée. Parmi ces approches, le transfert adoptif de cellules exprimant un récepteur antigénique chimérique, ou cellules CAR T, présente un fort potentiel cytotoxique. Cependant, son application au PDAC est limitée par une infiltration tumorale insuffisante, des barrières stromales denses et un microenvironnement tumoral immunosuppresseur. Cette thèse explore l'ingénierie ciblée de la niche tumorale par vecteurs lentiviraux comme stratégie pour remodeler localement le microenvironnement du PDAC et améliorer l'efficacité des cellules CAR T. Puisqu'il n'est pas possible de transduire l'ensemble des cellules tumorales, l'approche proposée repose sur la délivrance sélective de gènes à une fraction de cellules tumorales exprimant des antigènes cibles, afin de les convertir en sources locales de signaux diffusibles immunomodulateurs et capables de remodeler le stroma. Pour permettre une délivrance restreinte à la tumeur, des vecteurs lentiviraux ont été conçus avec des glycoprotéines virales modifiées afin de reconnaître des antigènes de surface associés aux cellules tumorales. Une analyse comparative de différentes plateformes de pseudotypage a permis d'identifier les glycoprotéines dérivées du virus Sindbis comme un système robuste et polyvalent pour la transduction lentivirale antigène-dépendante de cellules de tumeurs solides. Cette plateforme de délivrance ciblée sera utilisée pour exprimer des transgènes thérapeutiques conçus pour remodeler localement la niche tumorale, notamment des chimiokines afin de favoriser l'attraction des cellules immunitaires, ainsi que la décorine afin de moduler le compartiment stromal et de faciliter l'accès à la tumeur des cellules T cytotoxiques endogènes ou transférées de manière adoptive, incluant les cellules CAR T. Dans son ensemble, ce travail soutient le concept selon lequel les vecteurs lentiviraux ciblés peuvent être utilisés comme plateformes d'ingénierie locale du microenvironnement tumoral. Cette approche pourrait constituer une stratégie complémentaire pour surmonter les principales barrières limitant l'efficacité des cellules CAR T dans le PDAC et d'autres tumeurs solides.
ED Sciences Physiques et de l'Ingénieur
Méthodes de super-résolution et sous-échantillonnage en imagerie thermique
par Florian CROUAU (I2M - Institut de Mécanique et d'Ingénierie de Bordeaux)
Cette soutenance a lieu à 9h30 - Amphithéâtre La Rochefoucauld Bât R, Campus Arts et Métiers de Bordeaux-Talence Esplanade des Arts et Métiers 33405 Talence Cedex France
devant le jury composé de
- Jean-Luc BATTAGLIA - Professeur - Université de Bordeaux - Directeur de these
- Audrey GIREMUS - Professeure - Université de Bordeaux - IMS - UMR 5218 - Examinateur
- Julien LECOMPAGNON - Docteur - Bundesanstalt für Materialforschung und -prüfung (BAM) - Examinateur
- Vincent SCHICK - Professeur - Mines Nancy - Université de Lorraine - Rapporteur
- Thomas PIERRE - Professeur - IRDL - Université de Bretagne Sud - Rapporteur
- Stéphane CHEVALIER - Maître de conférences - Université de Bordeaux - ENSAM - CoDirecteur de these
L'imagerie infrarouge permet le contrôle et l'évaluation non destructifs des matériaux, de l'échelle micrométrique à l'échelle macroscopique. Elle fournit des informations sur la surface des matériaux, comme pour l'imagerie visible, mais permet également la visualisation de la distribution de la chaleur ainsi que la caractérisation des propriétés thermiques en surface et en profondeur. La gamme de matériaux étudiés est vaste : composites pour applications aérospatiales, tissus biologiques, matériaux de construction tels que le bois ou le béton, semi-conducteurs et microbatteries. Cependant, nombre de ces applications se heurtent à des limitations physiques liées à la nature de la lumière infrarouge et aux performances actuelles des détecteurs, empêchant d'atteindre une résolution inférieure au micromètre. Cette thèse explore différentes approches pour obtenir une super-résolution et un sous-échantillonnage. Le chapitre 2 définit un modèle général d'acquisition d'images afin de mettre en évidence les deux principales limites de résolution : la limite de diffraction et la limite d'échantillonnage. Il présente également un aperçu des approches possibles, décrites dans la littérature, qui permettent de surmonter, de contourner ou de repousser ces limites. Ensuite, deux méthodes infrarouges point par point bien connues sont utilisées : la thermographie laser Flying Spot (FS) pour le chapitre 3 et la Radiométrie Photothermique par Balayage (SPR) pour le chapitre 4. L'objectif est de sous-échantillonner un objet, c'est-à-dire de ne retenir que quelques points d'une grille classique à échantillonnage régulier, puis de reconstruire une image équivalente à échantillonnage complet. Différentes méthodes de reconstruction sont comparées, avec un intérêt particulier pour le Compressive Sensing (Echantillonnage compressé). Cn paradigme mathématique postule que la plupart des images non bruitées sont très compressibles, en ce sens qu'elles peuvent être exprimées avec beaucoup moins de données grâce à une base adaptée. Dans les deux cas, une réduction d'au moins 80 % du nombre d'échantillons a été obtenue. Puis, au chapitre 5, la super-résolution est explorée du point de vue de la diffraction et de l'échantillonnage. Ces études ont montré que les applications d'imagerie infrarouge en laboratoire souffrent souvent de la limite d'échantillonnage, ce qui a conduit à l'exploration d'une méthode d'échantillonnage compressif basée sur une généralisation des Single Pixel Camera (Caméra à 1 pixel), dans laquelle chaque pixel est subdivisé grâce à des masques binaires plus petits. Une preuve de concept a été réalisée à l'aide de caméras visibles, ce qui a permis de multiplier par 16 le nombre effectif de pixels, mais de nombreuses limitations doivent encore être surmontées afin d'obtenir des résultats cohérents et reproductibles dans l'infrarouge, ce qui constitue la principale perspective de développement de ce travail.