Soutenances du 08-12-2025

ED Mathématiques et Informatique

• Locomotion, planification de pas et résistance aux chutes des robots humanoïdes via des politiques d'apprentissage par renforcement.

  par Clément GASPARD (LaBRI - Laboratoire Bordelais de Recherche en Informatique)

  Cette soutenance a lieu à 15h30 - Amphithéâtre 2 Bâtiment 2A IUT de Bordeaux - Campus Gradignan 35 rue de Naudet, 33175 GRADIGNAN

  devant le jury composé de

  • Olivier LY - Professeur des universités - Université de Bordeaux - Directeur de these
  • Nicolas MANSARD - Directeur de recherche - LAAS-CNRS - Rapporteur
  • Sao Mai NGUYEN - Associate Professor - ENSTA - Rapporteur
  • Jacky BALTES - Full professor - National Taiwan Normal University (NTNU) - Examinateur

  Résumé

  La thèse « Locomotion, planification de pas et résistance aux chutes des robots humanoïdes via des politiques d'apprentissage par renforcement » étudie comment doter les robots humanoïdes d'une marche fiable et d'une capacité de relevage rapide après chute, sans recourir à des heuristiques ni à des trajectoires préprogrammées. Elle s'inscrit dans un défi central de l'autonomie robotique : permettre à des robots réels d'agir de façon robuste dans des environnements incertains et riches en contacts, tout en respectant les contraintes du calcul embarqué. Les approches purement basées sur des modèles montrent leurs limites d'adaptation, tandis que l'apprentissage par renforcement profond (DRL) promet des comportements généralisables appris à partir de données. La problématique est donc : comment concevoir des politiques DRL à la fois légères en calcul, transférables de la simulation au robot réel, et intégrables dans les piles de locomotion standard ? Méthodologiquement, la thèse établit les bases de l'apprentissage par renforcement appliqué à la robotique, puis propose deux contributions principales entraînées en simulation avec randomisation de domaines et validées sur des humanoïdes de petite taille. FootstepNet est un planificateur de pas acteur-critique efficace, capable de produire des placements de pas continus tout en anticipant le nombre de pas nécessaires pour atteindre plusieurs objectifs locaux ; il supprime la dépendance aux ensembles de pas discrets et aux heuristiques, fonctionne en inférence embarquée et égale ou dépasse la qualité des planifications d'ARA*, pour un coût de calcul bien moindre, avec une validation en simulation et sur robot réel lors de la RoboCup 2023. FRASA, quant à lui, est un agent unifié de rattrapage et de relevage : une seule politique transforme des observations proprioceptives en commandes moteurs permettant d'établir des contacts stabilisateurs avant de se relever. Exploitant l'algorithme Cross-Q et la symétrie du robot, FRASA réduit l'entraînement à environ 30 minutes et se transfère zero-shot sur le robot réel, surpassant une référence à base de trajectoires préprogrammées et gérant une grande variété de postures initiales. En conclusion, ces travaux montrent que des politiques DRL légères, modulaires et sûres peuvent être rendues pratiques pour le contrôle embarqué des humanoïdes, réduisant significativement les temps d'indisponibilité après perturbation et ouvrant la voie à une autonomie plus générale et robuste en conditions réelles.

• Apport de l'apprentissage profond pour l'évaluation numérique de la dosimétrie en électroporation

  par Kylian DESIER (IMB - Institut de Mathématiques de Bordeaux)

  Cette soutenance a lieu à 13h30 - Salle de conférence 351 cours de la Libération Bâtiment A33 33400 Talence

  devant le jury composé de

  • Baudouin DENIS DE SENNEVILLE - Directeur de recherche - Institut de Mathématiques de Bordeaux - Centre National de la Recherche Scientifique - Directeur de these
  • Jing-Rebecca LI - Directrice de recherche - Unité de Mathématiques Appliquées (UMA) - Inria Saclay - Rapporteur
  • Abdallah EL HAMIDI - Maître de conférences - Laboratoire des Sciences de l'Ingénieur pour l'Environnement (LaSIE) - La Rochelle Université - Rapporteur
  • Damien VOYER - Maître de conférences - Laboratoire LERPA - EIGSI - Examinateur
  • Lisl WEYNANS - Professeure des universités - Institut de Mathématiques de Bordeaux - Université de Bordeaux - Examinateur
  • Clair POIGNARD - Directeur de recherche - Inria Rennes - CoDirecteur de these

  Résumé

  Les thérapies par électroporation constituent une voie prometteuse pour le traitement des tumeurs profondes, notamment du foie, du pancréas ou du rein. Cette approche repose sur l'application d'impulsions électriques de forte intensité et de très courte durée, modifiant la perméabilité des membranes cellulaires. Selon les paramètres, ces impulsions peuvent induire une électroporation réversible, facilitant la pénétration intracellulaire de molécules (électrochimiothérapies), ou irréversible, entraînant la destruction ciblée des cellules sans effet thermique notable. L'électroporation irréversible (IRE) est ainsi une technique d'ablation non thermique capable d'éliminer sélectivement les cellules tumorales tout en préservant les structures anatomiques voisines. Pour certaines tumeurs profondes, elle constitue la seule alternative curative là où la chimiothérapie reste palliative. Malgré ses atouts, la diffusion clinique de l'IRE demeure limitée par les difficultés de planification. La distribution du champ électrique dépend de nombreux facteurs (paramètres physiques, propriétés tissulaires, géométrie anatomique) dont la maîtrise conditionne l'efficacité et la sécurité du traitement. La modélisation numérique du phénomène, décrite par les équations de Maxwell en régime quasi statique, est essentielle pour prédire le champ électrique et définir les zones d'ablation. Cependant, la résolution tridimensionnelle de ces équations sur des maillages fins reste coûteuse en temps de calcul. Les approches classiques, comme les différences finies ou les éléments finis, se heurtent aux contraintes cliniques, où les simulations doivent être disponibles en quelques minutes sur des stations standard. Dans ce contexte, cette thèse, à la croisée des mathématiques appliquées, de la modélisation numérique et de l'intelligence artificielle, vise à concevoir des modèles conciliant rigueur physique, précision numérique et rapidité d'exécution, afin de rendre la planification de l'IRE compatible avec un usage hospitalier. La première partie explore le potentiel des méthodes d'apprentissage profond pour la résolution d'équations aux dérivées partielles (EDP). Un état de l'art présente les principales approches, leurs fondements, forces, limites et conditions d'application en physique computationnelle. La deuxième partie introduit un modèle de réseau de neurones appliqué à l'équation décrivant la propagation du champ électrique lors d'une procédure d'électroporation. Elle détaille le protocole d'apprentissage, les données, les critères d'évaluation et la comparaison avec les solutions de référence. La troisième partie, contribution principale, développe un modèle hybride original associant apprentissage profond et schéma numérique itératif. Le réseau neuronal fournit une estimation rapide du champ électrique, ensuite affinée par un solveur physique garantissant la cohérence avec les lois de l'électrostatique. Cette approche combine la vitesse du modèle neuronal à la précision du calcul. Enfin, la quatrième partie présente l'intégration de cette méthode dans un outil logiciel complet, testé sur des données cliniques issues de cas d'IRE. Les résultats confirment la faisabilité et la robustesse du modèle, avec une précision comparable aux méthodes standards mais pour un temps de calcul divisé par dix. Ces performances permettent des calculs de dosimétrie en quelques dizaines de secondes sur un ordinateur conventionnel, ouvrant la voie à une planification thérapeutique personnalisée et interactive. En conclusion, cette recherche démontre le potentiel de l'intelligence artificielle, et plus particulièrement de l'apprentissage profond, pour accélérer et fiabiliser la simulation numérique en radiologie interventionnelle. Elle annonce l'émergence d'outils de planification rapides, précis et cohérents, capables de transformer la pratique clinique des thérapies par électroporation et, plus largement, des traitements interventionnels guidés par l'image.

ED Sciences Chimiques

• Déconstruction et fonctionnalisation du polyéthylène par C-H activation radicalaire.

  par Lucile CLUZEAU (Institut des Sciences Moléculaires)

  Cette soutenance a lieu à 9h30 - Salle de conférence Bâtiment A12, Université de Bordeaux, 351 Cr de la Libération, 33405 Talence

  devant le jury composé de

  • Yannick LANDAIS - Professeur des universités - Université de Bordeaux - Directeur de these
  • Daniel TATON - Professeur des universités - Université de Bordeaux - CoDirecteur de these
  • Stéphane GASTALDI - Directeur de recherche - CNRS - Examinateur
  • Emmanuel BEYOU - Professeur des universités - Université Claude Bernard Lyon 1 - Rapporteur
  • Isabelle DEZ - Professeure des universités - Université de Caen - Rapporteur

  Résumé

  Le polyéthylène (PE), polymère synthétique le plus produit au monde, se distingue par son exceptionnelle durabilité mais demeure notoirement récalcitrant à toute modification chimique ou opération de surcyclage, en raison de l'inertie de son squelette constitué uniquement de liaisons carbone–carbone. Dans ce travail, nous avons développé une plateforme générale, sans métal, permettant la fonctionnalisation directe des liaisons C-H du PE, offrant une sélectivité modulable par l'oxygène et conduisant, selon les conditions, à des polymères fonctionnalisés en oxime ou en cétone. Cette approche opère à la fois : (i) en solution, sous irradiation visible en présence d'un photosensibilisateur, et (ii) en phase fondue, dans une extrudeuse bi-vis en régime thermiquement activé, démontrant ainsi sa compatibilité avec des conditions à la fois de laboratoire et industrielles. L'agent clé de cette stratégie est le nitrite de tert-butyle (t-BuONO), qui génère, sous irradiation visible, un radical alkoxy transitoire jouant le rôle d'agent d'abstraction d'hydrogène, et un radical nitrosyle persistant responsable de l'introduction sélective des fonctions oximes. Des études mécanistiques approfondies, incluant la détermination du rendement quantique et la spectroscopie d'absorption transitoire résolue en temps, ont permis d'élucider le mécanisme d'activation par transfert d'énergie du t-BuONO et d'identifier la voie radicalaire responsable de l'activation C-H. De plus, les groupes oximes introduits ne constituent pas des motifs terminaux, mais des intermédiaires polyvalents pouvant être dérivés en esters, éthers ou uréthanes, ouvrant la voie à un ajustement fin de la polarité de surface et des propriétés thermomécaniques du polymère.

• Ingénierie de la Chiralité de Surfaces Électrochimiques pour la Conversion d'énergie et la Synthèse Asymétrique

  par Zikkawas PASOM (Institut des Sciences Moléculaires)

  Cette soutenance a lieu à 14h00 - Salle E136 Vidyasirimedhi Institute of Science and Technology (VISTEC), 555 Moo 1 Payupnai, Wangchan District, Rayong, THAILAND 21210

  devant le jury composé de

  • Alexander KUHN - Professor - Université de Bordeaux - Directeur de these
  • Jeanne CRASSOUS - Directrice de recherche - CNRS Rennes - Rapporteur
  • Hiroshi YAMAMOTO - Professor - Institute for Molecular Science - Rapporteur
  • Supawadee NAMUANGRUK - Directrice de recherche - National Nanotechnology Center - Examinateur
  • Chularat WATTANAKIT - Associate Professor - Vidyasirimedhi Institute of Science and Technology - CoDirecteur de these

  Résumé

  L'ingénierie des surfaces électrochimiques est un concept puissant pour relever des défis critiques comme l'énergie propre. La demande mondiale en composés chiraux énantiopurs continue de croître, ce qui met en évidence un besoin de méthodes de synthèse asymétrique plus sélectives. Pour répondre à ce besoin, notre recherche présente la conception de matériaux mésoporeux à empreinte chirale. Nous avons fabriqué ces matériaux avec diverses compositions, mais l'approche a dépendu de l'électrodéposition. La première partie de cette thèse se concentre sur le développement d'une nouvelle voie de synthèse pour les métaux à encodage chiral. Nous démontrons l'élaboration de ces matériaux en utilisant le dépôt sans courant. Des films métalliques non nobles homogènes, avec des sites de reconnaissance chirale, ont été générés sur un support en mousse de nickel. Les électrodes ont démontré une efficacité catalytique significative pour l'électrosynthèse asymétrique de produits chiraux, atteignant un excès énantiomérique (e.e.) élevé de jusqu'à 85 %. Ces résultats prometteurs fournissent des connaissances fondamentales pour les recherches futures, notamment l'optimisation des paramètres de dépôt pour améliorer la reproductibilité et la stabilité de ces catalyseurs. La deuxième partie de cette thèse étend l'application de ces matériaux à l'ORR (réaction de réduction de l'oxygène), un processus critique dans les piles à combustible. Nous tirons profit de l'effet de sélectivité de spin induit par chiralité (CISS), qui permet une catalyse contrôlée par le spin. Nous avons utilisé des alliages de platine-iridium (Pt-Ir) mésoporeux à encodage chiral comme électrocatalyseurs. Ces matériaux ont été générés par électrodéposition de sels métalliques en présence de gabarits chiraux. Ils ont maintenu leur caractère chiral après le retrait du gabarit. Les investigations électrochimiques démontrent une amélioration significative de l'activité ORR sur ces surfaces chirales, révélant des intensités de courant accrues par rapport aux analogues achiraux et aux électrodes imprimées avec des énantiomères de chiralité opposée. Ce travail introduit un nouveau paradigme pour la conception de catalyseurs ORR. Enfin, nous illustrons une application supplémentaire de l'effet CISS à l'électrochimiluminescence (ECL), une technique analytique qui génère de la lumière. Nous proposons une approche qui intègre des architectures métalliques mésoporeuses chirales avec des propriétés de sélectivité de spin pour améliorer la sensibilité de l'ECL. Ce chapitre introduit une approche d'ECL sélective de spin en intégrant l'effet de filtrage de spin des électrodes en nickel à empreinte chirale sur l'ORR avec l'émission ECL de L-012, un dérivé du luminol. Nous démontrons que l'impression de l'électrode avec un énantiomère spécifique favorise l'émission ECL de L-012. Ce processus a été démontré en utilisant les deux énantiomères de l'acide mandélique et du phényl éthanol. Nous avons également exploré l'électrochimie sans fil en intégrant nos électrodes dans une configuration bipolaire. Ce travail est la première investigation de matériaux améliorés par CISS pour amplifier les signaux ECL. En résumé, cette thèse présente une approche globale de l'ingénierie des surfaces électrochimiques chirales en développant de nouvelles méthodes de synthèse et en démontrant leur utilité. Nous avons amélioré la synthèse asymétrique et les processus de conversion d'énergie. L'application de l'effet CISS a boosté l'efficacité de l'ORR et de l'ECL. Les découvertes fournissent des connaissances fondamentales pour la recherche future en matériaux, en catalyse et en électrochimie contrôlée par le spin.

• Fluoration topotactique de siliciures ternaires équiatomiques : synthèse, caractéristiques structurales et propriétés électroniques

  par Thanh Hung Thinh TRUONG (ICMCB - Institut de Chimie de la Matière Condensée de Bordeaux)

  Cette soutenance a lieu à 14h00 - Amphithéâtre ICMCB, 87 Avenue du Dr Albert Schweitzer, 33600 Pessac

  devant le jury composé de

  • Sophie TENCE - Chargée de recherche - Institut de Chimie de la Matière Condensée de Bordeaux - Directeur de these
  • Pierric LEMOINE - Professeur des universités - Université de Lorraine - Rapporteur
  • Katia GUERIN ARAUJO DA SILVA - Professeure des universités - Institut de chimie de Clermont Ferrand - Rapporteur
  • Jérôme LHOSTE - Maître de conférences - Institut des Molécules et Matériaux du Mans - Examinateur
  • Cyril AYMONIER - Directeur de recherche - Institut de Chimie de la Matière Condensée de Bordeaux - Examinateur

  Résumé

  Ce travail de thèse a porté sur l'étude de l'insertion topotactique de ions fluorures dans des composés intermétalliques ternaires de type 111, en particulier ceux adoptant deux types de structures 2D en feuillets : type CeFeSi (P4/nmm) et type CeScSi (I4/mmm). Pour la famille de type CeFeSi, les fluorations ont été réalisées sur LaRuSi et CeRuSi en utilisant une synthèse dynamique sous flux continu de C4F8. Dans presque toutes les conditions expérimentales étudiées, l'incorporation du fluor dans le réseau cristallin est presque identique pour les deux systèmes, avec des teneurs moyennes d'environ 0,5 pour les composés à base de La et 0,6 pour ceux à base de Ce, ce qui conduit à la formation d'une surstructure caractérisée par un doublement du paramètre c. Une légère distorsion du plan de base ab, entraînant une réduction de symétrie de P4/nmm (tétragonal) vers Pmmn (légèrement orthorhombique), conduit à une organisation ordonnée des ions fluorure sur des sites tétraédriques alternés (occupés et vacants) au sein d'un même feuillet ionique. Ceci induit des modifications structurelles significatives dans les blocs [RuSi]p⁻, stabilisant ainsi deux environnements tétraédriques RuSi4 distincts. Dans les composés à base de Ce, des défauts d'empilement associés à des occupations variables du fluor sur les sites tétraédriques sont détectés par microscopie électronique en transmission à haute résolution (HRTEM) et modélisés à l'aide du programme FAULTS. Sur le plan magnétique, LaRuSiFx présente un comportement de type Curie–Weiss à haute température, accompagné d'un caractère métallique, contrairement au paramagnétisme de Pauli observé pour le siliciure LaRuSi non fluoré. Les phases CeRuSiFx montrent une réponse magnétique similaire à haute température ; cependant, à basse température, une anomalie de Schottky (Ce/La), en compétition avec un ordre magnétique du Ce. Dans une seconde partie, la fluoration topotactique a été étendue au composé LaScSi (structure de type CeScSi), qui présente deux environnements interstitiels distincts : tétraédrique La4 et octaédrique Sc4La2. Trois stratégies de synthèse ont été employées : la fluoration dynamique sous flux continu de C4F8, la fluoration statique sous atmosphère de C4F8, et une nouvelle fluoration par voie solide–solide utilisant un oligomère à base de (VDF-TFE). Dans tous les cas, l'ion fluorure est inséré exclusivement dans les sites tétraédriques La4. Pour les voies à base de C4F8, la co-insertion d'autres éléments légers tels que H et O a été systématiquement observée, en raison de la dissociation de l'eau pendant la réaction, conduisant à des teneurs en fluor relativement faibles (≈ 0,09 – 0,14) dans tous les échantillons recuits. Notamment, dans des conditions statiques, une phase métastable fortement fluorée (F ≈ 0,42) est détectée ; cependant, celle-ci se décompose pendant le recuit, libérant du fluor et donc stabilisant des lacunes anioniques dans les sites tétraédriques. Enfin, une voie nouvelle et originale de fluoration par voie solide–solide a été développée en utilisant un oligomère à base de (VDF–TFE). Cette approche permet d'accéder à l'occupation complète du site tétraédrique par le fluor, conduisant à une phase hydrure–fluorure inédite, LaScSiH0.5F1.0, caractérisée par un paramètre c exceptionnellement dilaté.

ED Droit

• Les valeurs sociales pénales

  par Julie VAURET (INSTITUT DE SCIENCES CRIMINELLES ET DE LA JUSTICE)

  Cette soutenance a lieu à 14h00 - 1K Pôle juridique et judiciaire de l'université de Bordeaux 35, place Pey-Berland 33000 Bordeaux

  devant le jury composé de

  • Jean-Christophe SAINT-PAU - Professeur agrégé - Université de Bordeaux - Directeur de these
  • François ROUSSEAU - Professeur agrégé - Université de Nantes - Rapporteur
  • Xavier PIN - Professeur agrégé - Université Jean Moulin Lyon 3 - Rapporteur
  • Agathe LEPAGE - Professeure agrégée - Université Paris-Panthéon-Assas - Examinateur
  • Maxime BRENAUT - Professeur agrégé - Université de Bordeaux - Examinateur
  • Bertrand DE LAMY - Professeur agrégé - Université de Toulouse - Examinateur

  Résumé

  Les valeurs sociales pénales se présentent classiquement comme l'objet de protection du droit pénal dont elles forment tout à la fois le fondement et les limites ; elles légitiment l'incrimination et la peine en même temps qu'elles en encadrent le champ d'application. Cette position singulière conduit les auteurs à envisager les valeurs à partir des fonctions qu'elles sont susceptibles d'assurer tant dans l'élaboration de la loi pénale par le législateur que dans son application par le juge. Une telle approche fait de la valeur une notion fonctionnelle dont le contenu subordonné à l'application qui en est faite ne peut que rester largement indéterminé. L'incertitude qui caractérise le contenu des valeurs est pourtant à l'origine de la plupart des obstacles qui s'opposent à ce qu'elles jouent pleinement le rôle qui leur est par ailleurs prêté. Or, si leur place au sein de la théorie de l'infraction a été analysée et critiquée, leur contenu doit lui aussi pouvoir être discuté au titre d'une théorie générale qui leur est spécifique. Envisagées pour elles-mêmes, les valeurs peuvent être abstraitement définies autour d'une structure et d'un contenu qui en déterminent les fonctions et la façon dont celles-ci sont susceptibles de s'exercer. Se dégage ainsi un système de valeurs articulées selon une logique et des principes précis leur permettant de devenir une clé de compréhension du droit pénal. Elles n'en forment plus seulement le fondement et les limites, elles participent à en garantir la cohérence et l'équilibre. Avec les valeurs, c'est finalement plus largement l'ordre public pénal qui apparaît, dans ce qui fait sa singularité et sa complexité.

ED Entreprise Economie Société

• INFLUENCE DES FACTEURS SOCIODEMOGRAPHIQUES DANS L'EVALUATION DES ATTRIBUTS DU VIN EN CONTEXTE CULTUREL COLLECTIVISTE : Cas du vin de Bordeaux au Cameroun, en Côte d'ivoire, au Nigeria et au Kenya

  par Mathieu NLEND MOMNOUGUI (IRGO - Institut de Recherche en Gestion des Organisations)

  Cette soutenance a lieu à 9h30 - c 107 IAE - Ecole Universitaire de Management IRGO 35 avenue Abadie - CS 51412 Bat C 33072 Bordeaux Cedex

  devant le jury composé de

  • Franck DUQUESNOIS - Maître de conférences - Université de Bordeaux - Directeur de these
  • Jean-Philippe GALAN - Professeur des universités - Université de Bordeaux IAE - Ecole Universitaire de Management - CoDirecteur de these
  • Mbaye Fall DIALLO - Professeur des universités - IAE - Université de Lille - Rapporteur
  • Foued CHERIET - Professeur des universités - Institut Agro Montpellier - Rapporteur
  • Franck CELHAY - Professeur - Montpellier business school - Examinateur
  • Catherine VIOT - Professeure des universités - IAE - Université de Bordeaux - Examinateur

  Résumé

  Le marketing international est depuis plusieurs décennies confronté à la problématique de l'influence de la culture sur la perception des consommateurs. De nombreuses recherches dans le domaine se sont intéressées à ce sujet et c'est la théorie des dimensions culturelles nationales de Hofstede qui a été la plus utilisée sur cette question. Ce travail analyse l'influence des facteurs sociodémographiques sur la sensibilité des consommateurs aux attributs du vin de Bordeaux en contexte africain (Cameroun, Côte d'Ivoire, Kenya, Nigéria) dominé par le collectivisme, la distance hiérarchique élevée et l'orientation à court terme. Une approche Best Worst Scale a été utilisée pour cette recherche. Les résultats issus de l'analyse des données d'une expérience réalisée sur 813 sujets indiquent que la structuration des préférences en contexte africain s'organise principalement autour de la réduction du risque perçu par des signaux relationnels et expérientiels. Le prix exerce un effet important mais contextuel, indexé sur l'occasion d'achat (convivialité entre amis contre événement plus formel), tandis que les codes plus techniques du produit voient leur influence s'accroître principalement chez des segments plus impliqués et à revenu supérieur.

ED Sciences de la Vie et de la Santé

• Décryptage de l'empreinte métabolique des baies de raisin sous température élevée

  par Xi ZHAN (Ecophysiologie et Génomique Fonctionnelle de la Vigne)

  Cette soutenance a lieu à 14h00 - Amphithéâtre de l'ISVV 210 Chemin de Leysotte, 33140 Villenave-d'Ornon

  devant le jury composé de

  • David LECOURIEUX - Maître de conférences - Université de Bordeaux - Directeur de these
  • Marielle ADRIAN - Professeure - Université de Bourgogne Europe - Rapporteur
  • Nathalie GAVEAU - Professeure - Université de Reims Champagne-Ardenne - Rapporteur
  • Bertrand GAKIèRE - Maître de conférences - Université de Paris-Saclay - Examinateur
  • Kentaro MORI - Maître de conférences - Université de Bordeaux - Examinateur
  • Marie-France CORIO-COSTET - Directrice de recherche - INRAE Nouvelle-Aquitaine Bordeaux - Examinateur

  Résumé

  Ce travail, mené au sein de l'UMR EGFV (équipe QualyGrapE), vise à élucider les ajustements métaboliques permettant aux baies de répondre aux températures élevées (HT). Initialement centré sur l'équilibre rédox des baies soumis à la chaleur, l'étude a été ensuite réorientée vers une caractérisation métabolique plus large, en raison à la fois de limitations techniques liées aux dosages enzymatiques sur baie et de la complexité inhérente à la caractérisation fonctionnelle des gènes chez la vigne. Ces contraintes expérimentales ont toutefois ouvert une perspective plus intégrative pour mon projet de thèse : puisque les métabolites constituent le lien entre le génotype et le phénotype, ils déterminent non seulement des attributs qualitatifs du raisin tels que la couleur, la saveur et l'arôme, mais jouent également un rôle direct dans la perception du stress, la signalisation et la défense. Par conséquent, le profilage métabolique s'est imposé comme une approche puissante et biologiquement pertinente pour étudier la manière dont les baies de raisin remodèlent leur métabolisme sous HT. La recherche s'articule autour de trois volets principaux. Le premier compare le Cabernet-Sauvignon et le Merlot, deux cultivars différant par leur sensibilité présumée à la chaleur, avec un accent particulier sur la composition en polyphénols. Grâce à des analyses ciblées par LC-MS effectuées à différents stades de développement et sous conditions contrôlées, nous avons établi un profil polyphénolique détaillé des deux cultivars en fonction de la durée d'exposition à la chaleur. Le deuxième volet élargit cette comparaison à l'aide d'approches métabolomiques non ciblées par LC-MS et ciblées par GC-MS, permettant de couvrir un large éventail de métabolites primaires et secondaires et d'identifier des marqueurs métaboliques robustes associés à l'exposition thermique. Enfin, l'étude explore de manière préliminaire la caractérisation fonctionnelle d'un gène de peroxydase potentiellement impliqué dans la régulation du rédox et la dégradation des anthocyanes sous HT. Une stratégie basée sur le système CRISPR-Cas9 a été développée afin de générer des lignées microvigne transgéniques stables pour la validation fonctionnelle. Dans l'ensemble, nos résultats apportent de nouvelles perspectives sur le remodelage métabolique des baies de raisin en réponse aux températures élevées et mettent en évidence à la fois des réponses communes et dépendantes du cultivar. Les marqueurs métaboliques identifiés constituent des pistes prometteuses pour le développement de stratégies viticoles et de programmes d'amélioration visant à renforcer la tolérance à la chaleur chez la vigne.

ED Sciences Physiques et de l'Ingénieur

• Etude de l'équation d'état du bore et du nitrure de bore à très haute pression par ondes de choc produites par laser

  par Diluka SINGAPPULI HEWAGE (Centre Lasers Intenses et Applications)

  Cette soutenance a lieu à 10h00 - Amphithéâtre G Campus Peixotto Bâtiment A29 RDC 351 Cr de la Libération, 33400 Talence

  devant le jury composé de

  • Dimitri BATANI - Professeur des universités - Université de Bordeaux - Directeur de these
  • Alessandra BENUZZI-MOUNAIX - Directrice de recherche - LULI, École Polytechnique, CNRS, CEA, UPMC - Rapporteur
  • Michel BOUSTIE - Directeur de recherche - CNRS Institut Pprime ISAE ENSMA, Futuroscope - Rapporteur
  • Norimasa OZAKI - Associate Professor - Graduate School of Engineering, Osaka University - Examinateur
  • Stéphanie BRYGOO - Ingénieure chercheur - Commissariat a l'Energie Atomique - Examinateur
  • Guillaume BOUTOUX - Ingénieur chercheur - CEA, DAM, DIF - Examinateur
  • Emmanuel D'HUMIèRES - Professeur - Université de Bordeaux, CNRS, CEA, CELIA (Centre Lasers Intenses et Applications), UMR 5107 - Examinateur

  Résumé

  Le bore et ses composés présentent un intérêt scientifique majeur en astrophysique et en fusion par confinement inertiel (FCI). L'abondance du bore constitue une sonde puissante pour tester les modèles de nucléosynthèse cosmologique, tandis que des matériaux tels que le carbure de bore (B4C) et le nitrure de bore (BN) sont envisagés comme ablateurs alternatifs pour améliorer le rendement de la FCI. La connaissance précise de leurs équations d'état (EOS) est déterminante pour prédire le comportement des matériaux en conditions extrêmes. Or, les données expérimentales d'EOS disponibles au-delà du mégabar (> 100 GPa) restent très limitées, ce qui freine la validation des modèles théoriques. Ces recherches s'inscrivent dans le cadre plus large de la physique de la Warm Dense Matter (WDM), un régime intermédiaire entre solide condensé et plasma, caractérisé par des densités proches de l'état solide et des températures de l'ordre de quelques eV. Ce domaine, crucial pour la compréhension des intérieurs planétaires et des plasmas de fusion, demeure particulièrement difficile à modéliser, soulignant la nécessité de nouvelles contraintes expérimentales. Dans ce contexte, cette thèse a porté sur l'étude de l'équation d'état du nitrure de bore en phase hexagonal et cubique à très haute pression. Des expériences ont été menées sur de grandes installations laser européennes (PALS, ELI-Beamlines) et internationales (SGIII-P, GEKKO XII), en s'appuyant sur les diagnostics optiques VISAR et SOP. Les résultats expérimentaux ont été confrontés à des simulations ab initio (DFT-MD), à des modèles semi-empiriques (FEOS) et à des calculs hydrodynamiques. En parallèle, des expériences de compression dynamique de l'eau pré-comprimée ont permis d'approcher sa courbe froide, établissant un lien direct avec la modélisation des intérieurs planétaires et offrant une nouvelle voie pour sonder le régime WDM. Ces travaux expérimentaux enrichissent la base de données d'EOS du nitrure de bore et de l'eau dense, et fournissent de nouvelles contraintes essentielles pour la modélisation de la matière dense chaude, avec des avancées en astrophysique et pour le développement de la fusion par confinement inertiel.

ED Sciences et environnements

• Assimilation de données satellitaires du trait de côte pour la modélisation des évolutions des littoraux sableux

  par Georgios AZORAKOS (Environnements et Paléoenvironnements Océaniques et Continentaux)

  Cette soutenance a lieu à 14h00 - PABA RDC bâtiment B5, 33600 Pessac

  devant le jury composé de

  • Bruno CASTELLE - Directeur de recherche - Université de Bordeaux - Directeur de these
  • Marissa YATES - Chargée de recherche - Ecole des Ponts / Laboratoire d'Hydraulique Saint-Venant - Rapporteur
  • Rafael ALMAR - Directeur de recherche - Ird - Rapporteur
  • Francesca RIBAS PRATS - Associate Professor - Universitat Politècnica de Catalunya - Examinateur
  • Stéphane BERTIN - Chargé de recherche - CNRS - Examinateur
  • Didier SWINGEDOUW - Directeur de recherche - UMR CNRS 5805 EPOC - OASU - Université de Bordeaux - Examinateur
  • Déborah DIDIER - Directrice de recherche - BRGM - CoDirecteur de these

  Résumé

  Cette thèse aborde le défi majeur que représente la modélisation et la prévision de l'évolution future des plages sableuses. Les modèles traditionnels de variation du trait de côte nécessitent de nombreuses données in situ pour être calibrés et sont donc limités à quelques sites bien instrumentés dans le monde. Pour surmonter cette limitation, ce travail explore l'utilisation d'images satellites optiques, disponibles à l'échelle mondiale, comme source d'observations du trait de côte afin de calibrer des modèles d'équilibre du trait de côte sur des sites dominés par le transport sédimentaire transversal. L'étude se concentre sur la plage de Truc Vert, dans le sud-ouest de la France, où des travaux antérieurs ont montré de bonnes performances de modélisation sur des échelles de temps allant de la tempête ponctuelle à plusieurs décennies. Un jeu de données de 11 ans (2009–2020) de lignes d'eau issues de l'imagerie satellite a été transformé en traits de côte dérivés de satellites (SDS), avec différentes corrections du niveau d'eau et différentes longueurs de lissage longitudinal. Les résultats montrent que les données SDS permettent de calibrer les modèles de trait de côte avec une performance comparable à celle des données in situ traditionnelles, et que le lissage le long du rivage est la seule étape de traitement réellement nécessaire, tandis que les autres corrections spécifiques au site apportent peu d'améliorations. Sur cette base, un filtre de Kalman d'ensemble à double estimation (états et paramètres libres) a été mis en œuvre pour suivre la variabilité temporelle des paramètres de modèle sur trois sites le long de la côte ouest de l'Europe. Bien que l'introduction de paramètres non stationnaires n'ait pas systématiquement surpassé les modèles stationnaires bien calibrés, les étapes de correction du filtre ont nettement amélioré les performances, montrant le potentiel de cette approche pour l'assimilation de données en temps réel. Les résultats suggèrent que la variabilité des paramètres pourrait refléter des processus non résolus et que l'intégration de paramètres variables contrôlés par le climat pourrait améliorer la prévision d'événements extrêmes sur des sites à forte saisonnalité, ainsi que les performances dans des environnements soumis à des climats de vagues multimodaux complexes. Cette thèse aboutit au développement d'un nouveau cadre d'assimilation de données dans le modèle LX-Shore, combinant une calibration par recuit simulé et l'assimilation de données incertaines de trait de côte dérivées de satellites. Ce cadre permet d'intégrer des conditions aux limites du trait de côte aux embouchures et aux estuaires, d'identifier les principales sources d'erreurs du modèle, et d'améliorer les prévisions du trait de côte tout en tenant compte des incertitudes des données. Globalement, ce travail démontre la faisabilité et le potentiel de l'intégration de la télédétection et de l'assimilation de données pour produire une modélisation robuste et évolutive de l'évolution du trait de côte dans les zones côtières peu instrumentées à travers le monde.

ED Sociétés, Politique, Santé Publique

• Raisonnement à partir de données cliniques imparfaites et temporelles : approches logiques pour le phénotypage et l'inférence d'évènements médicaux

  par Kokou AWUKLU (Bordeaux Population Health Research Center)

  Cette soutenance a lieu à 14h00 - Amphithéâtre du LaBRI Domaine universitaire, 351 cours de la Libération, 33405 Talence

  devant le jury composé de

  • Fleur MOUGIN - Professeure des universités - Université de Bordeaux - CoDirecteur de these
  • Stefan SCHULZ - Full professor - Université de Graz - Rapporteur
  • Adrien COULET - Chargé de recherche - Inria Paris - Rapporteur
  • Meghyn BIENVENU - Directrice de recherche - Université de Bordeaux - CoDirecteur de these
  • Maria Vanina MARTINEZ - Chargée de recherche - Université autonome de Barcelone - Examinateur
  • Michael SIOUTIS - Professeur - Université de Montpellier - Examinateur
  • Pascal STACCINI - Professeur des universités - praticien hospitalier - Université Côte d'Azur - Examinateur

  Résumé

  L'adoption du dossier patient informatisé a considérablement amélioré l'accès à de vastes volumes de données cliniques. Si cet accès constitue une ressource précieuse pour les soins comme pour la recherche, il soulève néanmoins de nouveaux défis liés à la complexité des données médicales. Parmi ces défis figurent leur caractère implicite (dont l'interprétation reste difficile sans expertise médicale), leurs imperfections telles que l'incohérence, l'incertitude et l'incomplétude, ainsi que leur dimension temporelle intrinsèque. Cette thèse explore comment des approches fondées sur la logique peuvent remédier à ces difficultés. Dans un premier temps, j'ai étudié une approche ontologique afin d'illustrer l'apport des ontologies dans l'évaluation de la qualité des données médicales, en particulier pour le phénotypage des cancers du poumon. Cette approche a consisté à concevoir une ontologie pour formaliser les connaissances essentielles du domaine et l'exploiter pour interroger l'entrepôt de données de santé du CHU de Bordeaux. Ce travail a permis de mettre en évidence les apports des ontologies pour la représentation des connaissances et la détection d'incohérences, tout en soulignant certaines limites, notamment en ce qui concerne la gestion des incohérences temporelles dans les données de santé. Fort de cette première expérimentation, j'ai ensuite proposé un nouveau framework logique pour l'inférence d'événements cliniques de haut niveau à partir de données temporelles, en cohérence avec le raisonnement et la prise de décision cliniques. Ce framework définit des règles logiques exprimant les conditions d'existence d'un événement à un instant donné, ainsi que, de façon optionnelle, des conditions de terminaison signalant sa fin potentielle. Deux méthodes d'agrégation permettent ensuite de construire des intervalles d'événements à partir de ces conditions. Le formalisme introduit également la notion de méta-événements, obtenus par combinaison ou généralisation d'autres événements, et intègre des niveaux de confiance ainsi qu'un mécanisme de réparation pour traiter les imperfections inhérentes à la détection des événements. Pour valider l'intérêt de ce framework, j'ai implémenté ses composants principaux en Answer Set Programming. Le système obtenu, CASPER, a été évalué sur deux cas d'usage médicaux, démontrant à la fois sa faisabilité computationnelle et sa concordance avec l'avis d'experts médicaux.