Chaque année, l'école doctorale octroie des contrats doctoraux pour deux types de sujets de recherche : les "Jeunes HDR" dirigés par des membres de communauté de recherche récemment habilités à diriger des recherches, et les sujets "au mérite universitaire" proposés par les encadrantes et les encadrants des unités de recherche. Des auditions sont organisées pour les candidats et candidates sélectionnées entre mai et juin.
Pour postuler aux concours de l'école doctorale, les candidats doivent consulter la liste des sujets proposés. Ils et elles doivent choisir un sujet parmi ceux financés par les "Jeunes HDR" et les sujets non financés indiqués comme "Mérite" dans les listes, définir leur directeur ou leur directrice de thèse et leur laboratoire d'accueil. Les candidates et candidats doivent ensuite contacter directement leur laboratoire d'accueil ou le directeur ou la directrice de thèse porteuse du sujet.